Türkiye bağ alanlarında Rhizobium vitis'in varlığı ve bazı genetik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of presence and some genetic features of Rhizobium vitis in the vineyards of Turkey
- Tez No: 338141
- Danışmanlar: PROF. DR. FİLİZ ERTUNÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Bakteriyoloji, PCR, PFGE, Bacteriology, Pulsed field gel electrophoresis
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Türkiye bağcılığının yoğun olarak yapıldığı illerimizden olan İzmir, Manisa, Denizli, Tekirdağ, Edirne, Kırklareli, Çanakkale, Diyarbakır, Elazığ, Malatya, Mardin, Nevşehir ve Ankara illeri bağ alanlarına 2009-2010 yılları Temmuz-Eylül ayları arasında, Rhizobium vitis?in varlığının saptanmasına yönelik arazi çalışmaları ve örnekleme yapılmıştır. Kırklareli, Çanakkale, Malatya ve Mardin illerinde R. vitis ile enfekteli asmaya rastlanmamıştır. Arazi çalışmaları sonucu elde edilen 103 izolat, klasik bakteriyolojik testler, patojenisite ve PCR analizleri ile Rhizobium vitis olarak tanılanmıştır. İzolatlar biyokimyasal testlere verdikleri sonuçlara göre SPSS istatistik programıyla fenotipik olarak değerlendirilmiştir. İzolatların tümü yapılan patojenisite testlerinde tütün (Nicotiana tabaccum var. Samsun), ayçiçeği (Heliantus annuus), datura (Datura stramonium) ve kalonşe (Bryophyllum daigremontianum) bitkilerinde ur oluşturmuştur. İzolatlar ayrıca spesifik primerler ile opin kullanımları yönüyle incelenmiş ve 103 izolattan 82?sinin oktopin, 18?inin nopalin ve 3?ünün vitopin tipi opin kullandığı tespit edilmiştir. İzolatların benzerlik oranı PmeI restriksiyon enzimi ile Pulsed Field Gel Elektroforezi (PFGE) profillerine göre yapılmıştır. Buna göre genotipik açıdan en fazla çeşitlilik Denizli, Ankara ve Nevşehir illerine ait izolatlar arasında bulunmuştur. Yapılan bu çalışma ile ülkemizde ilk defa Rhizobium vitis? in nopalin ve vitopin tipi opin kullanan izolatları saptanmıştır. Bu çalışma ile ülkemizde PFGE ile Rhizobium vitis izolatlarının benzerlik oranları saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
Surveys were carried out to determine the occurance of Rhizobium vitis in İzmir, Manisa, Denizli, Tekirdağ, Edirne, Kırklareli, Çanakkale, Diyarbakır, Elazığ, Malatya, Mardin, Nevşehir and Ankara, the important vineyard provinces of Turkey, during July and September of 2009-2010. Infected grapevine was not detected in Kırklareli, Çanakkale, Malatya and Mardin provinces. 103 strains were obtained after the surveys and isolates were identified as R. vitis by classical bacteriological techniques, pathogenicity tests and PCR. Isolates were evaluated phenotypically by SPSS statistical programme according to their results of the biochemical tests. All of the isolates found pathogenic on tobacco (Nicotiana tabaccum var. Samsun), sunflower (Heliantus annuus), datura (Datura stramonium) and kalonchoe (Bryophyllum daigremontianum) plants. Isolates were also examined for detect their use of opine. Among 103 isolates, 82 isolates were found as octopin type, 18 were found as nopalin and 3 were found as vitopin type. Similarity rate of the isolates were made according to the PFGE profiles of PmeI restriction endonuclease. The most genetical diversity was found in the isolates from Denizli, Ankara and Nevşehir provinces. Nopalin and vitopin types of Rhizobium vitis isolates were detected by this research for the first time in Turkey. Depends of our knowledge this is the first and pioneer research for the similarity rates of R. vitis isolates by PFGE in Turkey.
Benzer Tezler
- Alaşehir (Manisa) bağ alanlarında zarar yapan genel böcek türleri üzerine araştırmalar
Research on general pest insect species causing damage in alaşehir (Manisa) vineyard areas
POOTCHY JASMIN BELIZAIRE
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZoolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiTarımsal Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERSEN AYDIN YAĞMUR
- Tekirdağ ili bağ üretim alanlarında grapevine virus l (GVL) ve grapevine virus a (GVA) hastalıklarının araştırılması ve yaygınlık oranlarının belirlenmesi
Investigation of grapevine virus l (GVL) and grapevine virus a (GVA) diseases and determination of their prevalence rates in vineyard production areas of tekirdağ province
SİMGENUR DİLARA NOGAYLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
ZiraatTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAVVA İLBAĞI
- Manisa ili bağ alanlarında kullanılan tarımsal ilaçların gıda güvenliğine etkisinin koşullu değerleme yöntemiyle analizi ve üretici duyarlılığının belirlenmesi üzerine bir araştırma
A research on determination of effects on food safety of pesticide usages with contingent valuation method and grower awareness in Manisa vineyard areas
SELÇUK KARABAT
- Alaşehir(Manisa) bölgesi bağ alanlarında kullanılan bazı pestisit kalıntılarının tayini
Researches of some pesticides residues analysis on grapes in Alaşehir(Manisa)
EMRAH GÖRMEZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyolojiMuğla ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN SUNGUR CİVELEK
- Diyarbakır ili buğday, sebze ve bağ alanlarında önemli bitki paraziti nematod türlerinin belirlenmesi
Determination of plant parasitic nematodes in vegetable, wheat and grapevine fields in Diyarbakır province
MUSTAFA İMREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İ. HALİL ELEKCİOĞLU