Geri Dön

Meme kanserli hastalarda LOT1 geninin araştırılması

Investigation of LOT1 gene in breast cancer

  1. Tez No: 236197
  2. Yazar: SEDA EKİZOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TURGUT ULUTİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 92

Özet

Meme kanseri kadınlar arasında görülen en yaygın kanser tipidir ve kansere bağlı ölümlerde, akciğer kanserinden sonra ikinci sırada yer almaktadır. Meme kanser gelişiminde rol oynayan genlerden bir tanesi LOT1 (lost-on-transformation-1) genidir.LOT1 geni insan genomunda kromozom 6q24-25 üzerinde yer alan yaklaşık 70 kb'lık alana yayılmış bir gendir. İnsan LOT1 geni, amino ucunda 7 tane C2H2 tipi çinko parmak motifi, karboksil ucunda ise prolin ve glutaminden zengin alanlar bulunan 463 amino asitlik bir protein kodlar. LOT1 proteininin işlevsel analizi, bu proteinin mitojenik sinyal yolağı üzerinden çoğalmayı baskılayan çekirdeğe ait bir yazılım etmeni olarak görev yaptığını göstermiştir.LOT1 geninin dizi analizi sonucunda birinci eksonda ve promotör bölgede CpG açısından zengin adacıkların var olduğu bulunmuştur. CpG açısından zengin adacıkların olması DNA metillenmesinin LOT1 gen ifadesini sessizleştirmekte yer alabilecek bir mekanizma olduğunu düşündürmüştür.Yaptığımız çalışmada meme kanseri tanısı almış 48 hastadan elde edilen tümör dokusu ve kontrol olarak aynı hastaların normal meme dokusunda LOT1 geninin promotör bölgesindeki metillenme oranı Sodyum Bisülfit Modifikasyonu ve Metillenmeye Özgü Polimeraz Zincir Tepkimesi ile incelendi.Çalışmanın sonucunda 48 tümör dokusundan 32'sinde (%66,6) metillenmenin normal dokuya kıyasla artmış olduğu, 16'sında (%33,4) ise metillenmenin değişmediği tespit edildi. Metillenmedeki artışın özellikle ileri evre meme kanserinde daha belirgin olduğu saptandı. Sonuç olarak meme kanserinde LOT1 geninin sessizleşmesinin promotör bölgesinin aşırı metillenmesi nedeniyle olabileceği gösterildi.

Özet (Çeviri)

Breast cancer is the most common cancer among women. LOT1 (lost-on-transformation-1) gene is one of the genes that takes place in breast cancer development.LOT1 gene is localized at chromosome 6q24-25 and spans at least 70 kb. Human LOT1 encodes a 463 amino acid protein which contains 7 C2H2 type zinc-finger motifs at the amino terminal, as well as proline and glutamine rich areas at the carboxyl terminal. Functional analysis of LOT1 demonstrated that it may play a significant role as transcription factor modulating growth suppression through mitogenic signaling pathways.Genomic analysis of LOT1 gene revealed the presence of a CpG island in exon 1 that extends into the promoter region of the gene. This observation suggested that genomic DNA methylation is a mechanism of silencing the LOT1 gene expression.In this study, we analyzed the methylation profile of the promoter of LOT1 gene in 48 breast cancer tumor tissue samples and their normal tissues by Sodium Bisulphite Modification and Methylation Specific PCR.We found that the methylation of 32 of 48 tumor tissues have increased according to normal tissue samples and 16 of the tumor tissues have remained unmethylated. There was a significant methylation increase in advanced cases. As a result we showed that hypermethylation of promoter region of LOT1 gene causes LOT1 gene silencing in breast cancer.

Benzer Tezler

  1. Meme kanserli hastalarda (İnvaziv duktal karsinom tanılı) aksiller lenf nodu tutulumu ile C-ERB B2 onkogeni arasında ilişki var mı?

    Başlık çevirisi yok

    BÜLENT KARABULUT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Kadın Hastalıkları ve DoğumEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN SARAL

  2. Meme kanserli hastalarda tükrük salgısı ve serumda adenozin deaminaz (ADA) ve süperoksit dismutaz (SOD) düzeylerinin önemi

    Activities of salivary and serum adenosin deaminase (ADA) and superoxide dismutase (SOD) in breast cancer

    TARKAN KARAKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    OnkolojiGazi Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAZAN GÜNEL

  3. Meme kanserli hastalarda meme ve kanser dokularında Wnt 1 gen tayini

    Başlık çevirisi yok

    SEBAHATTİN SOLAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Genel CerrahiAtatürk Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AHMET ABDULHALİK BALIK

  4. Meme kanserli hastalarda serum Beta-Karoten düzeylerinin yüksek basınçlı sıvı kromatografisi (HPLC) ile ölçülmesi

    Measurement of serum Beta-Carotene levels with high performance liquid chromatography in breast cancer

    AFİTAP SARIOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    BiyokimyaGazi Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL TORUN

  5. Meme kanserli hastalarda 6 minute pegboard and ring test desteksiz kol fonksiyonu egzersiz testinin geçerliği ve güvenirliğinin değerlendirilmesi

    Meme kanserli hastalarda 6 minute pegboard and ring test desteksiz kol fonksiyonu egzersiz testinin geçerliği ve güvenirliğinin değerlendirilmesi

    HACER ÖNCÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Fizyoterapi ve RehabilitasyonHacettepe Üniversitesi

    Kalp ve Solunum Fizyoterapisi ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EBRU ÇALIK KÜTÜKCÜ