A study on cobalt adaptation and memory retention of freshwater bacteria isolates
Tatlısu bakteri izolatlarının kobalta adaptasyonu ve hafızada tutma süresi üzerine bir çalışma
- Tez No: 285652
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE GÜL GÖZEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: balık mukusunda yaşayan bakteriler, tatlısu, kobalt, direnç, MİK, adaptasyon, hafızada tutma, spektrofotometre, kolonisayımı, epigenetik, fish mucus-dwelling bacteria, freshwater, cobalt, resistance, MIC, adaptation, memory retention, spectrophotometer, viable count, epigenetic
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Bir tatlı su balığı olan Alburnus alburnus (gümüş) türündenönceden izole edilmiş olan yüzey mukus izolatlarının kobalta karşıdirençleri çalışılmıştır. Minimum inhibitör konsantrasyonu (MIC) toplamotuz altı izolat için belirlenmiştir. Bu direnç çalışmalarının sonuçları bizikobalt adaptasyonuna ve sonraki bellek tutma uyumu üzerinde deneytasarımı yapmaya götürmüştür. Seçilen üç izolat, karışık kültür ve tekizolatlı kültür olmak üzere inhibitör kobalt konsantrasyonuna maruzbırakılmıştır. Karışık kültür içinde rekabet ve dışlanma oluştuğukaydedilmiştir. Koloni oluşumundaki gecikmeler sıvı kültür içinde takipedilmiştir. Bazı izolatlar ortamdaki kobalta alıştırılmış, sabit zamanlıbüyümeler elde edilmiştir ve takiben kullanılan konsantrasyona adapteoldukları varsayılmıştır. Adaptasyon, hafızanın bir sonucu olarakdeğerlendirilmiştir. İlerleyen çalışmalarda kobaltsız ortamda yapılan birçok seri pasajdan sonra izolatların, kobaltlı ortamda, kobalta adapteolma durumunu hafızalarında ne kadar süre tuttukları takip edilmiştir.Gözlemlerimizde büyüme kantitatif olarak hem spekrofotometre ile hemde canlı koloni sayımı ile tespit edilmiştir. Koloni sayım sonuçları ilespektrofotometrede, ölçülen sonuçların birbiriyle örtüşmediğibelirlenmiştir. Yüksek koloni sayımının olduğu yerde, fotometriksonuçlar düşük bulunmuştur. Tolerans limitinin üstündeki kobaltkonsantrasyonunun hücrelerin boyutunda küçültmeye neden olduğu buhalde optik cihazların algısının altına düştüğü yorumu yapılmıştır.Çalışmamız izolatların bellek tabanlı mekanizmalar ile kobalta adapteolduklarını ve bir süre için bu belleği korumanın mümkün olduğunuişaret etmiştir.
Özet (Çeviri)
The mucus-dwelling bacteria previously isolated from the surfaceof a freshwater fish species (Alburnus alburnus from Lake Mogan,Ankara), were studied to discover their cobalt resistance. The minimuminhibitory concentrations (MIC) were determined for a total of thirty sixbacterial isolates. The results of the resistance studies led us to designexperiments on adaptation to cobalt and subsequent memory retention.Three selected isolates were exposed to an inhibitory cobaltconcentration as a mixed culture and individually. The delayedformation of colonies along with competitive exclusion of one of theisolates in the mixed culture were recorded. The delay for colonyformation was followed up for liquid culture conditions. After some ofour isolates acclimated to cobalt and started to exhibit constant time ofgrowth period, it is assumed that they were adapted. We regardedadaptation as a result of memory formation. Next, we did a further studyto find out how long this memory could be retained via serial multiplepassages in cobalt free medium. We expressed our observationsquantitatively by measuring the growth by using spectrophotometer andby performing viable counts. Interestingly, where there was a high CFU,the photometric values were very low. We interpreted the finding suchthat the presence of cobalt above tolerance limits were causing sizereduction in the cells. So that their presence was underestimated byoptic devices in visible range. Our study hinted that freshwater bacteriawas adapting cobalt in a memory based mechanism and able to retainthis memory for some time.
Benzer Tezler
- Monitoring of cobalt adaptation of environmental bacterial isolates using ATR-FTIR spectroscopy
ATR-FTIR spektroskopisi ile çevresel bakteri izolatlarında kobalt adaptasyonunun incelenmesi
MEHMET KARDAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
MikrobiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE GÜL GÖZEN
PROF. DR. FERİDE SEVERCAN
- Investigation of cobalt resistance in Rhodobacter sphaeroides at molecular level
Rhodobacter sphaeroides'de kobalt direncinin moleküler düzeyde incelenmesi
GÜNEŞ ATAY
Doktora
İngilizce
2024
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Farklı implant desteklerinde değişik teknik ve materyallerle hazırlanan alt yapıların kenar uyumunun karşılaştırmalı olarak incelenmesi
A comparative study of marginal fit of copings which was prepared with various techniques and materials' on different abutments
ESRA KOÇ
- Nötron aktivasyon analizi yöntemi ile cam içinde 59-27Co belirlenmesi
Determination of 59-27Co in glass by the method of neutron activation analysis
İSMAİL ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
Nükleer Mühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiNükleer Mühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERDİNÇ EDGÜ
- Hidroponik sistemde besleyici film tekniği ile yüksek boylu maviyemiş ( Vaccınıum corymbosum L. ) yetiştirilmesi ve yetişme şartlarının optimize edilmesi
Production of highbush blueberry in hydroponic system with nutrient film technique ( NFT ) and optimization of growing conditions
ELİF BALIKÇI
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM IŞILDAK