Geri Dön

Çeşitli gıdalardan izole edilen Enterobacter sp. ve Cronobacter sakazakii suşlarının biyokimyasal ve moleküler yöntemlerle tanımlanması

The biochemical and molecular identification of Enterobacter sp. and Cronobacter sakazakii strains isolated from various foods

PDF İndir

  1. Tez No: 299602
  2. Yazar: ESİN ÇETİNKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAMURAN AYHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 98

Özet

Bu çalışmada evde hazırlanan bebek gıdalarında kullanılan hammaddelerden izole edilen Enterobacter sp. ve Cr. sakazakii suşlarının çeşitli yöntemler ile tanımlanıp, bu yöntemlerin birbirleri ile kıyaslanmaları amaçlanmıştır. Bebek gıdalarının temel içeriğini oluşturan tahıl unları, bitki çayları, sebzeler ve hayvansal gıdalardan izole edilen 54 adet suş; 15 klasik biyokimyasal test, 3 hızlı test kiti (API 20 E, API ZYM ve ID 32 E) ve 5 moleküler yöntem (Darbeli Alan Jel Elektroforezi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Çoklu Lokus Dizilim Analizi, 16S rRNA Dizilim Analizi, Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyonu-Uçuş Süresi Kütle Spektrometresi) ile tanımlanmıştır.İzole edilen 54 suşa uygulanan 15 klasik biyokimyasal test ile bu suşların %88,9'u tanımlanabilmiştir. Bunlardan %35,1'i E. agglomerans, %24'ü E. cloacae, %3,7'si E. intermedus, %3,7'si E. amnigenus, %1,85'i E. gergoviae, %5,5'i Esc. coli, %5,5'i Cl. amalon, %5,5'i Cl. freundii, %1,85'i Sr. grimes, %1,85'i Sr. fonticola, %1,85'i Kl. pnemoniae olarak tanımlanırken %11,1'i tanımlanamamıştır.Ek olarak, API 20 E ve ID 32 E test kitleri ile tanımlanan 44 izolattan 25'inin (%56,8) birincil tanımlama sonuçları aynıdır. Bunlardan %22,7'si Pantoea spp., %20,5'i Cr. sakazakii, %4,5'i Kl. pnemoniae, %4,5'i Esc. coli, %2,3'ü E. aerogenes, %2,3'ü Esc. vulneris'tir. İzolatlardan %43,2'si iki farklı test kitine de farklı sonuçlar vermiştir.XbaI enziminin kullanıldığı PFGE ile suşların %93,2'sinin filogenetik analizi yapılabilmiştir. Buna göre, filogenetik ağaçta 28 farklı genetik yapı görülmüştür.Cr. sakazakii olduğu düşünülen suşlara uygulanan PZR ve MALDI-TOF MS ile bu izolatların Cr. sakazakii olduğu doğrulanırken; MLST ve 16S rRNA dizilim analizi ile 7 muhtemel Cr. sakazakii suşundan 2'si Cr. malonaticus, 1''i ise Cr. universalis olarak tanımlanmıştır.

Özet (Çeviri)

The aims of this study are the isolation of Enterobacter sp. and Cr. sakazakii from rawmaterials which are being used for homemade baby food, the identification of the strains with various methods and the comparison of these methods. 54 strains isolated from common baby food ingredients which were grain flours, herbal teas, vegetables and animal products, were identified via 15 biochemical tests, 3 rapid test kits (API 20 E, API ZYM, ID 32E) and 5 molecular methods (Pulsed Field Gel Electrophoresis, Polimerase Chain Reaction, Multi Locus Sequence Typing, 16S rRNA Sequence Typing, Matris Assisted Laser Desorption/Ionisation-Time of Flight Mass Spectrometry).Depending on 15 classical biochemical tests which were done for 54 isolates, 88.9% of these strains could be identified. 35.1% of them were E. agglomerans, 24% of them were E. cloacae, 3.7% of them were E. intermedus, %3.7 of them were E. amnigenus, 1.85% of them were E. gergoviae, 5.5% of them were Esc. coli, 5.5% of them were Cl. amalon, 5.5% of them were Cl. freundii, 1.85% of them were Sr. grimes, 1.85% of them were Sr. fonticola, 1.85% of them were Kl. pnemoniae. On the other hand 11.1% of these isolates could not be identified.Additionally, 56.8% of the primary identifications via both API20E and ID32E were in correspondance. 22.7% of the 44 strains were Pantoea spp., 20.5% of them were Cr. sakazakii, 4.5% of them were Kl. pnemoniae, 4.5% of them were Esc. coli, 2.3% of them were E. aerogenes, 2.3% of them were Esc. vulneris. 43.2% of the results gave different results for the two test kits.XbaI enzyme was used for PFGE and phylogenetic analyses could done for 93.2% of the strains. There were 28 different genetical structure seen on the phylogenetic tree.Isolates which were deemed to be Cr. sakazakii were all confirmed as Cr. sakazakii by PCR and MALDI-TOF MS. On the other hand, 2 of 7 possible Cr. sakazakii strains were identified as Cr. malonaticus while 1 of 7 strains was determined as Cr. universalis via MLST and 16S rRNA sequence typing.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    58328

    Enterobacter identifikasyon testlerinin birleştirilmesi üzerine araştırma

    Research on combination of entedbacter identification tests

    NADİRE KIRAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Gıda MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A. KADİR HALKMAN

  2. Tez No

    397051

    Gıdalardan izole edilen enterobacterıaceae türlerinin amino asit dekarboksilaz aktivitesi, biyofilm oluşumu ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi

    Determining amino acid decarboxylase activity biofilm formation and the antibiotic resistance in the enterobacteriaceae isolates from foods

    ETHEM SERHAT YAVAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESLİHAN GÜNDOĞAN BAKIRCI

  3. Tez No

    302704

    Piyasada satışa sunulan çeşitli bebek mamalarında ve pastörize sütlerde Enterobacter sakazakii'nin varlığı

    Presence of Enterobacter sakazakii in a variety of commercially available baby food and pasteurized milk

    BURCU ÇAKMAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZER ERGÜN

  4. Tez No

    753511

    Kanatlı hayvan işletmelerinde salmonella serotiplerine özgü litik faj izolasyonu ve karakterizasyonu

    Lytic phage isolation and characterization specific to salmonella serotypes in poultry enterprise

    AYŞEGÜL ÜNVERDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU KAŞKATEPE

  5. Tez No

    470730

    Çeşitli gıdalardan izole edilen mayaların killer özelliklerinin araştırılması

    Investigation of killer features of yeast isolated from different food

    HÜSEYİN ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ARZU KART

Geri Dön