Geri Dön

Enterobacteriaceae klinik izolatlarında beta laktamaz aktivitesinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

Investigation of beta lactamase activity in enterobacteriaceae clinic isolates with phenotypic and genotypic methods

PDF İndir

  1. Tez No: 352702
  2. Yazar: GÜL BAYRAM ABİHA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: E. coli, K. pneumoniae, geniş spektrumlu beta laktamaz, polimeraz zincir reaksiyonu, rep-PZR, E. coli, K. pneumoniae, extended spectrum beta lactamase, polymerase chain reaction, rep-PCR
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 126

Özet

Enterobacteriaceae türlerinde bulunan beta-laktamaz enzimi beta-laktam antibiyotikleri hidrolize ederek birçok antibiyotiğe dirence sebep olmaktadır. Çalışmada, 109 E. coli ve 24 K. pneumoniae suşunun GSBL aktivitesinin çeşitli fenotipik yöntemlerle tespit edilmesi ve genotipik yöntemlerle beta laktamaz ve kinolon direncinden sorumlu gen bölgelerinin belirlenmesi, ek olarak da GSBL pozitif olarak saptanan 100 E. coli suşunun rep-PZR ile klonal ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Çift sinerji testi ile E.coli suşlarının 107?si (%96,4) pozitif ve ikisi (%3,6) negatif, K. pneumoniae suşlarının 23?ü pozitif (%95,7) ve biri (%4,3) negatif, E-test ile E.coli suşlarının 102?si (%93) pozitif ve yedisi (%7) negatif, K. pneumoniae suşlarının 22?si (%92) pozitif, 2?si (%8) negatif, kombine disk difüzyon testi ile E.coli suşlarının 108?i (%99,08) pozitif, biri (%0,92) negatif, K. pneumoniae suşlarının 23?ü (%95,7) pozitif ve biri (%4,3) negatif olarak saptandı. Suşların 114?ünde (%85) CTX-M grup 1 enzimi, 43?ünde (%32,1) TEM tipi, 44?ünde (% 32,8) OXA tipi, 31?inde hem TEM hem OXA tipi ve bir izolatta hem TEM hem SHV tipi beta laktamazlar saptandı. Kinolon direncinden sorumlu aac(6')-Ib-cr gen bölgesi ise 82 E. coli (%75,3), 15 K. pneumoniae (%62,5) suşunda pozitif olarak saptandı. Rep-PZR Diversilab yöntemi ile tiplendirilen 100 E. coli izolatından ikisi ana klon (1 ve 2) olmak üzere toplam 5 farklı klon (1-5) elde edildi. Sonuç olarak, klinik örneklerden izole edilen enterik bakterilerin çoğunluğunda beta-laktamaz ve kinolon direnç genleri saptanmıştır. Bu direnç genlerinin bakteriler arasında klonal olarak yayılımının önlenmesi için gerekli tedbirlerin alınması gerekmektedir.

Özet (Çeviri)

Beta lactamase enzyme, found in Enterobacteriaceae species, hydrolyze beta lactam antibiotics and causes antibiotic resistance. In this study, we aimed to detect ESBL activity with several phenotypic methods in 109 E. coli and 24 K. pneumoniae strains and determine gene regions responsible for beta lactamase and quninolone resistance with genotypic methods, in addition to this, investigation of clonal relationship in ESBL positive 100 E. coli strains with rep-PCR. With double disc synergy test 107 E.coli (96,4%) strains were positive and two were (3,6%) negative, 23 K. pneumoniae strains were positive (95,7%) and one was (4,3%) negative, with E-test 102 E.coli strains were (93%) positive and seven were (7%) negative, 22 (92%) K. pneumoniae strains were positive, two (8%) negative, with combine disc diffusion test 108 (99,08%) E.coli strain were positive, one (0,92%) was negative, 23 (95,7%) K. pneumoniae strains were positive and one (4,3%) was negative. CTX-M group 1 enzyme was in 14 (85%) strains, TEM was in 43 (32,1%) strains, OXA in 44 (32,8%), both TEM and OXA in 31 strains, and both TEM and SHV were in one strain detected. aac(6')-Ib-cr gene region responsible for quinolone resistance was found positive in 82 E. coli (75,3%), 15 K. pneumoniae (62,5%) strains. 100 E. coli isolates identified by rep-PCR Diversilab method, was acquired in totaly five different clons (1-5) including two main clones. Finally, beta-lactamase and quinolone resistance genes were established in most of the enteric bacteria isolated from clinic samples. It is required to take necessary precautions to prevent clonal spread of these resistance genes in bacteria.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    351236

    Enterobacteriaceae klinik izolatlarında karbapenemaz varlığının fenotipik yöntemlerle araştırılması

    Exploration of carbapenemase presence via phenotypic methods in clinical enterobacteriaceae isolates

    EMRAH AYDIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDURRAHMAN KİREMİTÇİ

  2. Tez No

    157925

    Yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalardan izole edilen gram negatif basillerde sınıf I integronların saptanması ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların moleküler analizi

    Identification of class I integrons and molecular analysis of extended spectrum beta-lactamases in gram negative bacilli isolated from patients hospitalized in intensive care units

    ÖZGEN KÖSEOĞLU ESER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ŞEMSETTİN USTAÇELEBİ

  3. Tez No

    753670

    İdrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen Enterobacteriaceae'lerde antibiyotik direnç genlerinin moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of antibiotic resistance genes in Enterobacteriaceae isolated from urinary tract infections (UTI)

    HUSAM MAHDI SALEH ALSHABBANI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF SEVİM

  4. Tez No

    820733

    Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae klinik izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance genes in clinical insulations of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

    FATMA KAVALCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YEŞİM AKTÜRK DİZMAN

  5. Tez No

    243233

    Enterobacteriaceae izolatlarında CTX-M tipi genişlemiş spektrumlu ß-laktamaz (GSBL) enzim pozitifliği ve dağılımı

    Widely distributed and predominant CTX-M type extented spectrum ß lactamase (ESBL) in enterobacteriaceae isolates

    CİHANGİR GÜLAMBER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ

Geri Dön