Tulum peynirinden izole edilen Enterococcus Faecium ve Enterococcus Faecalis suşlarının virülens faktörlerinin ve dekarboksilaz aktivitelerinin belirlenmesi
Determination of virulence factors and decarboxylase actives of Enterococcus Faecium and Enteroccus Faecalis strains isolated from tulum cheese
- Tez No: 341608
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YASİN TUNCER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Enterococcus, virülens faktör, jelatinaz, biyojen amin, genomik DNA, polimeraz zincir reaksiyonu (PZR), Tulum peyniri, Enterococcus, virulence factor, jelatinaz, biogenic amine, genomic DNA, polymerase chain reaction (PCR), Tulum cheese
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 90
Özet
Bu çalışmada, Yogurtcu ve Tuncer (2013) tarafından Türk Tulum peyniri örneklerinden izole edilen 28 adet Enterococcus suşunda (21 adet Enterococcus faecium ve 7 adet Enterococcus faecalis) 14 adet virülens genin (gelE, efaAfm, efaAfs, cpd, cob, ccf, cad, ace, espfm, espfs, agg, cylM, cylB ve cylA) varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile araştırıldı. Bu suşların jelatinaz ve dekarboksilaz aktiviteleri de fenotipik yöntemlerle incelendi. PCR amplifikasyonu ile virülens faktörlerin araştırılması, bazı Enterococcus suşlarında jelatinaz (gelE), hücre duvarı adhezinleri (efaAfm ve efaAfs), seks feromonu (ccf), hücre duvarı ile ilişkili protein (espfm ve espfs) ve agregasyon maddesini (agg) kodlayan genlerin varlığını gösterdi. Ancak, varsayılan diğer virülens genler (cpd, cob, cad, ace, cylM, cylB ve cylA) bu suşlarda tespit edilemedi. PZR çalışmaları sonucu, enterokok suşlarının 1 ile 5 arasında değişen sayıda virülens faktör kodlayan gen içerdiği belirlendi. E. faecalis NYE15, E. faecium NYE24, NYE45, NYE59 ve NYE60 suşlarında sadece 1 adet virülens faktör tespit edildi. Diğer taraftan, E. faecalis NYE16, NYE46 ve NYE48 suşlarının test edilen enterokok suşları arasında en fazla virülens gen içeren suşlar oldukları bulundu. PZR sonuçları enterokok suşlarında en sık bulunan virülens genlerin ccf (% 85.7), efaAfm (% 75.0) ve gelE (% 32.1) olduğunu gösterdi. 4 adet E. faecalis suşu Todd-Hewitt Agarda jelatinaz aktivitesi gösterdi fakat, E. faecium suşlarından hiçbiri jelatinaz aktivitesi göstermedi. Fenotipik jelatinaz testi sessiz gelE geninin varlığını ortaya çıkardı. E. faecium NYE6, NYE23, NYE51, NYE52 ve E. faecalis NYE16 suşlarında sessiz gelE tanımlandı. Lisin, ornitin ve histidin enterokok suşlarının hiçbiri tarafından dekarboksile edilmedi. Ancak, enterokok suşlarının % 92.9?u tirozini dekarboksile etti. Bu çalışmanın sonuçları, fermente gıdaların üretiminde starter kültür olarak Enterococcus suşlarının kullanılmasının dikkatli bir güvenlik değerlendirilmesi gerektirdiğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, the presence of 14 virulence genes (gelE, efaAfm, efaAfs, cpd, cob, ccf, cad, ace, espfm, espfs, agg, cylM, cylB and cylA) in 28 Enterococcus strains (21 Enterococcus faecium and 7 Enterococcus faecalis), isolated from Turkish Tulum cheese samples by Yogurtcu and Tuncer (2013), were investigated by polymerase chain reaction (PCR). Gelatinase and decarboxylase activities of these strains were also investigated by phenotypic methods. Investigation of virulence factors by PCR amplification revealed the presence of genes encoding for gelatinase (gelE), cell wall adhesions (efaAfm and efaAfs), sex pheromone (ccf), cell wall-associated protein (espfm and espfs) and aggregation substance (agg) in some Enterococcus strains. However, other presumed virulence genes (cpd, cob, cad, ace, cylM, cylB and cylA) in these strains were not detected. Enterococcal strains were found to contain virulence encoding genes which number ranging from 1 to 5 by PCR studies. Only one virulence factor was detected in E. faecalis NYE15, E. faecium NYE24, NYE45, NYE59 and NYE60 strains. On the other hand, E. faecalis NYE16, NYE46 and NYE48 strains were found to be contain the maximum virulence genes among tested enterococcal strains. PCR results showed that most frequently present virulence genes in enterococcal strains are ccf (85.7 %), efaAfm (75.0 %) and gelE (32.1 %). Four E. faecalis strains showed gelatinase activity on Todd-Hewitt Agar but, none of the E. faecium strains showed gelatinase activity. Phenotypic gelatinase test revealed the existence of apparently silent gelE gene. Silent gelE gene was identified in E. faecium NYE6, NYE23, NYE51, NYE52 and E. faecalis NYE16 strains. Lysine, ornithine and histidine were not decarboxylated by any enterococcal strains. However, tyrosine was decarboxylated by 92.9 % of the strains. The results of this study suggest that the use of Enterococcus strains as starter cultures to production of fermented foods requires careful safety evaluation.
Benzer Tezler
- Tulum peynirinden enterokok suşlarının izolasyonu ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
Isolation of enterococcal strains from tulum cheese and determination of their susceptibility to antibiotics
NAZLI NAZMİYE YOĞURTÇU
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyoteknolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASİN TUNCER
- Kargı tulum peynirinden izole edilen laktik asit bakterilerinin starter ve probiyotik kültür özelliklerinin belirlenmesi
Lactic acid bacteria which is isolated from kargi tulum cheese to establish starter and probiotic culture properties
ÖZLEM ELÇİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BUKET KUNDUHOĞLU
- Genetik karakterizasyonu yapılmış çeşitli laktik asit bakterilerinin bazı özeliklerinin belirlenmesi
Determination of some characteristics of various genetically characterized lactic acid bacteria
EDİBE RABİA ÖZKAN
Doktora
Türkçe
2021
Gıda MühendisliğiSelçuk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAT AKIN
- Enterosin üreticisi Enterococcus faecalis MBE1-9 suşu tarafından üretilen enterosinin karakterizasyonu ve gıda endüstrisinde kullanım potansiyelinin belirlenmesi
Characterization of enterocin produced by the enterocin producer Enterococcus faecalis MBE1-9 strain and determination of the potential usage in the food industry
PINAR ÖZTÜRK
Doktora
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
- Tulum peynirinden izole edilen laktik asit bakterilerinin tanımlanması ve anti-listerial etkilerinin araştırılması
Identification of lactic acid bacteria isolated from tulum cheese and determination of the anti-listerial activity
ÖZNUR HIZARCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK HEPERKAN