Geri Dön

Meme, akciğer ve prostat kanserinin ortak miRNA'larının meta analiz ile belirlenmesi ve biyobelirteç olarak kullanım potansiyellerinin araştırılması

Determining miRNAs commonly expressed in breast, lung and prostate cancer by meta-analysis and investigation of their potential use as biomarkers

  1. Tez No: 479653
  2. Yazar: GİZEM ÖRS
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SULTAN GÜLÇE İZ, PROF. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ, PROF. DR. ZEKİYE SULTAN ALTUN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 114

Özet

Bu tez kapsamında; meme, akciğer ve prostat kanserinin erken teşhisi için kullanılabilecek ortak miRNA biyobelirteçlerini tanımlamak amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda, meme, akciğer ve prostat kanseri ekspresyon profili veri setleri meta-analiz yaklaşımı ile incelenmiş ve biyolojik belirteç olarak tanımlanan miRNA'ların potansiyelleri araştırılmıştır. Meme, akciğer ve prostat kanseri için seçilen 6 veri kümesinde rank tabanlı meta-analiz yöntemi uygulanmış, 24 adet ortak miRNA bulunmuştur. KEGG yolları ve Gen Ontolojisi (GO) kategorileri tanımlandı. Ayrıca deneysel validasyonu amacıyla meta-analiz ile belirlenen miR-145-3p temin edilerek ekspresyon analizi incelenmiştir. Üç farklı kanser sınıfını temsil eden 11 adet hücre hattında miR-145-3p'nin ekspresyon seviyesi araştırılmıştır. Hücrelerin, normoksi (atmosferik O2) koşullarına ek olarak, hipoksi koşullarında ve serum yoksunluğunda metastaz eğilimleri artırılarak miR-145-3p'nin ekspresyon seviyesindeki değişikler belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this thesis, it is aimed to define common miRNA biomarkers that can be used for the early detection of breast, lung and prostate cancers. For this purpose, breast, lung and prostate cancer expression profile data sets were examined by meta-analysis approach and the use potentials of miRNAs identified as biomarkers were investigated. A rank-based meta-analysis method was applied to selected 6 data sets for breast, lung and prostate cancer, and 24 common miRNAs were found. KEGG pathways and Gene Ontology (GO) categories were identified. Expression analysis was also examined by providing miR-145-3p determined by meta-analysis for experimental validation. The expression level of miR-145-3p in 11 cell lines representing three different cancer classes was investigated. In addition to normoxic conditions (atmospheric O2), changes in the expression level of miR-145-3p have been determined by increasing the metastatic properties of cell cultures under hypoxic conditions and serum deprivation.

Benzer Tezler

  1. Investigation of the localization pattern and the role of anti apoptotic BAG-1 in healthy and tumor tissues from patients with breast carcinoma

    Meme kanserli hastalardan alınan sağlıklı ve tümörlü dokularda anti-apoptotik BAG-1 proteininin rolü ve lokalizasyonunun incelenmesi

    JALE YILDIZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  2. Meme tümörlerinin çok geniş bantlı radar tabanlı mikrodalga yöntemiyle tespiti

    Detection of the breast tumors by ultra-wideband radar based microwave method

    ALİ RECAİ ÇELİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiDicle Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED BAHADDİN KURT

    PROF. DR. SELÇUK HELHEL

  3. A study of polymorphic variants of repairing genes in breast cancer and comparison of patient diets in Iraqi population

    Meme kanserinde onarıcı genlerin polimorfik varyantları ve Irak nüfusunda hasta beslenmelerinin karşılaştırılması üzerine bir çalışma

    HUDA SALİH MEZAAL MEZAAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiAltınbaş Üniversitesi

    Biyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE SEÇMELER

  4. Development of an aprotinin-based novel nano-bioconjugate utilizing microfluidics via 3D cancer spheroid models

    3D kanser sferoid modelleri aracılığıyla mikroakışkanlar kullanılarak aprotinin tabanlı yeni bir nano-biyokonjugatın geliştirilmesi

    FAIQA NAZIR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyomühendislikİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. GÜRKAN YEŞİLÖZ

    DOÇ. DR. AMIRHOUSHANG BAHRAMI

  5. Romatoid artritli hastalarımızda malignite gelişme sıklığı ve malignite gelişmesinde etkili olabilecek faktörlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of the incidence of malignancy in our patients with rheumatoid arthritis and the factors that may be effective in the development of malignancy

    ONUR TAŞCI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    RomatolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY KINIKLI