Cloning of polysome-associated small rnas in Drosophila melanogaster embryos
Drosophila melanogaster embriyolarinda polizomun bir parçası olan küçük rnaların klonlanması
- Tez No: 251091
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Genom tarafından kodlanan düzenleyici küçük RNA'lar üç gruba ayrılır; mikroRNAlar (miRNA), endojenik küçük RNAlar (endo siRNA), piwi etkileşimli RNAlar (piRNA). 17-21 nükleotitlik mikroRNAlar hedef mRNA ile tam yada tam olmayan baz eşleşmesi yoluyla hedef mRNA'nın parçalanmasına yada translasyonun baskılanmasına sebep olurlar. Endo siRNAların transposon regulasyonunda fonksiyon görebileceği öne sürülmesine rağmen kesin olarak fonksiyonları ve mekanizmaları bulunamamıştır. piwi-etkileşimli RNAlar spermatogenez sırasında transposonların baskılanmasında rol alırlar.Keşfedilmelerine rağmen, düzenleyici RNAların biyolojik rolleri ve fonksiyon mekanizmaları aydınlatılamamıştır. Bu tez çalışmasının amacı Drosophila melanogaster embriyolarında bulunan, polizomun bir parçası olan küçük RNAları ayrıntılı sekans kullanılarak in vivo koşullarda tanımlanması ve translasyonel düzenlemedeki rollerinin araştırılmasıdır. Sekans ve mikroarray sonuçları genom tarafından kodlanan küçük RNAların fraksiyon ve zamana bağlı olarak dağılımını belirlemiştir. Sonuçlar ilginç bir şekilde mRNAların polizomlarda posttranskripsiyonel olarak antisense transkripler tarafından regule edilebileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Genome-encoded regulatory small RNAs are classified into 3 groups; microRNAs (miRNAs), endogeneous small interfering RNAs (endo siRNAs) and piwi interacting RNAs (piRNAs). miRNAs, 17-21 nucleotide in size, are involved in posttranscriptional gene regulation via precise or imprecise base pairing with target mRNAs resulting in either target mRNA degradation or translational inhibition. Endo siRNAs ,on the other hand, may function transposon regulation but their precise regulatory function and mechanism have not been elucidated yet. piRNAs are mainly involved in transposon silencing in spermatogenesis.Despite their discovery, biological roles and modes of functions of small RNAs remain to be elucidated. The aim of this thesis was to identify polysome-associated small RNAs in Drosophila melanogaster embryos by deep sequencing and investigate their role in translational regulation. Deep sequencing and microarray results determined stage and fraction specific distribution of genome encoded small RNAs. Surprisingly, the results implied that mRNAs may be posttranscriptionally regulated by antisense transcripts in polysome.
Benzer Tezler
- Use of an intronic polyadenylation site in breast cancers
Bir intronik poliadenilasyon bölgesinin meme kanserlerinde kullanımı
GÖZDE KÖKSAL BIÇAKCI
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Cloning of Taql endonuclease gene into E.coli and its expression
Taql endonükleaz geninin E.coli'ye klonlanması ve ekspresyonu
İZZET ENÜNLÜ
- Cloning of TaqI endonuclease gene into E.coli and isolation of the enzyme by using pMAL-p2 vector system
pMAL-p2 vektör sistemi kullanılarak TaqI restriksiyon enzim geninin E.coli'ye klonlanması ve enzimin izolasyonu
PEMBE HANDE ÖZDİNLER
- Cloning of thermostable glucose isomerase of thermus thermophilus in escherichia coli
Thermus themophilus'ün ısıl kararlı glikoz izomerazının escherichia colı'ye klonlanması
BERNA SARIYAR
- Cloning of alpha and beta subunit genes of 20 S proteasome from thermoplasma volcanium
Thermoplasma volcanium'un 20 S proteazom alfa ve beta altünite genlerinin klonlanması
GÖNÜL SEYİT
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
DOÇ. DR. MAHİNUR AKKAYA