Mastitisli ineklerden izole edilen staphylococcus aureus suşlarının moleküler tiplendirmesi
Molecular typing of stapylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis
- Tez No: 365544
- Danışmanlar: PROF. DR. KIYMET GÜVEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Bu çalışmada Afyonkarahisar bölgesinde bulunan 6 farklı yerleşim yerindeki 16 çiftlikten toplanan mastitisli süt örneklerinden izole edilmiş 104 adet bakteri ribotiplendirme yöntemi ile identifiye edilmiş ve Staphylococcus aureus olarak tanımlanan 77 izolat arasındaki genetik akrabalık ilişkisi moleküler tiplendirme yöntemleri ile araştırılmıştır. Ribotiplendirme yönteminde EcoRI restriksiyon enzimi kullanılmış ve 8 ribogrup belirlenmiştir. Atılımlı alan jel elektroforez (Pulsed Field Gel Electrophoresis=PFGE) yöntemi ile 77 izolatın makrorestriksiyon profili SmaI restriksiyon enzimi kullanılarak belirlenmiş ve 19 pulsotip tanımlanmıştır. Ribogruplar ve pulsotipler birbirleriyle çakışmasa da dominant pulsotip olan G11'de yer alan izolatların bir kısmının ribotiplendirmede birbirleriyle %98 benzerlik gösteren ribogrup 2, ribogrup 7 ve ribogrup 8'de yer alan izolatlarla aynı olduğu gözlenmiştir. Benzer şekilde ribogrup 7 ve 8'de yer alan izolatların bir kısmının da PFGE analizinde %98 ve %97 benzerlik oranı gösteren G5, G7 ve G8 pulsotiplerinde yer aldığı belirlenmiştir. Türkiye'de sığırlarda mastitis etmeni S. aureus için ribotiplendirme yöntemi ilk kez bu çalışmada kullanılmış olup, Afyonkarahisar bölgesinde mastitisli sütlerden izole edilen S. aureus izolatlarının gerek ribotiplendirme gerekse de PFGE ile genotipik analizi de ilk kez uygulanmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, 104 bacteria isolated from mastitis milk samples collected from 16 dairies located in 6 regions in Afyonkarahisar were identified by ribotyping method and the genetic relation was investigated between 77 isolates identified as Staphylococcus aureus by using molecular typing methods. By using ribotyping method with EcoRI restriction enzyme eight ribogrups were determined. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) method with SmaI restriction enzyme determined 19 pulstoypes among 77 S. aureus isolates. Although there is no matching between ribogrups and pulsotypes, a dominant pulsotype, G11, contained some isolates of ribogrups 2, 7 and 8 which have 98% similarity. Similarly, ribogrups 7 and 8 included some isolates og pulsotypes G5, G7 and G8 which have 97% and 98% similarity. In Turkey, ribotyping was first used for S. aureus causing mastitis in bovine and also both ribotyping and PFGE methods were first for genotyping of these isolates in Afyonkarahisar region.
Benzer Tezler
- Mastitisli ineklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının plazmit DNA ve protein profili analizleri
Plasmid DNA and protein pattern analysis of Staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis
EMİNE ARSLAN
Doktora
Türkçe
2003
BiyolojiSelçuk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. LEYLA AÇIK
YRD. DOÇ. DR. UÇKUN SAİT UÇAN
- Mastitisli ineklerden izole edilen staphylococcus aureus suşlarının rep-pcr ile tiplendirilmesi
Typing of staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis with rep-pcr method
ALİ İHSAN ALBAYRAK
- Mastitisli ineklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının bazı virulans faktörlere [SPA (Xr ve IgG bağlanma bölgesi), COA, cLFA] göre tiplendirilmesi
Typing of staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis according to some virulance factors [SPA (Xr ve IgG binding region), COA, cLFA]
RUKİYE AYDINALP
- Konya bölgesindeki mastitisli ineklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının real-time PCR ile çeşitli virulans genlerinin (PVL, LukED, ?-hemolizin) kantitatif analizi
Quantitative analysis of various virulance genes (PVL, LukED, ?-hemolysin) by real-time pcr of Staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis in Konya region
SERENGÜL LADİKLİ
- Sığır mastitislerinden izole edilen staphylococcus aureus suşlarında metisilin, vankomisin direnci ve panton-valentine lökosidin varlığının araştırılması
Investigation of methicillin, vancomycin resistance and panton-valentine leukocidin in staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis
MÜESSER YİLMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ŞEKER