Geri Dön

Meme kanserli hastalarda LOT1 geninin araştırılması

Investigation of LOT1 gene in breast cancer

  1. Tez No: 236197
  2. Yazar: SEDA EKİZOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TURGUT ULUTİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Genler, Genler-LOT1, Meme neoplazmları, Mutasyon, Neoplazmlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Genes, Genes-LOT1, Breast neoplasms, Mutation, Neoplasms, Polymerase chain reaction
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Meme kanseri kadınlar arasında görülen en yaygın kanser tipidir ve kansere bağlı ölümlerde, akciğer kanserinden sonra ikinci sırada yer almaktadır. Meme kanser gelişiminde rol oynayan genlerden bir tanesi LOT1 (lost-on-transformation-1) genidir.LOT1 geni insan genomunda kromozom 6q24-25 üzerinde yer alan yaklaşık 70 kb'lık alana yayılmış bir gendir. İnsan LOT1 geni, amino ucunda 7 tane C2H2 tipi çinko parmak motifi, karboksil ucunda ise prolin ve glutaminden zengin alanlar bulunan 463 amino asitlik bir protein kodlar. LOT1 proteininin işlevsel analizi, bu proteinin mitojenik sinyal yolağı üzerinden çoğalmayı baskılayan çekirdeğe ait bir yazılım etmeni olarak görev yaptığını göstermiştir.LOT1 geninin dizi analizi sonucunda birinci eksonda ve promotör bölgede CpG açısından zengin adacıkların var olduğu bulunmuştur. CpG açısından zengin adacıkların olması DNA metillenmesinin LOT1 gen ifadesini sessizleştirmekte yer alabilecek bir mekanizma olduğunu düşündürmüştür.Yaptığımız çalışmada meme kanseri tanısı almış 48 hastadan elde edilen tümör dokusu ve kontrol olarak aynı hastaların normal meme dokusunda LOT1 geninin promotör bölgesindeki metillenme oranı Sodyum Bisülfit Modifikasyonu ve Metillenmeye Özgü Polimeraz Zincir Tepkimesi ile incelendi.Çalışmanın sonucunda 48 tümör dokusundan 32'sinde (%66,6) metillenmenin normal dokuya kıyasla artmış olduğu, 16'sında (%33,4) ise metillenmenin değişmediği tespit edildi. Metillenmedeki artışın özellikle ileri evre meme kanserinde daha belirgin olduğu saptandı. Sonuç olarak meme kanserinde LOT1 geninin sessizleşmesinin promotör bölgesinin aşırı metillenmesi nedeniyle olabileceği gösterildi.

Özet (Çeviri)

Breast cancer is the most common cancer among women. LOT1 (lost-on-transformation-1) gene is one of the genes that takes place in breast cancer development.LOT1 gene is localized at chromosome 6q24-25 and spans at least 70 kb. Human LOT1 encodes a 463 amino acid protein which contains 7 C2H2 type zinc-finger motifs at the amino terminal, as well as proline and glutamine rich areas at the carboxyl terminal. Functional analysis of LOT1 demonstrated that it may play a significant role as transcription factor modulating growth suppression through mitogenic signaling pathways.Genomic analysis of LOT1 gene revealed the presence of a CpG island in exon 1 that extends into the promoter region of the gene. This observation suggested that genomic DNA methylation is a mechanism of silencing the LOT1 gene expression.In this study, we analyzed the methylation profile of the promoter of LOT1 gene in 48 breast cancer tumor tissue samples and their normal tissues by Sodium Bisulphite Modification and Methylation Specific PCR.We found that the methylation of 32 of 48 tumor tissues have increased according to normal tissue samples and 16 of the tumor tissues have remained unmethylated. There was a significant methylation increase in advanced cases. As a result we showed that hypermethylation of promoter region of LOT1 gene causes LOT1 gene silencing in breast cancer.

Benzer Tezler

  1. Tek merkezde izlenen meme kanseri hastalarının adjuvan sistemik tedavi sonuçlarının retrospektif olarak incelenmesi

    Retrospective analysis of adjuvant systemic therapy results in breast cancer patients, single center study

    EDA OTMAN AKAT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    OnkolojiEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDEM GÖKER

  2. Endometrium kanserinde myometrial invazyon paterninin evre ile ilişkisi

    The effect of myometrial invasion pattern to stage in endometrial cancer

    ECE USLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Kadın Hastalıkları ve DoğumEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TUFAN ÖGE

  3. GASTRİK ADENOKARSİNOMLARDA TÜMÖR TOMURCUKLANMASININ LENF NODU METASTAZI VE SAĞKALIM ÜZERİNE PROGNOSTİK ETKİSİ

    GASTRİK ADENOKARSİNOMLARDA TÜMÖR TOMURCUKLANMASININ LENF NODU METASTAZI VE SAĞKALIM ÜZERİNE PROGNOSTİK ETKİSİ

    BUSE UĞURALP

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DAMLANUR SAKIZ

  4. Kanser hastalarında benlik saygısı, başa çıkma tutumları ve sosyodemografik özelliklerin yaşam kalitesi ile ilişkisi

    Quality of life in cancer patients: relationships with self-esteem, coping strategies and sociodemographic characteristics

    YAĞMUR HATİCE KILIÇ YANGIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Aile HekimliğiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMİNE ZEYNEP TUZCULAR VURAL