Geri Dön

Analysis of the effect of novel PKC isozymes on autophagy and utilization of nanoparticles as a new therapeutic approach for gaucher disease

PKC izozimlerinin otofaji üzerindeki etkisinin analiz edilmesi ve gaucher hastalığı için yeni bir tedavi yaklaşımı olarak nanoparçacıkların kullanılması

PDF İndir

  1. Tez No: 478675
  2. Yazar: ÖZLEM YEDİER
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. DEVRİM GÖZÜAÇIK, YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM KUTLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 85

Özet

Otofaji, hücre içindeki dengeleri koruyabilmek için uzun ömürlü proteinleri ve fonksiyonel olmayan organelleri parçalayan bir mekanizmadır. Hücre içerisinde, enerji ihtiyacının düzenlenmesinden, besin dengesine ve patojenlere karşı savunmaya kadar çeşitli bir çok görevi olduğu bulunmuştur. Bu mekanizmadaki kusurlar veya anormallikler kanser ve nörodejenerasyonu da kapsayan çeşitli hastalıklarla ilişkilidir. Protein Kinaz C (PKC) izozimleri, hücrenin içinde birçok farklı rolü olan büyük bir serin-treonin kinaz ailesidir. Farklı PKC izozimleri, aynı hücresel yolakta benzersiz ve karşıt fonksiyonlara sahip olabildikleri gibi, aynı PKC izozimi farklı uyaranlara göre farklı işlevler görebilir. Birçok çalışmada, PKC izozimlerinin otofaji yolağında, çoğunlukla indüksiyon aşamasındaki etkileri gösterilmiştir. Ancak, çalışmaların çoğunda, belirli etkiden sorumlu olan spesifik izozim veya etki mekanizmaları tamamen aydınlatılamamıştır. Bu çalışmada, aktif PKC izozimlerinin otofaji üzerindeki etkisi PMA kullanılarak analiz edilmiş ve PMA'in otofaji üzerindeki etkisinden sorumlu olabilecek aday PKC izozimleri bulunmuştur. Diğer yandan, PMA'in etkisinin sadece insan kanser hücrelerinde değil, fare primer fibroblast hücrelerinde de korunmuş bir mekanizma olduğu gösterilmiştir. Ek olarak, PKC izozimlerinin etkisini otofaji yolağına bağlayan hedef proteinler bulmak amacıla Lentiviral transdüksiyon yöntemi oluşturulmuş; virüs üretimi ve enfeksiyon için optimum koşullar belirlenmiş; enfekte olmuş hücreleri seçmek için kullanılacak antibiyotik konsantrasyonu tespit edilmiştir. Lizozomal enzimlerdeki bozukluklar, arızalı otofajinin ve lizozomal depo hastalıklarının temel sebebidir. Gaucher Hastalığı, glukoserebrosidaz enzimini ifade eden GBA1 genindeki mutasyonlardan kaynaklanan dünyanın en yaygın lizozomal depolama hastalığıdır. Bu çalışmada, bozulmuş otofaji mekanizmasını yeniden aktive edebilmek için alternatif bir metodoloji olarak asidik nanopartiküller kullanılmış ve alkalize olmuş lizozomların düzeltilmesiyle hücre içindeki glukozilseramid substratı birikiminin azalması sağlanmıştır.

Özet (Çeviri)

Autophagy is a mechanism that degrades long-lived proteins and non-functional organelles to sustain cellular homeostasis. It is implicated in many processes inside the cell ranging from regulation of energy and nutrient balance to the defence against pathogens. Defects or abnormalities in this mechanism are associated with various diseases including cancer and neurodegeneration. Protein Kinase C (PKC) isozymes are a large family of serine-threonine kinases that have many roles inside the cell. Each PKC isozyme might have unique and opposing functions in the same cellular pathway or same PKC isozyme can function differentially upon different stimuli. Several studies showed the relations of PKC isozymes in autophagy pathway mostly in the induction step. However, in most of the cases, complete mechanisms or the specific isozyme responsible from the particular effect was not identified. In this study, the effect of active PKC isozymes on autophagy was analyzed and candidate PKC isozymes, that are important for the modulation of autophagy by PMA were identified. In addition, the effect was shown as a conserved mechanism not only for human cancer cells but also mouse primary fibroblast cells. Moreover, lentiviral transduction method was established in order to use a lentiviral shRNA library for screening the target molecules functioning as effectors between PKC isozymes and autophagy. Optimum conditions for lentivirus production and transduction were investigated and the precise antibiotic concentration was identified for further screening. Defects in lysosomal enzymes are the main cause of malfunctional autophagy and thus lysosomal storage diseases. Gaucher Disease is the most common lysosomal storage disease around the world that results from mutations in GBA1 gene which expresses glucocerebrosidase enzyme. In this study, acidic nanoparticles were utilized as an alternative methodology to functionalize impaired autophagic flux and alkalinized lysosomes were corrected which eventually lead to decrease in the accumulation of glucosylceramide substrate in mutant cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    689388

    Beyazlatma ajanlarının güncel CAD/CAM materyallerinin yüzey pürüzlülüğüne etkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of the effect of bleaching agents on the surface roughness of novel cad/cam materials

    ELİF ECE AYDIN

    Diş Hekimliği Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Diş HekimliğiOrdu Üniversitesi

    Protetik Diş Tedavisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERSAN ÇELİK

  2. Tez No

    551335

    Difüzyon tabanlı nano ağlarda Amyloid Beta'nın moleküler haberleşme üzerindeki etkisinin analizi

    Analysis of effect of Amyloid Beta on molecular communication in diffusion based nanonetworks

    İBRAHİM IŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Biyomühendislikİnönü Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET EMİN TAĞLUK

  3. Tez No

    506666

    Isolation of novel Quorum quenching bacteria for the control of membrane biofouling and the effect of Bacillus sp. T5 and Delftia sp. T6 on microbial community structure in membrane bioreactor

    Membran biyotıkanmasının kontrolü amacıyla yeni Quorum quenching bakterilerinin izolasyonu ve Bacillus sp.T5/Delftia sp. T6 türlerinin membran biyoreaktördeki mikrobiyal komüniteye etkisinin belirlenmesi

    BAHAR YAVUZTÜRK GÜL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU

  4. Tez No

    302390

    Development of novel functionalized solid phase extraction (SPE) sorbents and solid phase microextraction (SPME) fiber coatings for analytical applications

    Analitik uygulamalar için işlevselleştirilmiş yeni katı faz ekstraksiyon (SPE) ve katı faz mikroekstraksiyon (SPME) fiber kaplamalarının geliştirilmesi

    EZEL BOYACI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Kimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET E. EROĞLU

  5. Tez No

    513698

    Analysis of movement disorder-related genes following the knockdowns of ANO10, WDR81, and VLDLR in zebrafish( danio rerio )

    Zebrabalığında hareket bozukluguyla ilişkilendirilen ANO10, WDR81 ve VLDLR genlerinin susturulduğu modelde incelenmesi

    GÖKSEMİN FATMA ŞENGÜL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. MICHELLE MARIE ADAMS

Geri Dön