Geri Dön

In vitro characterization of microRNAs specific to cancer stem cell in larynx cancer

Kanser kök hücrelerine özgü mikroRNA'larin larenks kanser hücrelerinde in vitro karakterizasyonu

  1. Tez No: 521677
  2. Yazar: NUR DENİZ DİBEK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. ELİF SİBEL ASLAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Larenks Kanseri, mikroRNA, miR-203, miR-363-3p, Hep-2, Larynx Cancer, microRNA, mir-203, mir363-3p, Hep-2
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Biruni Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 90

Özet

Baş-boyun bölgesinde en sık görülen ve en agresif olan kanser türü larenks kanseridir. Ancak uygun tanı ve tedavi uygulandığında, baş-boyun bölgesinin tedaviye en iyi yanıt veren tümör ve dünyada en sık tanı koyulan kanser türüdür. Erkeklerde görülme sıklığı kadınlara göre yaklaşık 10 kat fazladır.Bu tür kanserin gelişmesinde en önemli risk faktörleri sigara ve alkol kullanımıdır. Skuamoz hücreli karsinomlar, larenks kanserlerinin % 90-95'ini oluşturmaktadır.Tüm kanser türlerinde olduğu gibi, erken tanı yaşam kalitesini önemli ölçüde yükseltilmesine yardımcı olurken, sağkalım süresini olumlu yönde etkilemektedir. MikroRNA'lar (miRNA'lar) protein kodlamayan küçük, RNA molekülleridir. Gen ifadesinin düzenlenmesinde ve neredeyse hücresel tüm mekanizmalarda aktif olarak rol oynamaktadırlar. MiRNA'ların çalışma mekanizmalarının iyi anlaşılması son zamanlarda yapılan araştırmaların odak noktası olmuştur. miRNA'ların Skuamoz Hücreli Larenks Kanseri (SHLK) gibi birçok kanserin patogenezinde önemli rol oynadığı gösterilmiştir. Bu çalışmada, ilk olarak önceki mikroarray çalışmalarında belirlenmiş olan mikroRNA'lar arasından mir-26b, mir200c-3p, mir-203, mir363-3p, and mir-1825 'ın Trizol ile izolasyonları yapılmış ve cDNA sentezi ve ardından qRT-PCR esseyleri yapılmıştır. Transfeksiyona hazır hale gelen mikroRNA'lar için fonksiyonel analizlerde kullanılmak üzere larenks squamos hücre hattı olan Hep-2 hücreleri kullanılmıştır. Hep-2 hücrelerine mikroRNA'ların transfeksiyonu yapıldıktan sonra sırasıyla, proliferasyon, migrasyon ve invasyon, soft agar analizleri yapılmıştır. Başlangıçta anlamlılık ifade etmesi açısından 5 mikroRNA ile yola çıkılmış ancak yapılan analizlerin sonucunda, bunlardan gözle görülür şekilde mir-203 ve mir363-3p 'nin önemli rol oynadığı bulunmuştur. Sonuç olarak, mir-203 ve mir363-3p 'nin Hep-2 larenks kanseri hücreleri üzerinde tümor supresör özellikte davranarak, kanser hücrelerinin proliferasyon, migrasyon ve invasyon ve koloni oluşturma yeteneklerini ciddi oranda azalttığı belirlenmiştir. Tanı aşamasında bu miRNA'lardan yararlanabilineceği belirlenmiştir. Bundan sonra yapılacak diğer fonksiyonel çalışmalara da yardımcı olacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Larynx cancer isthe most common and most aggressive type of cancer in the head and neck region. However, when appropriate diagnosis and treatment is applied, the treatment of the head and neck region is the best responding tumor which is the most common cancer type in the world. The incidence in men is about 10 times higher than in women. The most important risk factors for the development of cancer are smoking and alcohol use. Squamous cell carcinomas constitute 90-95% of laryngeal carcinomas and early diagnosis helps increase the quality of life significantly, and affects the survival time positivelylike other cancer types. MicroRNAs (miRNAs) are small RNA molecules that do not encode proteins which are actively involved in the regulation of gene expression and in almost all cellular mechanisms. A good understanding of the working mechanisms of miRNAs has been the focus of recent research. These researches have showed that microRNAs to play an important role in the pathogenesis of many cancers such as Larynx Squamous Cell Carsinoma (LSCC) In this study, samples were first isolated from microRNAs which was already identified in previous microarray studies with mir-26b, mir200c-3p, mir-203, mir363-3p, and mir-1825 in Trizol. cDNA synthesis was followed by qRT-PCR assays. For the microRNAs ready for transfection, Hep-2 cells, the larynx squamos cell line, were used for functional analysis. After transfection of microRNAs into Hep-2 cells, proliferation, migration and invasion, soft agar analyzes were followed and performed respectively. Initially, 5 microRNAs were expressed in terms of significance. However, as a result of these analyzes mir-203 and mir3633p played an important role in these experiments. As a result of that mir-203 and mir363-3p act as tumor suppressor on Hep-2 laryngeal cancer cells, indicating that cancer cells seriously reduce their ability to proliferate, migrate and invade and colonize. It was determined that these miRNAs could be used during diagnosis. Further experiments and works need to be donefor better understanding of this cancer mechanism.

Benzer Tezler

  1. Meme kanseri tedavisinde mikrorna ile zenginleştirilmiş ilaç yüklü eksozomların tamoksifen direnci üzerine etkisinin incelenmesi

    Investigation of the effect of microrna enriched drug loaded exosomes on tamoxifen resistance in breast cancer treatment

    HAVVA TEZCAN ÜNLÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Tıbbi BiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    PROF. DR. GÜLŞAH ÇEÇENER

  2. Prostat kanseri hücrelerinden mikroRNA salınımının in vitro karakterizasyonu

    In vitro characterization of microRNA release from prostate cancer cells

    ZEYNEP DUYGU TİRYAKİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Onkolojiİstanbul Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UĞUR GEZER

  3. Poli laktik-ko-glikolik asit nanopartikülleri kullanarak hedefli hücrelerde RNA interferans ile gen susturma yöntemi geliştirilmesi

    Development of gene silencing method with RNA i̇nterference in target cells usi̇ng poly lactic-co-glycolic acid nanoparti̇cles

    ŞEYMA CEYLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ

    YRD. DOÇ. DR. FATEMEH BAHADORI

  4. Domates (Solanum lycopersicum) bitkisinde kuraklık stresi ile ilişkili mikrorna'ların analizleri

    Analyses of microRNAs related to drought stress in tomato (Solanum lycopersicum) plants

    BİLGİN CANDAR ÇAKIR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCAN ARICAN

    DOÇ. DR. BAOHONG ZHANG

  5. Microrna dependent control and regulation mechanisms of autophagy in health and disease

    Hastalıkta ve saglıkta otofajinin mikrornalar ile kontrolü

    AYŞE KUMSAL TEKİRDAĞ KOŞAR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DEVRİM GÖZÜAÇIK