Filistin'e özgü koyun ırklarında prp gen genotiplemesi
Genotyping of prp gene in native Palestinian sheep breeds
- Tez No: 455696
- Danışmanlar: PROF. DR. CEMAL ÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Yerli Filistin koyun ırkları, PrP geni, Scrapie, Genotip, Native Palestinian sheep breeds, PrP gene, Scrapie, Genotype
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Scrapie koyunların merkezi sinir sistemini enfekte eden bulaşıcı bir hastalıktır. Prion protein gen PrP polimorfizmleri ki özellikle de kodon 136, 154 ve 171'deki aminoasit değişimleri scrapie hastalığına duyarlılıkla ilişkili bulunmaktadır. Bu çalışmanın amacı Filistin yerli koyun ırklarındaki risk gruplarını belirlemek için PrP genini genotiplendirmektir. Bu çalışmada, İvesi ve Asaf ırkından 38 sağlıklı ve rastgele seçilmiş yerli Filistin koyunu çalışılmıştır. Kan örneklerinden genomik DNA izole edilmiş, çoğaltılmış ve sekanslanmıştır. PrP geninde bulunmuş olan polimorfizmler ARQ, ARR, ARH, AHQ, ARL ve VRQ olacak şekilde 6 allelden ve ARR/ARQ, ARQ/ARQ, ARQ/ARL, ARH/ARQ, ARH/ARL, AHQ/ARQ ve ARQ/VRQ olacak şekilde 7 genotipten meydana gelmektedir. ARQ alleli 0.76 frekansı ile İvesi ve Asaf ırklarında yüksek oranda bulunmuştur. ARR alleli Asaf ırkında bulunmamıştır. Az görülen ARL alleli her iki ırkta da düşük frekanslarda belirlenmiştir.Ayrıca PrP geninin farklı kodonlarında iki farklı polimorfizm (V12I ve L23H) tanımlanmıştır. Sonuçlar genotiplerin çoğunluğunun 3.risk grubuna dahil olduğunu göstermektedir. Homozigot ARR/ARR koyunların dağılımı İvesi ve Asaf populasyonlarında ARR allel frekansını artırmak için önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
Scrapie is an infectious disease that infects the central nervous system of sheep. Polymorphisms of prion protein gene PrP especially the amino acid residue alterations at codons 136, 154 and 171 are found to be associated with susceptibility to scrapie disease. The aim of this study was genotyping of PrP gene in Palestinian native sheep breeds to detect their risk groups. In this study, 38 healthy and randomly chosen local Palestinian sheep belonging to Awassi and Assaf breeds were investigated. Genomic DNA of blood samples was extracted, amplified and sequenced. The polymorphism found out in the PrP gene was made up six alleles ARQ, ARR, ARH, AHQ, ARL and VRQ and 7 genotypes ARR/ARQ, ARQ/ARQ, ARQ/ARL, ARH/ARQ, ARH/ARL, AHQ/ARQ and ARQ/VRQ. The ARQ allele was found to be predominant with frequency 0.76 for Awassi and Assaf. ARR allele in Assaf breed was absent. The rare ARL allele was identified at low frequencies in both breeds. In addition, two different polymorphisms were identified (V12I and L23H) at different codons of PrP gene. Results have indicated that the most of the genotypes belong to risk group 3. Distribution of homozygous ARR/ARR sheep is recommended to increase ARR allele frequencies in Awassi and Assaf populations.
Benzer Tezler
- Erken Hristiyan ve ilk Bizans resim ve kabartma sanatında kaynak ve okullar (2 cilt)
Sources and school of painting and sculpture during the early Christian and first Byzantine period
AHMET MEHMET KİPMEN
- الصهيونية من الحركة إلى الدولة 1897-1948
Siyonist hareketin devlete dönüşüm süreci 1897-1948 / The transformation of the Zionist movement into a state 1897-1948
NEZAR ALTAWEL
Yüksek Lisans
Arapça
2024
Siyasal BilimlerMardin Artuklu ÜniversitesiKudüs ve Filistin Çalışmaları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA KADAD
- Evaluation of biological activities ofMmelia azedarach species and its importance in phytotherapy
Melia azedarach türünün biyolojik aktivitelerinin değerlendirilmesi ve fitoterapideki önemi
KHAWLA ABDALLA MOHAMED ESWIEI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA EROĞLU ÖZKAN
- Detection and molecular diversity of grapevine leaf roll- associated virus 2 and 4 in Palestine
Filistin'de grapevıne leaf roll- assocıated vırus2 ve 4'ün saptanması ve moleküler çeşitliliği
FIDAA S.K. ARAFAH
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU