Geri Dön

Molecular screening of verticillium wilt resistance in upland cotton using SSR markers

Verticillium solgunluğu hastalığına dayanıklı pamuk genotiplerinin SSR markörleri ile moleküler tespiti

  1. Tez No: 474266
  2. Yazar: AMNA SAEED
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EMİNUR ELÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitkisel Üretim Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 90

Özet

Verticillium solgunluğu (VS) hastalığı, dünya çapında pamuk üretim alanlarında ciddi bir problem olarak kabul edilmekte olup önemli ürün kalite ve verim kayıplarına neden olmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye'deki bazı Upland pamuk çeşitlerinin Basit dizi tekrarları (SSR) markörleri ile taranması amaçlanmıştır. Bu amaçla, farklı araştırma enstitülerinden 50 adet pamuk genotipi toplanmış ve markörler ile taranmıştır. Genomik DNA ekstrakte edilmiş ve SSR markörlerin çoğaltılması için polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizleri yapılmıştır. Moleküler veri analizi için SSR markörlerin polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) değerleri hesaplanmıştır. PBİ değerleri, DPL0022 ve DPL752 markörlerinin en iyi markörler olduğunu ortaya koymuştur. Testlenen markörler arasında VS'ya dayanıklılığı kontrol eden kantitatif karakter lokuslarına (QTL) bağlantılı olduğu tespit edilmiş JESPR65, GH215 ve DPL0022 markörlerinin PBİ yüksek olduğu ve marköre dayalı seleksiyon çalışmaları için umut verici oldukları belirlenmiştir. Ayrıca, analiz edilen elyaf kalite markörleri arasında CIR381, CIR246 ve DPL405 oldukça polimorfik bulunmuştur. Kümelenme analizleri sonuçlarına göre, dayanıklı çeşit olarak bilinen Julia ve N-87 çeşitleri, diğer tüm çeşitlerden belirgin olarak ayrılmış ve birbirleriyle yakından ilişkili olduğu bulunmuştur. Belirlenen bu çeşitlerin ileri ıslah çalışmalarında kullanılabileceği düşünülmektedir. Mevcut çalışmanın sonuçları, VS hastalığına dayanıklı pamuk çeşitlerinin ıslahında marköre dayalı seleksiyon stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olacaktır.

Özet (Çeviri)

Verticillium wilt (VW) is one of the major factors resulting in huge cotton yield losses. The hiking problem of VW in cotton incurs heavy economic losses around the world as well as in Turkey. The objective of the current study was to screen upland cotton cultivars by simple sequence repeats (SSR) markers in Turkey. Fifty different cultivars collected from various research institutes were screened in the current study. Genomic DNA was extracted and polymerase chain reaction (PCR) was conducted to amplify the SSR markers. For the molecular data analysis, polymorphism information content (PIC) values of molecular markers were calculated. PIC values revealed that DPL0022, and DPL752 were the most informative markers. Among the tested markers that are linked to QTL for VW resistance, only the markers JESPR65, GH215 and DPL0022 were found to be very informative and promising for MAS studies. Moreover, among the analyzed fiber quality markers, CIR381, CIR246 and DPL405 were found to be very polymorphic. Based on the cluster analysis, cultivars Julia and N-87, which are known as resistance cultivars, were distinctly separated from all the cultivars and closely related with each other. The identified cultivars can be used in the further breeding programs. The current study will be helpful for the development of marker-assisted strategies for breeding of VW resistant cotton cultivars.

Benzer Tezler

  1. Pamukta Verticillium solgunluğuna dayanıklılık için germplasm taraması ve moleküler markör geliştirme

    Molecular marker improvement and germplasm screening for verticillium wilt resistance in cotton

    HATİCE ÇOKKIZGIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YÜKSEL BÖLEK

  2. Bacillus cinsine ait yerel bakteri izolatlarında kitinaz genlerinin taranması ve bu izolatların antifungal aktivitelerinin araştırılması

    Screening of chitinase genes from local Bacillus isolates and testing their antifungal activity

    ZEHRA BÜŞRA AZİZOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiErciyes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ

  3. The molecular screening of the virulence gene and blaCTX gene of resistant Salmonella typhi in Iraq

    Irak'ta dirençli Salmonella typhi'nin virülans gen ve blaCTX geninin moleküler taraması

    MUSTAFA ABBOOD MOHAMMED MOHAMMED

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAMAZAN SERDAR ESMER

    DR. NABEEL AHMED RAJAB ALAARAJY

  4. Molecular analysis of frontotemporal dementia, progressive supranuclear palsy and Parkinson's disease models for two major classes of neurodegenerative disease: Tauopathies and alfa-synucleinopathies

    Frontotemporal demans, progressif supranükleer palsi ve parkinson hastalığının moleküler analizi nörodejeneratif hastalıkların başlıca iki sınıfı için modeller: Tauopatiler ve alfa-sinükleinopatiler

    MEHMET OZANSOY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2000

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A. NAZLI BAŞAK

  5. Soğan Sak nematodu (Ditylenchus dipsaci)' nun sarımsak bitkisinde moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) on garlic

    ZEKİ MUTLU AKAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyoteknolojiKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU