Ependimomlarda FISH yöntemi ile RELA füzyon gen varlığının ve immünhistokimyasal olarak P53 boyanmasının değerlendirilmesi
Detection of RELA fusion gene by FISH and immunohistochemical stain with P53 in epedymomas
- Tez No: 484907
- Danışmanlar: PROF. DR. AYLAR POYRAZ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Patoloji, Pathology
- Anahtar Kelimeler: Ependimom, RELA füzyon geni, FISH, immünhistokimya, Ependymoma, RELA fusion gene, FISH, İmmünohistochemistry
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 121
Özet
Ependimomlar, nadir görülen heterojen nöroepitelyal malign tümörlerdir. Çocuklarda daha sık görülür ve prognozları oldukça kötüdür. Ependimomlarda, derecelendirmenin prognostik öngörü ve tedavi yaklaşımını yönlendirmedeki kısıtlılığı nedeniyle ve farklı lokalizasyonlarda tümör gelişimine neden olan farklı kök hücrelerin saptanmasıyla birlikte moleküler çalışmalar başlamıştır. DNA metilasyon profili çalışmaları ile ependimomlar lokalizasyona spesifik 9 moleküler subgruba ayrılmıştır. Bu gruplardan biri olan“RELA füzyon pozitif ependimom”2016 yılı DSÖ sınıflamasına giren tek moleküler gruptur. ST lokalizasyonda görülmektedir. Çoğunlukla çocuklarda saptanmakla birlikte erişkinlerde de gösterilmiştir. Kötü prognozla ilişkilidir. NF-Kb sinyal yolağıyla ilişkili olan bu füzyon geni, çeşitli teröpatik çalışmalar için hedeftir. Çalışmamızda Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı'nda 2006-2017 yılları arasında tanı almış 110 ependimom olgusu yaş, histolojik tümör tipi, grade, lokalizasyon, rezeksiyon durumu, nüks gelişimi ve genel sağ kalım açısından incelendi. Tümör dokularında immünhistokimyasal olarak ki-67, p53 ve EMA ekspresyonuna bakıldı. Ayrıca hazırlanan tümör doku mikrodizinine RELA FISH boyaması yapılarak RELA füzyon gen varlığı araştırıldı. Tüm parametreler birbiriyle karşılaştırıldı ve prognostik anlamları değerlendirildi. İmmünhistokimyasal olarak ki-67 proliferasyon indeksi ile nüks ve genel sağ kalım arasında anlamlı ilişki saptanırken, p53 ile her ikisiyle de anlamlı ilişki bulunamadı. ST yerleşimli, grade 2 ependimomu olan çocuk hastada ve grade 3 anaplastik ependimomu olan erişkin hastada olmak üzere 2 olguda break apart FISH probu ile RELA füzyon gen varlığı saptandı. Her iki olguda da ki-67 ve p53 ile yüksek oranda boyanma görüldü. PF ve SP yerleşimli hiçbir olguda RELA gen füzyon varlığı görülmedi. RELA gen füzyon varlığı; lokalizasyon bağımlı, tümör derecesinden bağımsız ve kötü prognozla ilişkili moleküler bir belirteçtir. Ancak az sayıda vakada görüldüğü için, bu değerlendirme referans merkezler tarafından yapılmalıdır. Kolay uygulanabilir immünhistokimyasal markerların belirlenmesi için seri çalışmalar gereklidir.
Özet (Çeviri)
Ependymomas are rare heterogenic neuroepithelial malignancies. Incidence among children is more frequent and the prognosis of the disease is worse than adults. Molecular studies regarding ependymoma have started mainly due to the following reasons: (i) assessment is limited for prognostic prediction and treatment approach, and (ii) different root cells that cause tumor development at different locations were discovered. Based on the methylation profiling studies on ependymoma, the tumors are sub-grouped under 9 categories according to their locations. RELA fusion-positive ependymoma is the only genetically defined subtype accepted by World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System in 2016. It occurs at supratentorial region. Although it occurs mostly among children, some studies also reported among adults. RELA fusion positivety is associated with worse prognosis. The fusion gene related to NF-Kb signal pathway which is targeted for therapeutic practice. In this study, we examined 110 ependymomas diagnosed between 2006 and 2017 in the Pathology Department of Gazi University Medical School. We compared with many factors such as age, histological tumor type, grade, location, resection, recurrence, and survival. We studied the expression of ki-67, p53, and EMA immunohistochemistry in tumor tissues. Additionally, we investigated the RELA fusion gene presence in microarrays of tumor tissues by RELA FISH staining. We compared all the relevant parameters and looked at the prognostic values. Although there is a significant correlation between ki-67 proliferation index and both recurrence and survival, there is no significant correlation between p53 and either factor. We found RELA fusion gene by break apart FISH probe at 2 cases: A child with a grade 2 ependymoma at supratentorial region and an adult with grade 3 anaplastic ependymoma at the same region. In both cases, high degree of staining with ki-67 and p53 was also observed. The presence of RELA gene fusion is dependent on location whereas it is independent of tumor grade. It is also a molecular marker associated with worse prognosis. However, since this occurred in a small number of cases, further evaluation should be made by reference centers. Further series of experiments are needed to discover other immunohistochemical markers that are easier to handle.
Benzer Tezler
- Supratentoryum ve posterior fossa yerleşimli ependimomlarda FISH ile rela füzyonu bakılması ve immünhistokimyasal l1cam ile karşılaştırılması
Investigation of rela fusion with FISH in supratentorial and posterior fossa ependymomas and comparison with immunohistochemical l1cam antibody
CANSU TÜRKER SARIÇOBAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Patolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞİM BÜGE ÖZ
- Kraniyal ve spinal ependimomlarda prognostik faktörlerin değerlendirilmesi ve spinal ependimomlarda MYC-N ekspresyonunun nüks ve agresif gidiş ile ilişkisi
Evaluation of prognostic factors in cranial and spinal ependymomas and the relationship of MYC-N expression with recurrence and aggressive course in spinal ependymomas
GÖZDE TOPEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Patolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI KAHRAMAN
- Kauda eküina yerleşimli miksopapiller ependimomlarda kopya sayısı değişikliklerinin araştırılması
Investigation of copy number variations in cauda equina located myxopapillary ependymomas
ALİ ÖZEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
GenetikMarmara ÜniversitesiBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH BAYRAKLI
- Ependimomların en son güncellemeye göre yeniden sınıflandırılması ve bu olgularda rassf1a, p53 ve p14arf tümör supresör gen ekspresyonlarının immünohistokimyasal olarak araştırılması
Reclassification of ependymomas according to the latest update and immunohistochemical investigation of rassf1a, p53 and p14arf tumor suppressor gene expressions in these cases
CANSU ZEKİYE MEZDEĞİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM CANÖZ
- Non-astrositik primer santral sinir sistemi tümörlerinde DSC perfüzyon MR görüntüleme
DSC perfusion MR imaging in non-astrocytic primer central nervous system tumors
HUSEYN GULIYEV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Radyoloji ve Nükleer TıpEge ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. ÖMER KİTİŞ