Aptamerle fonksiyonlandırılmış çekirdek-kabuk tipi manyetik ayrımla birleştirilmiş kuartz kristal mikrotartı sensörü ile kompleks örneklerde patojen tespiti
Pathogen detection in complex samples by quartz crystal microbalance sensor coupled to aptamer functionalized core-shell type magnetic separation
- Tez No: 493702
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLAY BAYRAMOĞLU, PROF. DR. MEHMET YAKUP ARICA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Tez çalısmasında, çekirdek-kabuk manyetik mikroküreler üzerinde hedef patojene spesifik aptamerin immobilizasyonu yolu ile yeni bir manyetik ayrım sistemi hazırlandı. Bu amaç doğrultusunda, manyetik poli(hidroksipropil metakrilat/etilen glikol dimetakrilat) (p(HPMA/EGDMA)) mikroküreleri süspansiyon polimerizasyonu yöntemi ile sentezlendi. Daha sonra, manyetik mikroküreler, yüzeyde başlatılan atom transfer radikal polimerizasyonu (SI-ATRP) kullanılarak glisidil metakrilat (GMA) ile aşılandı. Manyetik mikroküreler üzerine Salmonella'ya spesifik olarak affinite gösteren aptamerler ile fonksiyonlandırıldı ve ön-zenginleştirme işleminde kullanıldı. Gıda örneklerinden Salmonella bakterilerinin seçici ve spesifik tayini için geliştirilen kuvartz kristal mikrodenge (QCM) sensörü, manyetik mikrokürelerin kullanıldığı ayrıştırma işlemi ile entegre edildi. Hedef bakteri hücrelerine duyarlı ve spesifik tespiti için biyoafinite ajanlarına dayanan birçok sensör geliştirilmiş olsa da, gıda numuneleri için sensör uygulamalarının geliştirilmesi oldukça zordur. Bu çalışmada, hedef patojenin hızla zenginleştirilmesi için aptamer temelli manyetik ayırma sistemini ve spesifik ve gerçek zamanlı izleme için QCM analizini birleştiren yeni ve duyarlı bir strateji sunuldu. Bu manyetik ayırma sistemi, hücreleri kısa sürede (10 dakikadan daha kısa bir sürede) etkili bir şekilde yakalayabildiğinden, yakalanan bakterilerin bir QCM akış hücresi sistemine beslenmesi, örnek gıda numunesinden 100 CFU/ml'de Salmonella hücrelerinin spesifik olarak tespit edildiğini gösterdi (örn. süt).
Özet (Çeviri)
A magnetic separation system developed by the immobilization of a target pathogen-specific aptamer on the core-shell magnetic microbeads was reported. For this purpose, the magnetic poly (hydroxypropyl methacrylate)/ethyleneglycole dimethacrylate), p(HPMA/EGDMA) beads were synthesized by suspension polymerization. The magnetic microbeads were grafted with glycidylmethacrylate (GMA) using surface- initiated atom transfer radical polymerization (SI-ATRP). A quartz crystal microbalance sensor (QCM) was developed for sensitive and specific detection of Salmonella cells in food samples by integrating a magnetic bead purification system. Although many sensor formats based on bioaffinity agents have been developed for sensitive and specific detection of bacterial cells, the development of robust sensor applications for food samples remained a challenging issue. A novel and sensitive high throughput strategy that combines an aptamer based magnetic separation system for rapid enrichment of target pathogens and a QCM analysis for specific and real-time monitoring was reported in this research. Since this magnetic separation system can efficiently capture cells in a relatively short processing time (less than 10 min), feeding captured bacteria to a QCM flow cell system showed specific detection of Salmonella cells at 100 CFU/ml from model food sample (i.e., milk).
Benzer Tezler
- Aptamer ile fonksiyonlandırılmış ginkgolid A-cisplatin yüklü poli(laktik asit-ko-glikolik asit) nanopartiküllerinin meme kanseri üzerindeki biyolojik etkinliğinin incelenmesi
Investigation of biological efficiency of aptamer functioned ginkgolide A-cisplatin loaded poly(lactic-co-glycolic asid) nanoparticles on breast cancer
CANSEL KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANU MANSUROĞLU
- Dna aptamer fonksiyonlu manyetik grafen oksit sentezi ve hedefli fototermal terapi ile metisilin dirençli Staphylococcus aureus'un öldürülmesi
Synthesis of DNA aptamer conjugated magnetic graphene oxide and its use as a photo-thermal agent for killing methicillin-resistant Staphylococcus aureus
MÜŞERREF ARSLAN ÖÇSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Fizik ve Fizik MühendisliğiErciyes ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. RAHMİ KÖSEOĞLU
- Hedefli fototermal ve fotodinamik terapi: DNA aptamer fonksiyonlaşırılmış indosiyanin yeşili katkılı polidopaminin sentezlenmesi ve metisilin dirençli staphylococcus aureus'un yok edilmesiiçin kullanımı
Targeted photothermal and photodynami̇c therapy: Synthesi̇s of DNA aptamer functi̇onali̇zed indocyani̇ne green-doped polydopami̇ne and its use to destroy meti̇ci̇lli̇n resi̇stant staphylococcus aureus
DİDAR TAŞDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Eczacılık ve FarmakolojiErciyes ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İSMAİL ÖÇSOY
- Structural and affinity analysis of selex-generated aptamers and optimization through in-silico mutagenesis
Selex ile üretilen aptamerlerin yapısal ve afinite analizi ve in-siliko mutajen yoluyla optimizasyonu
YAĞMUR YEŞİLYURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyofizikİzmir Ekonomi ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN DOLUCA
- Aptamer bağlı yüzeylerde vegf ve interferon-γ proteinlerinin zenginleştirilmesi ve MALDI-MS ile tayinleri
Enrichment of vegf and interferon-γ proteins on aptamer attached surfaces and their detections by MALDI-MS
CANAN HÖÇÜK