Hidrazon türevi MAO inhibitörleri ile akılcı ilaç tasarımına yönelik QSAR analizi
QSAR analysis of hydrazone derivative MAO inhibitors for rational drug design
- Tez No: 290295
- Danışmanlar: PROF. DR. SAFİYE ERDEM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Kimya, Pharmacy and Pharmacology, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Organik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 126
Özet
Monoamin oksidaz (EC-1.4.3.4, MAO) biyolojik aminleri oksitleyen bir flavo enzimdir. MAO A ve MAO B olmak üzere %70 oranında birbirine benzeyen iki izozimi bulunmaktadır. Her iki izomer birbirinden farklı inhibitör, aminoasit dizisi ve substrat seçicilikleri ile ayrılırlar. MAO serotonin, dopamin, norepinefrin, epinefrin gibi amin nörotransmitter oksidasyonunda ve hücre içi konsantrasyonu düzenlenmesinde rol oynar. Depresyon durumunda beyindeki nöradrenalin ve serotonin, Parkinson hastalığında ise dopamin miktarı önemli derecede azalır. MAO enziminin inhibe edilmesi ile bu aminlerin seviyesi yükselerek normal düzeye gelmesi sağlanır. MAO A ve MAO B inhibitörleri, bu aminlerin yıkımını engelleyerek depresyon, bunalım, Parkinson ve hatta Alzheimer gibi hastalıkların tedavisinde kullanılabilir.Bu tez çalışmasında MAO enzimini inhibe eden 47 adet hidrazon türevi bileşik kantitatif yapı-aktivite ilişkisi (QSAR) ile modellendi. Yapılan çalışmalar genel olarak beş bölüm altında toplanabilir:1.Spartan04, Dragon 5.4 ve Codessa 2.2 programları kullanılarak yaklaşık 1664 tanımlayıcı hesaplandı.2.Heuristik Yöntem ile tanımlayıcılar seçildi ve 10 adet QSAR modeli geliştirilerek validasyon işlemlerine tabii tutuldu.3.Geliştirilen en iyi model seçilerek modelin tahmin gücü dış validasyon işlemi ile test edildi.4.Kimyasal çeşitlendirme ile henüz sentezlenmemiş yeni maddelerinin MAO inhibitor aktivitesi tahmin edildi ve MAO inhibitörü olabilecek yeni bileşikler önerildi.5.Çalışılan bileşiklerin enzimin aktif bölgesindeki bağlanma pozisyonları doking yöntemi ile incelendi.MAO A ve MAO B için geliştirilen QSAR modellerinde Dragon tanımlayıcılarının baskın olduğu ve bileşiklerin hacimsel ve konformasyonel özelliklerinin biyolojik aktiviteler ile ilişkili olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Monoamine oxidase (EC-1.4.3.4, MAO) is a flavo enzyme which oxidizes biological amines. MAO A and MAO B has two isozymes which resemble 70% each other. These isozymes are distinguished by the differences in their inhibitor, aminoacid residues and substrate selectivities. MAO plays an important role in oxidation of neurotransmitter amines such as serotonin, dopamine, norepinefrin, epinefrin as well as regulation of intracellular concentration. In case of depression, the amount of noradrenaline and serotonin, and that of Parkinson disease, the amount of dopamine decreases. Through the inhibition of MAO enzyme, the level of these amines will increase and by doing so it is possible to attain a normal range. Therefore, the inhibition of MAO A and MAO B, by preventing the destruction of these amines, can be used in the treatment of depression, Parkinson and Alzeheimer diseases.In this thesis, 47 hydrazone derivatives which inhibit MAO enzyme have been modeled with Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR). These studies can be categorized under five titles:1. Using Spartan?04, Dragon 5.4 and Codessa 2.2 softwares, 1664 descriptors have been calculated.2. Using Heuristic method, descriptors have been selected and 10 QSAR models have been developed through the validation process.3. The prediction power of the best model has been tested with external validation.4. MAO inhibitory activity of new compounds which are not yet synthesized have been predicted with lead optimization.5. Binding modes of the studied compounds in the enzyme active sites have been analyzed by docking method.Within the developed QSAR models, Dragon descriptors were found to be dominant and the structural features related to volume and conformation of these compounds were proved to be closely related with their biological activities.
Benzer Tezler
- Monoamin oksidaz enzim inhibitörleri olarak tiyazol halkası içeren yeni bileşiklerin sentez ve biyolojik etki çalışmaları
Synthesis and biological effects studies of new compounds containing thiazole ring as monoamine oxidase enzyme inhibitors
NARMIN KHALILOVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF ÖZKAY
DOÇ. DR. BEGÜM NURPELİN SAĞLIK
- Seçici monoaminoksidaz-B inhibitörü yeni bileşiklerin tasarımı, sentezi ve parkinson hastalığının tedavisindeki etkilerinin değerlendirilmesi
Design and synthesis of novel selective monoamineoxidase-B inhibitor compounds and evaluation of effects in the treatment of parkinson's disease
YAREN NUR ZENNİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Eczacılık ve Farmakolojiİnönü ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP ÖZDEMİR
- Monoamin oksidaz inhibitörü etki göstermesi beklenen yeni hidrazon bileşiklerinin sentezi, moleküler modellemesi ve MAO-A/MAO-B seçiciliklerinin araştırılması
The synthesis, molecular modelling and investigation of MAO-A/MAO-B selectivity of new hydrazone compounds expected to show impact of monoamine oxidase inhibition
GÜLSEMA KARAAĞAÇLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESRİN GÖKHAN KELEKÇİ
- Benzoksazolinon-hidrazon farmakoforu taşıyan dual etkili MAO-Aromataz inhibitörlerinin tasarımı ve sentezi: İn siliko ve in vitro çalışmalar
Design and synthesis of dual MAO-Aromatase inhibitors containing benzoxazolinone-hydrazone pharmacophore: In silico and in vitro studies
HAYRÜNNİSA TAŞCİ
Doktora
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESRİN GÖKHAN KELEKÇİ