Türkiye yerli keçi ırklarında mikrosatellit DNA belirteçleri kullanılarak genetik çeşitliliğinin belirlenmesi
The identification of genetic diversity in turkish native goat breeds by using microsatellite DNA markers
- Tez No: 495051
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FULYA ÖZDİL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Namık Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Bu çalışmada; Türkiye'de yetiştirilen 4 yerli keçi ırkında (Ankara, Kilis, Honamlı ve Kıl Keçisi) 9 mikrosatellit belirteci kullanılarak genetik çeşitliliğin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışılan mikrosatellit belirteçlerine ait veriler ile yapılan istatistik analizler sonucunda; lokus başına düşen ortalama allel sayısının 13.66 allel / lokus ve heterozigotluk düzeylerinin 0.4878 ile 0.9600 arasında olduğu belirlenmiştir. Irklar kapsamında hesaplanan ortalama gözlenen ve beklenen heterozigotluk değerlerinin ise sırasıyla 0.7552 ve 0.7964 olduğu belirlenmiştir. Çalışma kapsamında incelenen ırklara ait FIS değerlerinin; -0.016 ile 0.105 arasında değiştiği saptanmıştır. Elde edilen FIS değerleri incelendiğinde; çalışılan tüm populasyonlarda değerlerin sıfıra yakın olduğu ve sadece Ankara ve Kıl keçisi ırklarında istatistiki olarak önemli olduğu bulunmuştur. Ankara ve Kıl keçisi ırklarında FIS değerlerinde gözlemlenen bu sapmanın homozigot fazlalığı nedeni ile olabileceği düşünülmektedir. Çalışma kapsamında hesaplanan FST değerleri incelendiğinde; tüm ırklarda değerlerin (0.0223 ila 0.0456) arasında değiştiği ve ırklar arasında az bir genetik farklılaşmanın olduğu belirlenmiştir. Hesaplanan FST değerlerinin ikili karşılaştırılması sonucunda tüm değerlerin (P
Özet (Çeviri)
In this study; 4 native goat breeds reared in Turkey (Ankara, Kilis, Honamlı and Hair Goat) were used to determine the genetic diversity by using 9 microsatellite markers. The average number of alleles per locus was determined to be 13.66 alleles / locus and the heterozygosity levels ranged from 0.4878 to 0.9600. The mean observed and expected heterozygosity values were calculated as 0.7552 and 0.7964 respectively. FIS values of four local breeds were found between -0.016 to 0.105. When the FIS values were examined; it was found that the values were close to zero in all the studied populations except that it is statistically significant only in Ankara and Hair Goat breeds. This may be due to the excess of homozygotes. The FST values were calculated between 0.023 to 0.0456 in all the studied breeds indicating that small genetic differentiation was found among breeds. When the results of the factorial correspondence and the principal component analysis in Turkish native goat breeds were investigated, the Honamlı goat individuals were grouped relatively more close with the other breeds, but the other native goat breeds (Kilis, Hair and Ankara Goat) were more clearly separated from each other and the individuals belonging to these breeds were grouped in different axis. All the studied microsatellite markers used in this study were found to be polymorphic in Turkish native goat breeds. Therefore; these markers can be recommended to use for the genetic characterization studies of Turkish native goat breeds. When all the results were evaluated together, except for the Honamlı goat breed, all the other goat breeds of Turkey, were genetically separated from each other. The results of this study will allow to determine the genetic structure and current situation of the goat populations reared in the farms which are included in the“Publicly-Enrolled National Sheep and Goat Breeding Project of Turkey”.
Benzer Tezler
- Türkiye yerli keçi ırklarında mikrosatellit DNA polimorfizm tekniğinin kullanılması ile ebeveyn tayini
Parentage testing in Turkish native goat breeds by using microsatellite DNA polymorphism technique
EZGİ GÜZEY SÜRMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiNamık Kemal ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZEN ARAT
- Türkiye'deki bazı yerli keçi ırklarında mikrosatellit polimorfizminin belirlenmesi
Determination of microsatellite polymorphism in some native turkish goat breeds
ÖZGECAN KORKMAZ AĞAOĞLU
- Bazı yerli keçi ırklarında kap 1.1 ve kap 1.3 genlerine ait polimorfizminlerin incelenmesi
An investigation of polymorphism kap 1.1 and kap 1.3 genes in some indigenous goat breeds
AYLA FİDAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
ZiraatTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL ÖZKAN ÜNAL
- Türkiye'de yetiştirilen bazı keçi ırklarında melatonin reseptör 1A (MTRN1A) gen polimorfizminin PCR-RFLP yöntemi ile belirlenmesi
Detection of melatonin receptor 1a (MTRN1A) gene polymorphism using PCR-RFLP method in some goat breeds in Turkey
HAKAN EREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiZootekni (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİLAL AKYÜZ
- Türkiye yerli keçi genetik kaynaklarından Ankara, Kıl, Kilis ve Honamlı keçilerinde hemoglobin, transferrin, seruloplazmin ve glutatyon polimorfizmi
The haemoglobin, transferrin, ceruloplasmin and glutathion polymorphism at Ankara, Hair, Kilis and Honamli goats of native goat breeds of Turkey
AYŞE ÖZGE DEMİR