Geri Dön

Electronic correlations in metalloproteins: A quantum Monte Carlo study

Metaloproteinlerde elektronik bağlılıklar: Kuantum Monte Carlo çalışması

  1. Tez No: 342902
  2. Yazar: SELMA MAYDA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NEJAT BULUT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 104

Özet

Metaloproteinler bir metal atomu içeren proteinlerdir. Vitamin B12 (Co) ve hemoglobin (Fe) gibi metaloproteinler bir geçiş metali içerirler ve yarıiletken özelliği gösterirler. Bu tezde, metaloproteinlere örnek olarak, vitamin B12 çalışılmış ve Co 3d orbitallerinin elektronik ve manyetik özellikleri kuantum Monte Carlo (QMC) metodu ile açıklanmıştır. Vitamin B12 kobalt (Co) atomu içerdiği ve yarıiletken band aralığına sahip olduğu için onun elektronik ve manyetik özellikleri çok-orbitalli Haldane-Anderson modeli ile tanımlanır. Haldane-Anderson modeli geçiş-metali safsızlık atomu içeren yarıiletken yapıların elektronik özelliklerini açıklar ve safsızlık 3d orbitallerindeki Coulomb etkileşmelerini hesaba katar. Bu modeli çözmek için Hirsch-Fye kuantum Monte Carlo algoritmasını (HFQMC) hiç bir yaklaşım yapmaksızın kullandık. İlk olarak, safsızlık 3d orbitallerinin doluluk oranları ve orbital içi elektronik bağlılıkları hesaplanmıştır. Daha sonra 3d orbitallerinin toplam manyetizasyonu ve 3d orbitalleri arası bağlılıklar açıklanmıştır. Bunun ardından, toplam manyetik alınganlık ve 3d orbitalleri arası manyetik alınganlıklar hesaplanmıştır. Son olarak QMC hesaplarının fiziksel anlamları tartışılmıştır.

Özet (Çeviri)

Metalloproteins are proteins that contain a metal atom. Some metalloproteins include a transition metal such as vitamin B12 (Co) and hemoglobin (Fe) and these structures show semiconducting properties. In this thesis, as an example of metalloproteins, vitamin B12 is studied and electronic and magnetic properties of Co 3d electrons are examined by the quantum Monte Carlo method (QMC). Since vitamin B12 contains a cobalt (Co) atom and has a semiconductor gap, its electronic and magnetic properties can be described by multi-orbital Haldane-Anderson model. Haldane-Anderson model explains the electronic properties of semiconductors which contain a transition metal impurity and considers the onsite Coulomb interactions of impurity 3d orbitals. To solve this model, we use Hirsch-Fye quantum Monte Carlo algorithm (HFQMC) without making any approximations. Firstly, the occupations and intra-orbital electronic correlations of 3d orbitals are calculated. After that, the total magnetization and the inter-orbital correlations of 3d orbitals are obtained. Next, the total magnetic susceptibility and magnetic susceptibilities between the 3d orbitals are calculated. Finally, we discuss the physical meaning of the QMC calculations.

Benzer Tezler

  1. The relationship of urinary matrix metalloproteinase 7 level with renal prognosis and morbidity and mortality in acute renal injury

    Akut renal hasarda artan üriner matriks metalloprotinaz 7 düzeyinin renal prognoz ve morbidite -mortalite i̇le i̇lişkisi

    FADİME ALTINBAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    İç HastalıklarıSelçuk Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN COŞKUN YAVUZ

  2. Düzensiz sistemlerde Bragg yansımalarının mezoskopik dalgalanmalara etkisi ve elektronik korelasyonlar

    Effects of Bragg reflections on mesoscopic fluctuations and electronic correlations in disordered systems

    ERSOY ŞAŞIOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Fizik ve Fizik MühendisliğiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEKİR AKTAŞ

  3. İki boyutlu düzensiz metalik sistemlerde Bragg yansımaları ve elektronik korelasyonların iletkenliğe etkisi

    The Effect of Bragg reflections and of electronic correlations on conductivity in two dimensional disordered metallic systems

    SERKAN ÇALIŞKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Fizik ve Fizik MühendisliğiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEKİR AKTAŞ

  4. Quantum aspects of molecular correlations in biological catalysis

    Biyolojik katalizde moleküler ilintilerin kuantum doğası

    ONUR PUSULUK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyofizikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEREM CANKOÇAK

    PROF. DR. CEMSİNAN DELİDUMAN

  5. Experiments on strongly correlated materials: magneto transport properties of VO2 and V2O3

    Güçlü etkileşimli malzemeler üzerinde deneyler: VO2 ve V2O3 kristallerinin manyeto-taşıyıcı özellikleri

    ENGİN CAN SÜRMELİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Mühendislik Bilimleriİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TALİP SERKAN KASIRGA