Geri Dön

Determination of p53 mutations in cancerous and immortalized cells of mesothelium

Mezotelyumun kanserli ve ölümsüzleştirilmiş hücrelerinde p53 mutasyonlarının belirlenmesi

  1. Tez No: 473089
  2. Yazar: TWANA ZAKARIYA AZZAT
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Moleküler Tıp, Tıbbi Biyoloji, Molecular Medicine, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 81

Özet

Kısaca p53 olarak da bilinen TP53 oldukça iyi tanımlanmış insan tümör baskılayıcı genlerinden biridir. Gen 12 exon vee 11 introndan oluşmaktadır ve 17. Kromozom üzerinde bulunur. (17p13.1). TP53 geni p53 proteinini kodlar ki bu protein DNA onarımı, hücre döngüsünün düzenlenmesi, apoptoz gibi önemli fizyolojik ve patolojik birçok işlemde, görevli proteinlerin ifadelerini yönetmek suretiyle rol alır. TP53 geninde bulunan mutasyonlar organizma için oldukça zor durumlar oluşturur ki bunlardan biri de insanda kanserin gelişmesidir. TP53 geninin yaşamsa değeri olduğunu söylemek yanlış olmaz; öyle ki, bugüne kadar TP53'deki mutasyonlar meme, kolon, rahim ve mezotelyum gibi doku ve organların kanserleriyle ilişkilendirilmiştir. Mezoteliyoma, mezotelyum dokusundan gelişen oldukça öldürücü bir kanser türüdür. Bu kanser genellikle akciğer (Plevral Mezotelyoma), kalp (Perikardiyal Mezotelyoma), ve karın (Peritonyal Mezotelyoma) yüzeyini kaplayan zarsı dokuda gelişir. Asbestos, bir karsinojen olarak değerlendirildiğinden beri, mezotelyomanın başlıca nedeni olarak değerlendirilmektedir. Öyle ki gözlenen mezotelyoma vakalarının %80'ı asbestos kaynaklıdır. Bunun yanında, eriyonite maruziyet ve genetic yatkınlık da mezotelyoma gelişimine katkıda bulunan önemli faktörlerdendir. TP53 gibi genlerdeki mutasyonların analizi bu kansere doğru oluşabilecek genetic meyilleri ortaya çıkarmak için oldukça önemli ve gereklidir. Bu çalışmada mezoteliyoma kanseri hücre hattı (ATCC 5946) ve ölümsüzleştirilmiş mezotelyum hücrre hattı (AG07086/LP9) hücrelerinin TP53 genlerinde bulunabilecek mutasyonlardan 1, 2, 5, 6, 8, 9 ve 11. ekzonlarda bulunabilecek olanları belirlemek amaçlanmıştır. Bu maksatla, ilgili hücreler uygun koşullarda yetiştirilmiş ve hücrelerden DNA izolasyonu yapıldıktan sonra ilgili primerler kullanılarak PCR ve sekanslama gerçekleştirilmiştir. Sonuç olarak; kanser hücrelerinde biri ekzon 2 ve biri ekzon 9'da olmak üzere iki mutasyon bulunmuş iken ölümsüzleştirilmiş hücre hattında yalnızca ekzon 2'de bir mutasyon belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

TP53 gene (also known as p53), is one of the well characterized tumor suppressor genes in human. It consists of 11 exons and 10 introns, and is located at chromosome 17 (17p13.1). TP53 encodes p53 protein involving in physiological and pathological processes including DNA repair, cell cycle regulation and apoptosis by regulating expression level of several genes. The mutations in TP53 gene usually accompany with severe disorders especially cancer. Thus, TP53 gene has a vital importance for human healthy. Up to date, a linkage between TP53 and several cancer types including breast, colorectal, ovarian, and mesothelioma has been demonstrated. Mesothelioma is one of the most aggressive fatal types of cancer developing in the cell of mesothelial membranes. Mesothelioma is mainly observed in the lining of the lungs (Pleural Mesothelioma), heart (Pericardial Mesothelioma), and abdomen (Peritoneal Mesothelioma). Asbestos has been accepted as a main cause of mesothelioma (more than 80% of cases) since the discovery of asbestos as a carcinogen. Besides the erionite exposure and genetic predisposition are also assumed to be involved in the formation of malignant mesothelioma. The analyzing of mutations in genes like TP53 has crucial importance in terms of the identification of genetic predisposition profile. The investigation of TP53 mutations in mesothelioma caner cell line and an immortalized cell line derived from mesothelial tissue was aimed in this study. For this aim, human immortalized mesothelial cell (AG07089/LP-9) and a pleural mesothelioma cell line were cultured under appropriate conditions. After DNA isolation, some exons of TP53 gene (1, 2, 5-6, 8-9, and 11) were amplified by Polymerase Chain Reaction. The amplicons were sequenced by Sanger method. As a result, two mutations in TP53 gene were characterized in mesothelioma cell; one in the 3-UTR of exon 2, one in again 3-UTR of exon 9. In the immortalized cell line, on the other hand, only one mutation located in exon 2 has been identified.

Benzer Tezler

  1. BRCA1 185delAG, 5382insC ve BRCA2 6174delT, V2466A mutasyonlarının multipleks polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile tek adımda belirlenmesi

    Determination of BRCA1 185delAG, 5382insC ve BRCA2 6174delT, V2466A mutations with multiplex polymerase chain reaction method in A single step

    MERVE TECER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Genetikİstanbul Bilim Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. VEYSEL SABRİ HANÇER

  2. p53 mutations as a source of aberrant beta-catenin accumulation in cancer cells

    Kanser hücrelerindeki sıradışı beta-katenin birikimine p53 mutasyonunun katkısı

    TOLGA ÇAĞATAY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  3. Determination of the effects of actinic keratosis mutations on apoptosis

    Aktinik keratozlardaki P53 mutasyonlarının apoptoz üzerindeki etkisinin incelenmesi

    AYŞE ERCAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    BiyokimyaHacettepe Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İZZET HAMDİ ÖĞÜŞ

  4. Akciğer kanserinde KRAS ve p53 ko-mutasyonuna bağlı gelişen anti-PD-L1 direncinin belirlenmesine yönelik moleküler gen biyobelirteçlerin belirlenmesi

    Identification of molecular gene biomarkers for the determination of anti-PD-L1 resistance due to KRAS and p53 co-mutation in lung cancer

    OĞUZHAN AKGÜN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERDA ARI

  5. Pankreas, safra kesesi ve safra yolları kanserlerinde serumda p53 protein tayini

    Determination of p53 protein in serum in pancreatic, gallbladder and bile duct cancers

    HALDUN KAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Genel CerrahiSağlık Bakanlığı

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    UZMAN OP DR BURHAN YOLCUOĞLU