Geri Dön

Süt ürünleri ve zeytinde bozulmaya neden olan maya türlerinin“real-time PCR yüksek çözünürlüklü erime analizi”ile tanımlanması

Identification of spoilage yeasts in dairy products and olives with real-time PCR high resulotion melting analyses

PDF İndir

  1. Tez No: 387437
  2. Yazar: MİNE ERDEM
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ZÜLAL KESMEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji, Food Engineering, Microbiology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Bozulma, Gıdalar, Mayalar, Degradation, Foods, Yeasts
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Mayalar, tek hücreli ökaryotik mikroorganizmalar olup günümüzde endüstriyel öneme sahip birçok ürünün, ekmek, bira ve şarap gibi çeşitli fermente gıdaların üretiminde büyük ölçüde yararlanılmaktadır. Bununla birlikte birçok maya türü, gıdalarda gelişerek arzu edilmeyen değişikliklere neden olmakta ve sonuçta bu ürünlerin değişik şekillerde bozulmalarına yol açmaktadır. Gıda üretim hattında ve üründe bozulma ya da kalite düşmesine neden olan maya türlerinin hızlı ve doğru bir şekilde tespit edilerek bozulma etkeni türe özgü, koruyucu tedbirlerin alınması, kaliteli bir üretim için zorunludur. Ancak günümüzde mayaların tanımlanmasında yaygın olarak doğruluğu ve tekrarlanabilirliği oldukça düşük olan fenotipik testlere dayalı tanımlama yöntemleri kullanılmaktadır. Dolayısıyla gün geçtikçe gıda mikrobiyolojisi açısından önemleri daha iyi anlaşılan mayaların hızlı ve doğru bir şekilde tespiti için genotipik testlere dayalı alternatif tanımlama yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu nedenle bu tez çalışmasında maya türleri arasında değişkenlik gösteren DNA dizilerine ait yüksek çözünürlüklü erime dereceleri (Tm) ve erime eğrilerinin (HRM analizi) analizini sağlayacak real-time PCR'a dayalı bir tanı yönteminin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla çalışmanın ilk aşamasında, kaymak, yoğurt, peynir ve zeytin gibi çeşitli gıda ürünlerinden izole edilen mayalar (GTG)5 rep-PCR analizi ile tiplendirildikten sonra ITS bölgesini hedef alan dizi analizi ile tanımlanmıştır. Analiz edilen gıda örneklerinin maya florasında Kluyveromyces marxianus ve Debaryomyces hansenii türleri baskın olmakla birlikte bunların dışında Pichia membranifaciens, Pichia fermentans, Pichia kluyveri, Pichia kudriavzevii, Candida zeylanoides, Saccharomyces cerevisiae, Kazachstania servazzii, Kluyveromyces lactis, Saturnispora sp., Kazachstania naganishii, Pichia anomala, Ustilago hordei, Torulaspora delbrueckii, Yarrowia. lipolytica, Clavispora lusitaniae, Candida diversa, Candida sake ve Kazachstania exigua olmak üzere toplam 20 farklı maya türü tanımlanmıştır. Tanımlanan 20 maya türüne ait izolatlar 26S rRNA geni üzerinde D1/D2 bölgesini hedef alan universal NL1-LS2 ve U1-U2 primer setleri kullanılarak real-time PCR HRM ve Tm analizine tabi tutulmuşlardır. Analiz edilen maya izolatlarının U1-U2 bölgesine ait ortalama Tm değerleri 81.482–91.332 °C aralığında, NL1-LS2 bölgesine ait Tm değerleri ise 81.116–88.087 °C aralığında tespit edilmiştir. NL1-LS2 bölgesinin Tm analizi sonucunda 12 maya türünün, U1-U2 bölgesinin analizi sonucunda ise 16 maya türünün Tm değerlerinin istatistiki olarak birbirinden önemli derecede farklı olduğu saptanmıştır. Tm analiz sonuçlarına paralel olarak NL1-LS2 bölgesine ait HRM eğrilerinin 16 maya türü, U1-U2 bölgesine ait HRM eğrilerinin ise 20 maya türü için türe spesifik olduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak, real-time PCR HRM ve Tm analizinin, gıdalarda bozulma yapan mayaların karakterizasyonunda kullanılabilecek hızlı ve kolay uygulanabilen bir yöntem olmasının yanı sıra sadece gıdalarda bozulma yapan maya türlerinin değil birçok mikroorganizma grubunun tanımlanmasında kullanılabilecek potansiyel bir analiz yöntemi olduğu sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Yeasts are eukaryotic microorganisms with single-celled and nowadays they play important role in producing a variety of products which have industrial importance and a variety of fermented foods such as bread, beer and wine. However, a lot of yeast species leads to undesirable changes like spoilage in foods in different ways. The detection of yeast species, which cause decomposition in food products or reduction in quality, accurately and quickly results in taking species-specific precautions. But current identification systems based on phenotypic tests have poor repeatability, expensive and time-consuming. Therefore, it is necessary to develop alternative identification methods depending on genotypic methods, which give fast and reliable results. For this reason, in this study we aim to develop a method depends on the real-time PCR analysis, which enables to analyze the high resolution melting temperature (Tm) and melting curves (HRM) of the DNA sequences. For this purpose, after typing via (GTG)5 rep-PCR analysis, the yeasts isolated from some food products like cream, yoghurt, cheese, and olives were identifed by sequencing using ITS region. Although Kluyveromyces marxianus and Debaryomyces hansenii among yeast species analysed were dominant, 20 different yeast species including, Pichia membranifaciens, Pichia fermentans, Pichia kluyveri, Pichia kudriavzevii, Candida zeylanoides, Saccharomyces cerevisiae, Kazachstania servazzii, Kluyveromyces lactis, Saturnispora sp., Kazachstania naganishii, Pichia anomala, Ustilago hordei, Torulaspora delbrueckii, Yarrowia. lipolytica, Clavispora lusitaniae, Candida diversa, Candida sake and Kazachstania exigua were also identified. The isolates belong to yeast species were subject to real-time PCR HRM and Tm analyses using NL1-LS2 and U1-U2 primers targeting of sequence of D1/D2 region of 26S rDNA. The Tm values of the yeast isolates that produced by U1-U2 primer pair were between 81.482–91.332 °C while the Tm values obtained with NL1-LS2 primer pair were between 81.116–88.087 °C. A total 12 yeast species which were analysed based on the NL1-LS2 region and 16 yeast species which were analysed based on U1-U2 region were showed significantly different Tm values. In similar with Tm analysis results, HRM curves of 16 yeast species belong to NL1-LS2 region and HRM curves of 20 species obtained with analysis of U1-U2 region were found as species specific. As a result it was concluded that the real-time PCR HRM and Tm analyses is a rapid and easy method to be used in the characterization of the spoilage yeasts. It was also a potential analysis that can be used not only to identify the spoilage yeasts but also in the identification of the many of the microorganism groups.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    696339

