Bakteriyel enfeksiyonlara karşı kahverengi alabalıklarda gen ekspresyonunun belirlenmesi
Determination of brown trout gene expression after bacterial infection
- Tez No: 482563
- Danışmanlar: PROF. DR. İLHAN ALTINOK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Fisheries Technology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Bu çalışmada, kahverengi alabalıkların (Salmo trutta labrax, S. t. caspius ve S. t. abanticus) ve bunların hibritlerinin Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae'nın sebep oldukları hastalıklara karşı gösterdikleri tepkilerin gen ekspresyonu yöntemi ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Antioksidan ve bağışıklık sistemi ile alakalı 12 farklı genle [Catalase (CAT), Superoxide dismutase (SOD), Glutathione peroxidase (GPx), Glutathione reductase (GR), Cold-inducible RNA-binding protein (CIRBP), Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (CDKN2A), Prothymosin alpha 1 (ProT alpha 1), Transforming protein RhoA (RhoA), Immunoglobulin light chain (AL), Major histocompatibility complex class I (MHC class I), Hemoglobin subunit beta (HBB), Stanniocalcin precursor (STC)] birlikte internal kontrol olarakta bata aktin geninin ekspresyonundaki değişimler, Real-Time PZR ile EvaGreen kullanılarak analiz edilmiştir. Balıklar L. garvieae ile enfekte edildikten sonra oksidatif stres genleri ve bağışıklık sistemiyle ilgili genlerin rölatif gen ekspresyonu bazen artış bazen de azalış göstermesine rağmen, genel olarak CC grubu dışında ki gruplarda 14. günden sonra rölatif gen ekspresyonu azalmıştır. Lactococcus garvieae enfeksiyonuna en fazla tepki veren CC grubu olmasına rağmen Y. ruckeri enfeksiyonuna karşı ise en az tepki veren grup olduğu tespit edilmiştir. Balıklarda görülen gen ekspresyonu farklılıkları balıklara ve hastalık etkenine göre farklılıklar göstermiştir.
Özet (Çeviri)
In the present study, brown trout species (Salmo trutta labrax, S. t. caspius and S. t. abanticus) and their hybrids were exposed to Yersinia ruckeri causative agent of yersiniosis disease and Lactococcus garvieae causes lactococcosis diseases to test antioxidant and immune related genes expression. For this purpose, Catalase (CAT), Superoxide dismutase (SOD), Glutathione peroxidase (GPx), Glutathione reductase (GR), Cold-inducible RNA-binding protein (CIRBP), Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (CDKN2A), Prothymosin alpha 1 (ProT alpha 1), Transforming protein RhoA (RhoA), Immunoglobulin light chain (AL), Major histocompatibility complex class I (MHC class I), Hemoglobin subunit beta (HBB) and Stanniocalcin precursor (STC) gene of the fish were tested with EvaGreen based real-time PCR. After exposing fish to L. garvieae, oxidative stress genes and immunity related genes relative gene expression sometime down-regulated and sometime up-regulated in 14 days of post exposure (dpe). Furthermore, all relative gene expressions were downregulated after 14 dpe in all fish groups except S. t. caspius (CC). Although CC one of the most reacted fish after infecting with L. garvieae, Y. ruckeri infected CC was the least affected group. Therefore, gene expression was depending on fish and pathogenic bacteria.
Benzer Tezler
- Bacterial uptake mechanism of peptides investigated by steered molecular dynamics simulations
Peptitlerin bakteri hücresine alınım mekanizmasının yönlendirilmiş moleküler dinamik simülasyonlar ile incelenmesi
İHSAN ÖMÜR AKDAĞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. ELİF ÖZKIRIMLI ÖLMEZ
- Bazı sülfonamit ve florokinolon grubu antibiyotiklerin iyonlaşma ve lipofilisite sabitlerinin ters faz sıvı kromatografik yöntem ile tayini
Determination of ionization and lipophilicity constants of some sulfonamide and fluoroquinolone group antibiotics by reverse phase liquid chromatographic method
NURDAN DE KRUİJFF
Doktora
Türkçe
2023
KimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABBASE GÜLEREN ALSANCAK
- Streptococcus pneumonia, Staphylococcus aureus ve Pseudomonas aeruginosa ile İnvaziv Bakteriyel Enfeksiyon geçiren çocuklarda IRAK4 ve MYD88 genlerinde mutasyon varlığının aAraştırılması
Investigation of Mutations in IRAK4 and MYD88 genes in children undergoing Invasive Bacterial Infection with Streptococcus pneumonia, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa
ZEYNEP GÖKÇE GAYRETLİ AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikHacettepe ÜniversitesiPediatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DENİZ NAZİRE ÇAĞDAŞ AYVAZ
- Investigation of improved immunostimulatory activity of K and D type CpG ODNs in liposomes
Lipozomlara yüklenmiş K ve D cpg ODN'lerin artan immün uyarıcı etkilerinin araştırılması
İHSAN DERELİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İHSAN GÜRSEL
- Ortopedik implantların nanoteknolojik yaklaşımlarla fonksiyonelleştirilmesi
Nanotechnologic approaches for functionalization of orthopedic implants
CEM BAYRAM
Doktora
Türkçe
2013
Bilim ve TeknolojiHacettepe ÜniversitesiNanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİR BAKİ DENKBAŞ