Geri Dön

Orak hücre anemili olgularda miRNA ekspresyon düzeylerinin RT-PCR ile belirlenmesi

Determination of miRNA expression levels on sickle cell anemia cases by RT-PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 386583
  2. Yazar: FİGEN GÜZELGÜL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAKİNE KIYMET AKSOY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Hematoloji, Biyokimya, Hematology, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Anemi-orak hücreli, Hemoglobinopatiler, Mikro RNA, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Prognoz, Anemia-sickle cell, Hemoglobinopathies, Micro RNA, Polymerase chain reaction, Prognosis
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

MikroRNA(miRNA)'lar 18-25 nükleotit uzunluğunda olup mRNA'yı parçalayarak ya da translasyonu engelleyerek gen ekspresyonunu düzenleyen kısa kodlanmayan RNA'lardır. Günümüze kadar 1,872 tipi belirlenen miRNA'lar bir çok hastalığın tanısında ve prognozunda biyobelirteç olarak kullanılmaya başlanmıştır. Yapılan çalışmalarda miRNA'ların hematopoezin düzenlenmesinde ve hematopoetik hücre farklılaşmasında görev aldıkları belirlenmiştir. Anormal hemoglobinler dünyada en sık rastlanılan kalıtsal kan hastalıklarıdır. Hemoglobin A'nın (Hb A) β globin zincirinin 6. amino asidi glutamik asitin valinle yer değiştirmesiyle orak hücre anemisi (Hb S) meydana gelir. Bazı orak hücre anemili olgularda Hb F'in değerinin arttığı ve buna bağlı olarak da klinik seyrin daha ılımlı olduğu gözlenmiştir. Çalışmamızda Hb F düzeyleri yüksek ve normal olan orak hücre anemili ile normal olguların lökosit miRNA'larının ekspresyon düzeyleri RT-PCR yöntemiyle belirlenmiştir. İki grup arasındaki ekspresyon seviyelerinin farklılıkları Mann Whitney U testine göre değerlendirilmiş ve p<0,05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir. Lökosit miRNA'larının ekspresyon seviyelerinin duyarlılıkları, özgüllükleri ve AUC( Area Under Curve)'leri ROC (Receiver Operator Characteristic) analizi ile belirlenmiştir. Çalışmamızda Hb SS'lilerde let-7a, let-7c, let-7d, let-7f, miR-144, miR-320a, miR-320b ve miR-451a tiplerinin daha yüksek düzeyde eksprese edildiği, Hb AA'lılarda ise miR-29a ve miR-141 tiplerinin daha yüksek düzeyde eksprese edildiği gözlenmiştir. Hb SS'lilerde ve Hb AA'lılarda let 7e ve miR-181a tiplerinin ekspresyon düzeylerinin istatistiksel açıdan anlamlı farklılığının bulunmadığı ve miR-96'nın lökosit hücresinde eksprese edilmediği belirlenmiştir. Ayrıca Hb F%<3 olan Hb SS'li olgularda Hb F %>9 olan Hb SS'li olgulara göre miR-144'ün ekspresyon düzeyinin istatistiksel olarak anlamlı derecede arttığı bulunmuştur. ROC analizine göre miR-451a'nın orak hücre anemili olguların prognozunda kullanılabileceği düşünülmüştür.

Özet (Çeviri)

MicroRNAs are short non-coding RNAs of 18-25 nucleotides in length that regulate gene expression via mRNA degradation or translational inhibition.1,872 human miRNA types have been identified so far and they have used as diagnosis and prognosis biomarker in many human diseases. It was found in studies that miRNAs take part in regulating hematopoiesis and hematopoietic cell differentiation. Abnormal hemoglobins are the most common hereditary blood disorder in the World. Sickle cell trait results in substitution of glutamic acid by valine at amino acid position 6 in β globin chains of Hb A. It is observed in some cases with sickle cell anemia that the level of Hb F has increased and the clinical course of these cases found to be milder, accordingly. In our study, the expression levels of leukocyte miRNAs of subjects with sickle cell anemia having high and normal HbF levels and healthy subjects were determined by RT-PCR methodology. Mann-Whitney U test were used to compare miRNA expression levels between groups and p<0.05 value were considered statistically significant. Sensitivity, specificity and AUC for leukocyte miRNAs expression levels were determined using ROC analysis. In this study, while let7 a, let7c, let7d, let7f, miR-144, miR-320a, miR-320b and miR-451a were observed to be over expressed in sickle cell anemia compared to healthy subjects, the opposite is true for miR-29a and miR-141 expressions. We determined that miR-96 is not expressed in leukocyte cells and miR-181a and let7e expression levels are not significantly different between two groups. Furthermore, statistically significant increase in the expression levels of miR-144 was observed in the sickle cell anemia subjects with Hb F levels <3% compared to Hb F levels >9%. According to ROC curve analysis elevated miR-451a expression may be considered to have prognostic value for sickle cell anemia.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    932152

    Orak hücre anemili olgularda miRNA-29C-3P, miRNA-451A ekspresyon düzeylerinin akut ve kronik komplikasyonlar ile ilişkisinin incelenmesi

    Evaluation of the correlation between the expression levels of miRNA-29C-3P, miRNA-451A wi̇th acute and chronic complications in sickle cell anemia cases

    VEDAT AYDIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    İç HastalıklarıMersin Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EYÜP NACİ TİFTİK

  2. Tez No

    729774

    Orak hücre anemili olgularda miRNA ekspresyon düzeyleri ile klinik parametreler arasındaki korelasyonun araştırılması

    Investigation of the correlation between miRNA expression levels and clinical parameters in sickle cell anemia patients

    GİZEM İNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ABDULLAH ARPACI

  3. Tez No

    684629

    Akut göğüs sendromu ile başvuran orak hücre anemili hastalarda mi-RNA düzeyinin krizle ve hastalığın prognozu ile ilişkisinin değerlendirilmesi

    The evaluation of the relation of mi-RNA levels between crisis and prognosis of diseases in sickle cell anemia patients who has referred with acute chest syndrome

    ELVİN MUSTAFAYEV

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    HematolojiÇukurova Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YURDANUR KILINÇ

  4. Tez No

    440039

    Vazookluziv kriz ile başvuran orak hücre anemili hastalarda mikrorna düzeylerinin krizle ilişkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of microrna expression during painful crisis and steady state in sickle cell anemia

    İKBAL TÜRKER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YURDANUR KILINÇ

  5. Tez No

    242803

    Eritrosit Aferezi gerektiren Orak Hücre Anemili hastalarda T hücre (T-Helper/T-Supresör ve Doğal Öldürücü hücre) düzeyleri

    The levels of T cells (T-Helper/T-Suppressor and Natural Killer cells) in patients with Sickle Cell Anemia who undergo Erythrocytapheresis

    FERDA TEKİNTURHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Allerji ve İmmünolojiÇukurova Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YURDANUR KILINÇ

Geri Dön