    Gıda sektöründe sürdürülebilir pazarlama uygulamalarının kullanımı üzerine bir araştırma

    A research on the use of sustainable marketing applications in the food industry

    DİLAY DURMUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Gıda MühendisliğiEge Üniversitesi

    Sürdürülebilir Tarım Gıda Sistemleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAKAN ADANACIOĞLU

  2. Tez No

    944198

    Türkiye'de ulusal diyetin ileri glikasyon son ürünleri miktarı ve ekmeğe ilave edilen üzüm çekirdeği tozunun ileri glikasyon son ürünleri oluşumuna etkisi

    Dietary advanced glycation end products content of national diet in turkey and the effect of grape seed powder added to bread on the formation of advanced glycation end products

    ECE YALÇIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Beslenme ve DiyetetikHacettepe Üniversitesi

    Beslenme Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESLİŞAH RAKICIOĞLU

  3. Tez No

    826908

    Geleneksel sofralık zeytin ve peynirlerden izole edilen laktik asit bakterilerinin gıda endüstrisinde destek kültür olarak kullanım potansiyellerinin araştırılması

    Investigation of the potentials of using lactic acid bacteria isolated from traditional table olives and cheeses as adjunct culture in food industry

    MUSTAFA DURAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇİSEM BULUT ALBAYRAK

  4. Tez No

    163643

    Mide kanseri ve beslenme

    Gastric cancer and nutrition

    ZEKİ KEMEÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    OnkolojiDicle Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. ABDURRAHMAN IŞIKDOĞAN

  5. Tez No

    158120

    Atopik çocukta prick deri testi ve çift kör plasebo kontrol oral besin provakasyonu testi ile besin allerjisi değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    AYŞE YENİGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REMZİYE TANAÇ

Geri Dön