Cloning of polysome-associated small rnas in Drosophila melanogaster embryos
Drosophila melanogaster embriyolarinda polizomun bir parçası olan küçük rnaların klonlanması
- Tez No: 251091
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 43
Özet
Genom tarafından kodlanan düzenleyici küçük RNA'lar üç gruba ayrılır; mikroRNAlar (miRNA), endojenik küçük RNAlar (endo siRNA), piwi etkileşimli RNAlar (piRNA). 17-21 nükleotitlik mikroRNAlar hedef mRNA ile tam yada tam olmayan baz eşleşmesi yoluyla hedef mRNA'nın parçalanmasına yada translasyonun baskılanmasına sebep olurlar. Endo siRNAların transposon regulasyonunda fonksiyon görebileceği öne sürülmesine rağmen kesin olarak fonksiyonları ve mekanizmaları bulunamamıştır. piwi-etkileşimli RNAlar spermatogenez sırasında transposonların baskılanmasında rol alırlar.Keşfedilmelerine rağmen, düzenleyici RNAların biyolojik rolleri ve fonksiyon mekanizmaları aydınlatılamamıştır. Bu tez çalışmasının amacı Drosophila melanogaster embriyolarında bulunan, polizomun bir parçası olan küçük RNAları ayrıntılı sekans kullanılarak in vivo koşullarda tanımlanması ve translasyonel düzenlemedeki rollerinin araştırılmasıdır. Sekans ve mikroarray sonuçları genom tarafından kodlanan küçük RNAların fraksiyon ve zamana bağlı olarak dağılımını belirlemiştir. Sonuçlar ilginç bir şekilde mRNAların polizomlarda posttranskripsiyonel olarak antisense transkripler tarafından regule edilebileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Genome-encoded regulatory small RNAs are classified into 3 groups; microRNAs (miRNAs), endogeneous small interfering RNAs (endo siRNAs) and piwi interacting RNAs (piRNAs). miRNAs, 17-21 nucleotide in size, are involved in posttranscriptional gene regulation via precise or imprecise base pairing with target mRNAs resulting in either target mRNA degradation or translational inhibition. Endo siRNAs ,on the other hand, may function transposon regulation but their precise regulatory function and mechanism have not been elucidated yet. piRNAs are mainly involved in transposon silencing in spermatogenesis.Despite their discovery, biological roles and modes of functions of small RNAs remain to be elucidated. The aim of this thesis was to identify polysome-associated small RNAs in Drosophila melanogaster embryos by deep sequencing and investigate their role in translational regulation. Deep sequencing and microarray results determined stage and fraction specific distribution of genome encoded small RNAs. Surprisingly, the results implied that mRNAs may be posttranscriptionally regulated by antisense transcripts in polysome.
Benzer Tezler
- Bacillus subtilis'e ait selülaz genlerinin e.coli'de klonlanması
Cloning of Bacillus subtilis cellulase genes in e.coli
BAHRİ DEVRİM ÖZCAN
- Cloning of AtBOR4 gene to Medicago sativa L. (Leguminosa-Fabecea) to generate boron tolerant plant cultivar
AtBOR4 geninin bora karşı dirençli Medicago sativa L. geliştirilmesi amaçlı klonlanması
HÜSEYİN TOMBULOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyolojiFatih ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. M.SERDAL SAKÇALI
YRD. DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ
- Domates fw2.2 verim geninin buğday ortologlarının klonlanması ve önemli buğday çeşitlerinin genomik ve fonksiyonel genomik bazında fw2.2 buğday ortologu ile taranması
Cloning of wheat orthologous of tomato fw2.2 yield gene and genomic and functional genomic analysis of wheat varieties by fw2.2 wheat orthologous
EMRE İLHAN
- Yerel Bacillus izolatlarından alfa amilazların klonlanması ve rekombinant amy28 alfa amilazının enzim özelliklerinin belirlenmesi
Cloning of amylases from local Bacillus isolates and determination of enzyme characteristics of recombinant amy28 alpha amylase
MERVE TUZLAKOĞLU ÖZTÜRK
Doktora
Türkçe
2013
BiyoteknolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SALİHA İŞSEVER ÖZTÜRK
- Presenilin 1 cDNA'sının klonlanması ve ailesel alzheımer hastalığı patogenezinde etkin mutasyonları taşıyan vektörlerin oluşturulması
Cloning of presenilin 1 cDNA and construction of vectors carrying familial alzheimer?s disease causing mutations
DENİZ ŞUMNULU
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
GenetikHaliç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET BAKİ YOKEŞ