Akciğer kanserinde, hücre çoğalmasına MALAT1'in (Uzun kodlamayan RNA) etkisinin araştırılması
Investigation of cell proliferation of MALAT1 (Long non coding RNA) in lung cancer
- Tez No: 408253
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SERDAR ÖZTUZCU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Akciğer kanseri dünyada en sık görülen ikinci kanser türü olup, erkeklerde kanser ölümlerinin en önde gelen nedenlerinden biridir. Akciğer kanserine neden olan birçok çevresel faktörler olduğu gibi, kodlamayan RNA'larında (ncRNAs) etkisi tartışmasızdır. MALAT1 (metastazla ilişkili akciğer adenokarsinom transkirip1), akciğer kanserinde metastaz ve hücre çoğalmasına bir biyobelirteç ve uzun kodlamayan RNA'dır. Bir lncRNA ailesi olan MALAT1'in, gen ifadesinin araştırılması, hücre çoğalmasına etkisinin belirlenmesi, erken tanıda biyobelirteç olarak katkıda bulunacağından bu çalışmanın yapılmasına karar verildi. miRNA'larla MALAT1'i hedefleyerek yazılım sonrası B-MYB geninin, gen ifadesini yeniden düzenleyerek akciğer kanser hücrelerinin hücre çoğalmasını kontrol altına alınabileceğini düşünmekteyiz. Bu amaçla akciğer kanser hücre hattına (A549) hücre kültür ortamında MALAT1'i hedefleyen miRNA'lara maruz bırakıldı. Bu hücre soyunda total RNA elde edilip, cDNA'ya çevrildi. Real-Time PCR kullanarak MALAT1 ve B-MYB gen ifade düzeyine bakıldı. MiRNA'lara maruz bırakılan A549 hücre soyunun hücre döngüsü ve apoptosiz düzeyini belirlemek için flow sitometri cihazı kullanıldı. Yapılan çalışmada elde edilen bulgulara göre, MiR-503'e maruz bırakılmış hücre hattı, negatif kontrol miRNA, miR-150 ve miR-15a'ya maruz bırakılmış hücre hattına göre MALAT1 ve B-MYB gen ifadesi anlamlı bir şekilde düşük bulunmuştur. Hücre döngüsü ve apoptozis seviyesine bakıldığında miR-503'e maruz bırakılmış hücre soyu diğer miRNA maruz bırakılmış hücre soyuna göre apoptozise giden hücrelerin oranından yüksek, G2/M hücre döngüsüne giren hücrelerin sayısı ve oranından daha düşük bulunmuştur. Sonuç olarak; miR-503 ve miR-150, MALAT1'i hedefleyerek akciğer kanser hücrelerin hücre çoğalmasına baskılayacak ve apoptozise artıracak şekilde etkisi olduğunu MALAT1'in ifade seviyesi, hücre dögüsü ve apoptozis düzeyleri üzerinden yorum yapılabileceği söylenebilir.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is the second most frequently observed cancer type and is mostly responsible for cancer deaths in males. Many environmental factors that can cause lung cancer such as non-coding RNAs (lncRNAs) whıch are undısputed ın lung cancers. Long noncoding RNAs have been studied in many cancers and have been found to be responsible for metastasis, cell proliferation and invasion in several cancer types. The long noncoding RNA MALAT1 (metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1), is a highly conserved nuclear noncoding RNA (ncRNA) and a predictive marker for metastasis and cell proliferation development in lung cancer. Therefore a lncRNA, MALAT1 has been selected for their gene expression studies and for the investigation of MALAT1 as a possible biomarker in diagnosis. It is to be thought that after the downregulation of MALAT1 expression, the alternative splice variant factors of B-MYB control cell proliferation in lung cancer via rearrangement. Taking these in considerations we used Real-Time PCR in order to find out the expression level of MALAT1 and B-MYB in lung cancer cell line (A549). We used flow cytometry to determine the effect in cell proliferation and the level of apoptosis in G2/M. There was a significant decrease in gene expression of MALAT1 and B-MYB in cell line using miR-503 as compared to cell line with negatif kontrol miRNA, miR-150 and miR-15a. When we analysed cell proliferation and apoptosis, there was an increase in the number of cells undergoing apoptosis while there was decrease in the number of cells entering G2/M phase of cell cycle in cells with miR-503 as compared to cells with other miRNAs. As a result it can be concluded that miR-503 and miR-150 has a role in MALAT1 expression, cell proliferation and apoptosis by targeting MALAT1 and has been found to decrease cell proliferation and increase apoptosis of lung cancer cell line.
Benzer Tezler
- Investigation of possible interaction between ARID3A, ARID3B, lncRNAs MALAT1 and NORAD in non-small cell lung cancer (NSCLC)
Küçük hücreli dışı akciğer kanserinde (KHDAK) ARID3A, ARID3B, lncRNA'lar MALAT1 ve NORAD arasındaki olası etkileşimin araştırılması
ŞEDİN NASUH
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABU SHAMEEM MD. SAADAT KHANDAKAR
PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI
- The Role of retinoic acid on C-MYC gene expression and its effects on tumor progression in SCLC
Retinoik asitin C-MYS geni ve küçük hücreli akciğer kanserinin tümör oluşumu üzerine etkileri
MERAL GÜSEY
- Prostat kanser hücre kültürü üzerine acorus calamus bitki ekstraktının etkisi
Plant extract of acorus calamus effect on prostate cancer cell culture
HALİT BUĞRA KOCA
Doktora
Türkçe
2013
BiyokimyaEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER ÇOLAK
- Investigation of drug resistance mechanisms for antiandrogen prostate cancer drug enzalutamide using molecular dynamics simulations
Moleküler dinamı̇k simulasyonları kullanarak prostat kanserı̇nde kullanılan enzalutamı̇d ilacına karşı gelı̇şen ı̇laç dı̇renç mekanı̇zmasının araştırılması
BEHZAD ASLANI AVILAQ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Biyofizikİstanbul Teknik ÜniversitesiBilişim Uygulamaları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEFER BADAY
- Küçük hücreli dışı akciğer kanserinde yoğunlaştırılmış ekspirasyon havasında dna tayini
Dna investigation in the ebc in non-small cell lung cancer
EMİNE AFŞİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Göğüs HastalıklarıAdnan Menderes ÜniversitesiGöğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET POLATLI