Geri Dön

Kronik lenfositik lösemide 13q14.3 delesyonunun sitogenetik analiz ve FISH yöntemi ile; mirna-15A ve mirna-16-1'in real time pcr ile incelenmesi

Investigation of 13q14.3 deletion by cytogenetic analysis and fish technique and mirna-15A and mirna-16-1 BY real time PCR in cll

PDF İndir

  1. Tez No: 466654
  2. Yazar: MELİKE YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SENİHA HACİHANİFİOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biology, Genetics, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 164

Özet

Kronik Lenfositik Lösemi (KLL) klinik olarak heterojen bir hastalıktır ve rutin tanıda gözlenen sitogenetik anomaliler klinik öneme sahiptir. KLL'de en sık gözlenen sitogenetik anomali 13q14.3 delesyonudur. Bu delesyon monoallelik, biallelik ve mozaik formlarda gözlenmektedir. KLL hücrelerinin mitotik indekslerinin çok düşük olması, tanı çalışmalarında DSP30 gibi indükleyici ajanların ve FISH gibi moleküler tekniklerin kullanımını gerekli kılmıştır. 13q14.3 kromozom bölgesinden kodlanan hsa-miR-15a ve hsa-miR-16-1 miRNA'ları tümör baskılayıcı miRNA'lardır. Çalışmamızda DSP30+IL-2 ile indüklenmiş ve indüklenmemiş KLL tanılı 30 olgunun perifer kanı materyalleri kullanılmıştır. İndüklenen materyallere, 13q14.3 delesyonunun tespiti için konvansiyonel sitogenetik ve interfaz FISH (iFISH) tekniği uygulanarak sonuçların kıyaslanması ve bunun yanısıra qRT-PZR yöntemiyle tespit edilen, hsa-miR-15a/miR-16-1 ifade seviyelerinin iFISH ile saptanmış olan delesyonlarla ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Elde edilen sonuçlar ışığında miRNA ifade seviyeleri ile KLL patogenezi arasında ilişki olup olmadığının belirlenmesi hedeflenmektedir. 13q14.3 delesyonu konvansiyonel sitogenetik yöntemlerle olguların %8,6'sında, iFISH ile %65,3'ünde saptanmıştır. Olguların %50'sinde mozaik form gözlenmiştir. Olgularımızda; KLL'de gözlenen add(2)(q37), t(2;7)(p11.2;q22) del(6)(q13q21), del(6)(q25), add(9)(q21), del(11)(q23), t(11;14)(q13;q32), del(13)(q11q12), del(13q)(q12q14), add(14)(q23), del(14)(q23), t(14;19)(q32;q13.1), del(15)(q23), del(17)(p12), t(18;22)(q21;q11.2), add(21)(p13), t(17;21)(q11.2;q22), anomalilerinin yanısıra, daha önce bildirildiğini saptayamadığımız t(1;13)(q32;q34), inv(2)(p25q21), del(13)(q22q32), t(14;19)(q24;q13), dup(17)(q21q23), rob(21;21)(p13;p13) gibi yapısal kromozom anomalileri de tespit edilmiştir. Mitotik indeks verileri istatistiksel olarak anlamlı bulunmuş ve DSP30+IL-2'nin mitotik indeksi 2,5 kat arttırdığı saptanmıştır. Hsa-miR-16-1 ifadesindeki azalışlar ile delesyonlar arasındaki ilişki istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Çalışmamız; FISH ve sitogenetik analizlerin birbirini tamamladığını, KLL hücrelerindeki mitotik indeksin artmasında ve kromozom anomalilerin saptanmasında DSP30+IL-2 kullanımının verimli olduğunu ve 13q14.3 kromozom bölgesinin kaybı veya olası diğer düzenleyici mekanizmalarla azalan hsa-miR-16-1'in KLL patogenezinde etkili olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is a clinically heterogeneous disease and cytogenetics abnormalities detected in routine diagnosis are clinically valuable. The most frequent cytogenetic aberration is 13q14.3 deletion and is observed as monoallelic and biallelic types in CLL. Immunostimulatory agents as DSP30 and moleculer techniques as FISH are used in diagnosis due to very low mitotic index of CLL cells. Hsa-miR15a and hsa-miR-16-1 are tumor supressor miRNAs coded from 13q14.3 region. In this study we used peripheral blood materials of 30 CLL patients who were induced and noninduced with DSP30+IL-2. In induced materials we aimed to compare results of conventional cytogenetic and interphase FISH (iFISH) to determine 13q14.3 deletion. Also, we measured expression levels hsa-miR-15a/miR-16-1 by qRT-PCR and compared with deletions detected by iFISH. 13q14.3 deletion was detected in 8.6% of cases by conventional cytogenetic and in 65,3% by iFISH. Mozaic form was observed in 50% of cases. Besides determining common chromosome abnormalities such as add(2)(q37), t(2;7)(p11.2;q22) del(6)(q13q21), del(6)(q25), add(9)(q21), del(11)(q23), t(11;14)(q13;q32), del(13)(q11q12), del(13q)(q12q14), add(14)(q23), del(14)(q23), t(14;19)(q32;q13.1), del(15)(q23), del(17)(p12), t(18;22)(q21;q11.2), add(21)(p13), t(17;21)(q11.2;q22), we also determined t(1;13)(q32;q34), inv(2)(p25q21), del(13)(q22q32), t(14;19)(q24;q13), dup(17)(q21q23), rob(21;21)(p13;p13) which have not been reported previously. Mitotic index data was statistically significant and DSP30+IL-2 increases mitotic index by 2.5 fold. Association between decreased miR-16-1 expression and deletions was statistically significant. We suggest that cytogenetic and FISH analyses are complementary and use of DSP30+IL-2 is effective in detecting chromosomal abnormalities. Decreased expression of hsa-miR-16-1 due to loss of 13q14.3 or other regulatory mechanisms is effective in CLL pathogenesis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    377012

    Kronik lenfositik lösemi hastalarının prognozunda floresan in situ hibridizasyon (FISH) ve CLLU1 ekspresyon çalışmalarının önemi

    Impact of fluorescent in situ hyridization (FISH) aberrrations and CLLU1 expression on the prognosis of chronic lymphocytic leukemia (CLL)

    ÜMMET ABUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. METHİYE GÖNÜL OĞUR

  2. Tez No

    351094

    Kronik lenfositik lösemide aurora-A kinaz ekspresyonu

    Aurora-A kinase expression in chronic lymphocytic leukemia

    DENİZ ÇETİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    HematolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VEFKİ GÜRHAN KADIKÖYLÜ

  3. Tez No

    740345

    Kronik lenfositik lösemide immünglobulin ağır zincir mutasyonunun değerlendirilmesi

    Evaluation of immunglobulin heavy chain mutation in chronic lymphocytic leukemia

    MEHMET BERK ÖRÜNCÜ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    HematolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖNDER ARSLAN

  4. Tez No

    536485

    Kronik lenfositik lösemide SF3B1 ve MYD88 genlerindeki varyasyonların araştırılması

    Investigation of SF3B1 and MYD88 gene variations in chronic lymphocytic leukemia

    GÖZDE CİMŞİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikTrakya Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİLMİ TOZKIR

  5. Tez No

    171618

    Kronik lenfositik lösemide ZAP-70 ve CD38 ekspresyon düzeylerinin hastalığın progresyonu üzerine etkisi

    Başlık çevirisi yok

    ÜMİT BARBAROS ÜRE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Hematolojiİstanbul Üniversitesi

    PROF.DR. BURHAN FERHANOĞLU

Geri Dön