Geri Dön

Transcriptional control of Stim1 gene by transcription factor NEUROD2

Stim1 geninin transkripsiyon faktörü NEUROD2 tarafından transkripsiyonel kontrolü

PDF İndir

  1. Tez No: 473030
  2. Yazar: FATMA SADİFE İŞLEYEN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. GÜLAYŞE İNCE DUNN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Nöroloji, Biology, Genetics, Neurology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

Bazik heliks-lup-heliks transkripsiyon faktörü ailesinin bir üyesi olan Neurogenic differentiation factor 2 (NEUROD2) beyin gelişiminde önemli rol oynar. Laboratuvarımızda yapılan çalışmalar, Stim1 geninin NEUROD2'nun hedef genleri arasında ilk sıralarda olduğunu ortaya çıkarmıştır. STIM1 endoplazmik retikulum kalsiyum depolarının sensörü olarak görev yapar. Kalsiyum depo seviyeleri azaldığında, STIM1 store-operated-calcium-entry (SOCE) aktivasyonunu sağlar. NEUROD2 Stim1 geni üzerinde intronik bir elemente bağlanarak STIM1 gen ifadesini regüle eder. Tezim üç ana kısımdan oluşmaktadır. Birinci kısımda, NEUROD2'nin Stim1 intronic elemente bağlanmasının işlevlerini inceledim. NEUROD2'nin Stim1 intronik elemente bağlandığında bir represör olarak çalışmadığını buldum. Aslında, sonuçlarım NEUROD2'nin bir insulator kompleksinin parçası olarak çalıştığını önerir. İkinci kısımda, NEUROD2'nin kortikal nöronlarda SOCE üzerindeki etkisini inceledim. Sonuçlarım NEUROD2 overekspresiyonunun 5 day in vitro'da (5DIV) nöronal SOCE yanıtında bir değişikliğe neden olmadığını gösterir. Ayrıca, NEUROD2 seviyesini baskılamanın nöronal SOCE yanıtına 5 DIV'de etkisini de inceledim fakat sonuçlarım bir kanıya varmak için yetersizdi. Son kısımda, NEUROD2 bağlanma bölgesini içeren ve 4 E-box motif bulunduran Stim1 intronik elementi CRISPR-Cas9 genom editleme sistemi ile silmeyi amaçladım. Bu silinmenin etkileri incelendiğinde, Stim1 gen ifadesinin NEUROD2 regülasyonunun kortikal gelişim üzerindeki işlevleri daha iyi anlaşılabilir.

Özet (Çeviri)

Neurogenic differentiation factor 2 (NEUROD2) transcription factor, a member of basic helix-loop-helix transcription factor family, have essential roles in brain development. Studies performed in our laboratory have revealed Stim1 gene among the top targets of NEUROD2. STIM1 functions as a sensor of endoplasmic reticulum (ER) calcium store levels. Upon store depletion, STIM1 activates store-operated calcium entry (SOCE). NEUROD2 binds to an intronic element within Stim1 gene and regulates its expression. My thesis is composed of three major parts. In the first part, I investigated the functions of NEUROD2 by binding to Stim1 intronic element. I found that NEUROD2 does not function as a repressor by binding to Stim1 intronic element. Indeed, my results suggest that NEUROD2 might function as part of an insulator complex. In the second part, I investigated the effect of NEUROD2 on SOCE in cortical neurons by calcium imaging. My results indicated that the overexpression of Neurod2 does not cause a change in neuronal SOCE response at 5 day in vitro (5DIV). I also tested the effect of Neurod2 knock-down on neuronal SOCE response at 5DIV but my results were inconclusive. In the last part, I aimed to delete Stim1 intronic region comprising clustered E-boxes where NEUROD2 binds to by using CRISPR-Cas9 genome editing system. A better understanding of functions of NEUROD2 regulation of Stim1 expression can be developed by examining the effects of this deletion in the context of cortical development.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    435862

    Neurogenic transcription factor control of store-operated calcium entry in cortical neurons

    Nörojenik yazılım faktörünün kortikal nöronlardaki depo-işletimli kalsiyum girişi üzerindeki kontrolü

    GÖKHAN GÜNER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜLAYŞE İNCE DUNN

  2. Tez No

    754039

    Glomerülonefrit şüphesi olan hastalarda NFAT gen ailesi üyelerinin farklı ifade profillerinin incelenmesi

    Investigation of NFAT gene family member's differential expression profiles in glomerulonephritis suspected cases

    UYGAR GENİŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    NefrolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BUKET KOSOVA

  3. Tez No

    271525

    SIK2'nin adiposit farklılaşmasındaki rolünün incelenmesi

    The role of SIK2 in adipocyte differentiation

    HALE HEBİP

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Moleküler TıpGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERRUH ÖZCAN

  4. Tez No

    468868

    Modulation of glucocorticoid ınduced tumor necrosis factor receptor (GITR)-gıtr ligand (GITRL) ınteraction in breast cancer cells under the control of ataxia telangiectasia mutated (ATM) promoter

    Meme kanseri hücrelerinde glukokortikoid ile indüklenen tümör nekroz faktör reseptör (GİTR)- GİTR ligand (GİTRL) etkileşiminin ataksi-telenjiektazi mutasyona uğramiş (ATM) geni promotor kontrolü altinda değerlendirilmesi

    BENGİSU ULUATA DAYANÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    GenetikHacettepe Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜNEŞ ESENDAĞLI

  5. Tez No

    791432

    ETS gene regulation in neuronal differentiation: Transcriptomic analysis and evolutionary aspects

    Transkriptomik ve evrimsel yaklaşımla nöronal faklılaşmada ETS gen düzenlenmesi

    YİĞİT KORAY BABAL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. IŞIL KURNAZ

Geri Dön