Geri Dön

In vitro selection of DNA aptamers to Glioblastoma multiforme

Glioblastoma multiforme?ye karşı DNA aptamerlerinin in vitro seçilimi

  1. Tez No: 305649
  2. Yazar: ABDULLAH TAHİR BAYRAÇ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FÜSUN İNCİ EYİDOĞAN, PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bölümü
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 123

Özet

Glioblastoma multiforme'yi özel olarak tanıyan aptamer probları negatif seçilimyapılmadan tekrarlı ve geniş Hücre SELEX'i temelli bir prosedürününkullanılmasıyla oluşturulmuştur. 454 Sekanslama teknolojisi SELEX yönteminiizlemek için biyoenformatik araçlar ise yüksek kapasiteli verlerden yaralanarakaptamerleri tanımlamak için kullanılmıştır. Özellikle hedef hücreye bağlanabilen venanomolar düzeyinde ayrılma sabitine (K d ) sabit bir grup aptamer üretilmiştir.Seçilen aptamerler glioblastoma hücre hattına ait farklı türlere yüksek bağlanmaeğilimi gösterirken, diğer kanser hücre hatlarına az ya da hiç bir bağlanmagöstermemektedir. Bu çalışmada üretilen aptamerler glioblastoma hücreleri içinmoleküler işaretleyici keşfi için araç olmanın yanı sıra teşhis için kullanılan probve hedeflenmiş ilaç dağıtımı gibi farklı uygulama alanlarında kullanılmapotensiyeline sahiptirler.

Özet (Çeviri)

Aptamer probes for specific recognition of glioblastoma multiforme weregenerated using a repetitive and broad cell-SELEX-based procedure withoutnegative selection. The 454 sequencing technology was used to monitor SELEX, andbioinformatics tools were used to identify aptamers from high throughput data. Agroup of aptamers were generated that can bind to target cells specifically withdissociation constants (K d ) in the nanomolar range. Selected aptamers showed highaffinity to different types of glioblastoma cell lines, while showing little or noaffinity to other cancer cell lines. The aptamers generated in this study havepotential use in different applications, such as probes for diagnosis and devices fortargeted drug delivery, as well as tools for molecular marker discovery forglioblastomas.

Benzer Tezler

  1. Aptamer selection against cadaverine/lysine antiporter (CADB) purified in mild detergent

    Hafif deterjanda saflaştırılmış kadaverin/lösin antiportu (CADB) için aptamer seçilimi

    NİLÜFER KARA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON

    DR. MÜSLÜM İLGÜ

  2. Küçük organik moleküllerin biyotransformasyonununu katalizleyen enzimlerin mühendisliği için yeni bir strateji: rıboswıtch-eşlenmiş tarama platformu

    A novel strategy for engineering of enzymes for the catalysis of small organic molecule biotransformation: riboswitch-coupled screening platform

    BURHAN BORA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERAP EVRAN

  3. Model bı̇r yeşı̇l flöresan proteı̇n ı̇çı̇n aptamer üretı̇mı̇nı̇n ve optı̇k bı̇yosensörlerde uygulanmasının araştırılması

    Investigation of aptamer production for a model green fluorescent protein and its application to optic biosensors

    DİLBER ECE AKGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET MUTLU

  4. Selecting 2-FY RNA aptamers against SARS-CoV-2 particle

    SARS-CoV-2 parçacığına karşı 2-FY RNA aptamerlerinin seçilimi

    MERİÇ ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE GÜL GÖZEN

  5. Limonda uçkurutan hastalığı etmeni phoma tracheiphila (kanc. et. ghick.)'nın toksinine dayanıklı hücre hatlarının in vitro seleksiyonu ve moleküler analizi

    In vitro selection of resistant lines to phoma tracheiphila (kanc. et. ghick.) toxin the agent of mal secco disease and molecular characterization of the lines

    BERNA BAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. N. KEMAL KOÇ

    DOÇ. DR. ALİ ERKILIÇ

    YRD. DOÇ. DR. AKİF ESKALEN