Mikrosatellit temelli markörlerle Centaurea nivea' daki genetik çeşitliliğin belirlenmesi
The determination of genetic diversity of Centaurea nivea by using microsatellit baset markers
- Tez No: 266553
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EMEL SÖZEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Centaurea nivea Eskişehir bölgesinde dar yayılış alanına sahip nadir endemik bir tür olup sadece 5 populasyonla temsil edilmektedir. Bu bitki türü ?Türkiye Bitkileri Kırmızı Kitabı?na göre CR (Critically endangered) ?Çok tehlikede? kategorisinde yer almaktadır. Bu çalışmada Compositae familyası ve Cheirolepis seksiyonuna ait Centaurea nivea'nın sahip olduğu genetik çeşitlilik mikrosatellit markörleri kullanılarak incelenmiştir.İlk olarak C. corymbosa ve C. stoebe & diffusa için geliştirilen 10 SSR markörünün C. nivea'da kullanılabilirliği test edilmiştir. Her bir SSR primeri için kalıp, Mg+2 ve bağlanma sıcaklığı optimizasyonu yapılmış ve C. nivea'da çalışan primerler tespit edilmiştir. Yapılan optimizasyon çalışmaları neticesinde toplam 3 SSR primerinin, 13D10, 13A9 ve CM15, C. nivea'da çalıştığı belirlenmiştir.Bu primerler kullanılarak Centaurea nivea'nın populasyon içi ve populasyonlar arası genetik çeşitlilik seviyesi SSR-PCR yöntemi ile çalışılmıştır. Toplam 5 populasyona ait 150 bireyin 3 SSR primeri ile çalışılması sonucu 21 allel tespit edilmiştir. Çalışılan tüm lokuslar %100 polimorfiktir. Beklenen heterozigotluk (He) değeri ortalaması 0.7298, populasyonlar arası genetik farklılaşma derecesinin belirlenmesinde kullanılan FST değeri 0.1322 ve gen akışı değeri Nm 1.6411 olarak bulunmuştur. Çalışmamızdan elde edilen sonuçlar populasyon içi genetik çeşitlilik seviyesinin populasyonlar arası genetik çeşitlilikten fazla olduğunu göstermiştir. Endemik C. nivea için uygun koruma yöntemleri önerilmiştir.
Özet (Çeviri)
Centaurea nivea is rare endemic species that have a narrow distribution area in Eskişehir region and represented by only five populations. According to Red Data Book of Turkish Plants, this species is categorised as critically endangered. In this study, genetic diversity of Centaurea nivea belonging to Compositae family and Cheriolepis section was analysed by using microsatellite markers.Firstly, the usability of ten SSR markers developed for C. corymbosa and C. stoebe & diffusa was tested in Centaurea nivea. Template, Mg+2 and annealing SSR-PCR method. As a result of analysing 150 individuals belonging to total five populations with three SSR primers, temperature optimization were undertaken for each SSR primer and the primers worked in C. nivea were determined. At the end of optimization studies in total three of SSR primers, 13D10, 13A9 and CM15, worked in C. nivea were detected.By using these primers, the intra and inter population genetic diversity levels of Centaurea nivea were studied with SSR-PCR method. As a result of studying 150 individuals belonging to total 5 population with 3 SSR primers, twenty-one alleles were detected. The all SSR loci were polymorphic. The average of expected heterozygosity (He) was found as 0.7298, FST value that is used to determine the level of genetic differentiation between populations as 0.1322 and the value of gene flow (Nm) as 1.6411. The results obtained from this study showed that the level of genetic diversity within subpopulations was higher than that of among populations. Suitable conservation stratejies were suggested for endemic C. nivea
Benzer Tezler
- Mikrosatellit instabiliteli hücre hatlarında Werner sendromu helikazı inaktivasyonunun moleküler etkileri ve nanopartikül bazlı tedavi yaklaşımları
Molecular effects of Werner syndrome helicase inactivation and nanoparticle-based therapeutic approaches in microsatellite-instable cell lines
SAHRA ESMKHANI YOUVALARI
Doktora
Türkçe
2025
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NECAT VAKUR OLGAÇ
DOÇ. DR. HİLAL YAZICI
- Retrotranspozona dayalı marker sistemleri kullanarak pistacia türlerinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterizaton of pistacia species using retrotransposon based marker systems
EMRAH KIRDÖK
Doktora
Türkçe
2016
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Kolon kanserlerinde msı pozitif hastalarda klinikopatolojik özelliklerin ve sağkalım verilerinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi
Comparative evaluation of clinicopathological features and survival data in msi positive patients with colon cancer
MUHAMMET RAŞİT SİYAH
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
İç HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. BURAK BİLGİN
DOÇ. DR. BETÜL ERİŞMİŞ
- Kolorektal kanser tarama testleri ile tanı alan ve semptomatik başvuru sonrası tanı alan kolon adenokarsinom hastalarının kanser evrelerinin ve prognozlarının karşılaştırılması
Comparison of cancer stages and prognosis of colon adenocarcinoma patients diagnosed with colorectal cancer screening tests and those diagnosed after symptomatic presentation
AYSEL BEŞBAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Aile HekimliğiSağlık Bilimleri ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELMA PEKGÖR
DOÇ. DR. AYŞE NUR UĞUR KILINÇ
- Molecular investigation of CHEK2 variants of unknown significance (VUS) found by genetic screening of breast and colorectal cancer patients and healthy individuals in Turkish population
Türk popülasyonunda meme ve kolorektal kanser hastaları ile sağlıklı bireylerde genetik tarama ile saptanan klinik önemi bilinmeyen CHEK2 varyantlarının moleküler incelemesi
NİSAN DENİZCE CAN
Doktora
İngilizce
2026
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY