ARID3B expression in primary breast cancer samples
Primer meme kanseri örneklerinde ARID3B ekspresyonu
- Tez No: 383301
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
ARID3B, iyi korunmuş DNA bağlanma bölgesi içeren ARID ailesine bağlı bir proteindir. ARID3B'nin birçok fizyolojik ve patolojik süreçte önemli roller oynadığı yapılan çalışmalarla gösterilmiştir. Embriyonel gelişimde özellikle etkili olduğu düşünülen ARID3B, literatürde ortaya konan farklı deneyler ile birçok organ sisteminin gelişimiyle ilişkilendirilmiştir. Nöroblastoma ARID3B ile ilişkisi gösterilmiş, önemli ve sık görülen bir çocukluk çağı tümörüdür. Bu tümör tipinde ARID3B ekspresyon seviyelerinin tümör derecesi ile korele olarak değişiklik gösterdiği gösterilmiştir. Yine nöroblastomalar üzerinde yapılan bir çalışmayla ARID3B'nin bu hücrelerde apopitozu engellediği gösterilmiştir. Over tümörlerinde yapılan bir diğer çalışmada ise ARID3B'nin, nöroblastomalar üzerinde yapılan çalışmadan farklı olarak, TNFα yoluyla apopitozu indüklediği ortaya konmuştur. Grubumuz tarafından yapılan bir çalışmada ise ARID3B meme tümörlü hücre hatlarında, hücre hareketleri ile ilişkilendirilmiştir. Biz de çalışmamızda ARID3B'nin kanser oluşumu ve ilerlemesindeki etkilerini aydınlatabilmek için tüm dünyada kadınlarda en sık görülen kanser olan meme tümörlerinde ARID3B protein ekspresyonunu immünhistokimyasal olarak araştırdık. Formalinle fikse edilmiş ve parafine gömülü 63 primer meme tümörü örneğinde yaptığımız çalışmamızda ARID3B'nin farklı lokalizasyonlardaki ekspresyonunun meme tümörünün tanımlanmış ve belli başlı prognostik parametreleri ile korelasyonunu karşılaştırdık. Çalışmamız sonucunda ARID3B'nin meme tümörlerinde ER ekspresyonu ile pozitif korelasyon göstermekle birlikte tümör derecesi, mitotik aktivite ve HER2 ekspresyonu ile negatif korelasyon gösterdiğini ortaya koyduk. Çalışmamızda çıkan sonuçlar ARID3B'nin meme tümörlerinde ER ve HER2 ekspresyonu ile ilişkisini ilk defa göstermesi açısından oldukça önemlidir. Ancak bu ilişkinin net olarak aydınlatılabilmesi için birçok farklı çalışmaya da ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
ARID3B (AT-rich interaction domain 3) is a member of the family of ARID proteins, which constitutes evolutionarily conserved transcription factors implicated in normal development, differentiation, cell cycle regulation and chromatin remodeling. In addition, ARID3B has been linked to cellular immortalization, epithelial-mesenchymal transition (EMT) and tumorigenesis. Given the emerging roles of ARID3B in tumor development, we examined its expression in primary patient-derived breast cancer samples to further investigate and elucidate the role of ARID3B in cancer pathogenesis and progression. Therefore we used immunohistochemical (IHC) staining procedure using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) blocks of 63 primary breast cancer samples. We compared ARID3B IHC staining according to different cellular localizations with major prognostic factors of breast cancer. Our results show that ARID3B nuclear staining is positively correlated with ER status of the tumor and negatively correlated with tumor grade, mitotic activity and HER2 expression. This study is significant in terms of revealing an important and novel relationship between ARID3B expression and ER and HER2 expression in breast cancer. Further studies will reveal the functional significance of the correlation between ER, HER2 and ARID3B expression which may improve our current knowledge of this relatively novel but potentially interesting protein.
Benzer Tezler
- Expression of ARID3B in breast cancer cell lines
ARID3B'nin meme kanseri hücre hatlarında ifade edilmesi
NİHAN ÖZDEMİRLER
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Functional characterization of MicroRNA-125b expression in MCF7 breast cancer cell line
MikroRNA-125b ifadesinin MCF7 meme kanseri hücrelerinde fonksiyonel karakterizasyonu
SERKAN TUNA
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
GenetikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
YRD. DOÇ. DR. A. ELİF ERSON BENSAN
- Investigation of possible interaction between ARID3A, ARID3B, lncRNAs MALAT1 and NORAD in non-small cell lung cancer (NSCLC)
Küçük hücreli dışı akciğer kanserinde (KHDAK) ARID3A, ARID3B, lncRNA'lar MALAT1 ve NORAD arasındaki olası etkileşimin araştırılması
ŞEDİN NASUH
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABU SHAMEEM MD. SAADAT KHANDAKAR
PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI
- Functional characterization of two potential breast cancer related genes
Meme kanseri ile ilişkili iki genin fonksiyonel karakterizasyonu
SHİVA AKHAVANTABASİ
Doktora
İngilizce
2012
GenetikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. A. ELİF ERSON BENSAN
- Lncrna Erıcd'nin düzenlenmesinde arıd3a'nın rolü
Role of arid3A in the regulation of LNCRNA Ericd
MOHAMMAD KAIFEE ARMAN
Doktora
Türkçe
2017
GenetikGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ECİR ALİ ÇAKMAK