Geri Dön

Solunum yolu örneklerinde rhinovirusların genotiplendirilmesi

Genotyping of rhinoviruses in respiratory tract speci̇mens

PDF İndir

  1. Tez No: 499022
  2. Yazar: HİKMET NİLŞEN GÜNEY
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KENAN MİDİLLİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Çalışmamızda hastanemizde saptanan rinovirusların genotip dağılımlarının, bu genotiplerin etkilerinin araştırılması amaçlandı. Çalışmaya retrospektif olarak 2013-2017 yılları arasında İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi poliklinik ve servislerinden gönderilen, rinovirus pozitif bulunan arşivlenmiş 82 örnek dahil edildi (28 kız, 54 erkek; yaş aralığı 0-86, yaş ortalaması 8,8+16,55). Genotiplendirme işleminde 5'UTR bölgesine ait PCR ürünlerinin DNA dizileri kullanıldı. Örneklerin 35'inde (% 42,7) RV-A, 12'sinde (% 14,6) RV-B, 35'inde (% 42,7) RV-C saptandı. RV-A'da 28 farklı tip, RV-B'de 7 farklı tip saptandı. RV-C tip dağılımları 13 CA1, 8 CA2, 14 CC şeklinde idi. Sonbahar ve kış aylarında RV-C baskın iken ilkbahar ve yaz aylarında RV-A'nın baskın olduğu gözlemlendi. RV-B oranının düşük olmasından dolayı istatiksel değerlendirme yapılamadı. Yaş grupları, cinsiyet, solunum yolu infeksiyon bölgesi, örneğin servis ya da poliklinik hastasına ait olmasına göre genotip dağılımları arasında istatistiksel olarak anlamlı fark yoktu. Altta yatan bir hastalığı olmayan grupta RV-A daha fazla görülürken altta yatan hastalığı olan grupta RV-C sıklığı istatistiksel olarak sınrda anlamlı idi (Pearson Ki-Kare p=0,05). RV-B sıklıkları her iki grupta benzerdi. RV dışında bir virüs ile koinfeksiyonu olmayan grupta RV-A daha fazla görülürken koinfeksiyonu olan grupta RV-B ve C sıklığı daha fazla idi. Bu farklılık da istatistiksel sınırda anlamlı idi (Pearson Ki-Kare p=0,05). Çalışmamız bölgemizdeki RV tür ve genotip dağılımlarını belirlemeye yönelik ilk çalışmadır. RV tür ve genotiplerinin dağılımı diğer çalışmalarda bildirilenlerle benzerlik göstermektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, we aimed to investigate the genotype distributions of rhinoviruses detected in our hospital and their relationship with different clinical manifestations. Retrospectively 82 rhinovirus RNA positive archived respiratory specimens (28 female, 54 male, aged between 0-86, mean age 8,8+16,55) which had been sent to Molecular Microbiology Laboratory between the years of 2013-2017 were included. Genotyping was based on sequencing of 5' UTR region of the virus. RV-A was detected in 35 (42,7%), RV-B in 12 (14,6%) and RV-C in 35 (42,7%) of the specimens. 70 different RV types were identified, 28 of which clustered in RV-A, 7 in RV-B, 13 CA1, 8 CA2, and 14 CC. RV-A was predominant in spring and summer, whereas RV-C was predominant in autumn and winter. Statistical analysis could not be performed for RV-B due to small sample size. There was no statistically significant difference in terms of genotype distributions according to age groups, sex, the involvement site of respiratory tract, and hospitalisation status of the patients. RV-A was more common in patients without underlying disease. RV-C incidance was higher in the patients having a underlying disease (Pearson Chi-Square p=0,05). The incidance of RV-B and RV-C was higher in the patients with coinfection. RV-A was more frequent in patients without a coinfection (Pearson Chi-Square p=0,05). xiv Our study is the first study about the distribution of RV species and genotypes in our region. The distribution patterns of RV species and types in our region were similar to other studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    435480

    Akut solunum yolu enfeksiyonlarında rhinovirusların genotiplendirilmesi

    Genotyping of rhinoviruses in acute respiratory tract infections

    NESLİHAN EDA DEMİRKAN

    Tıpta Uzmanlık

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEVİN KIRDAR

  2. Tez No

    809046

    Solunum yolu örneklerinden saptanan rhinovirusların moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi: Retrospektif bir çalışma

    Typing of rhinoviruses detected from respiratory tract samples by molecular methods: A retrospective study

    BEYZA TUNER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HARUN AĞCA

  3. Tez No

    435472

    Çocuklarda akut astım atakta ve atak sonrasında nazofarengeal sürüntüde polimeraz zincir reaksiyonu ile viral panel taraması

    Viral panel scanning via polymerase chain reaction in children for acute asthma exacerbation and post exacerbation nasopharyngeal load

    ORHAN GÜRCAN ADIGÜZEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAdnan Menderes Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU ERGE

  4. Tez No

    158009

    Solunum yolu örneklerinde Streptococcus pneumoniae'nin saptanmasında optokin disk duyarlılığı, safrada erime ve PCR yöntemlerinin yeri

    Başlık çevirisi yok

    BARIŞ CAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

  5. Tez No

    165229

    Solunum yolu örneklerinde atipik pnömoni etkenlerinin eş zamanlı olarak gösterilmesi

    Detection of atypical pathogens in respiratory specimens simultaneously

    MELİKE GÜZÜNLER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HAKAN ABACIOĞLU

    Y.DOÇ.DR. MEHMET ALİ ÖKTEM

Geri Dön