Hepg2, CACO-2 ve HT-29 kanser hücrelerinde 2D jel elektroforez ve MALDI-TOF/TOF-MS ile ankaferd hemostat' ın in-vitro antineoplastik etkisinin proteomik açıdan araştırılması
Nenni, m. proteomic investigation of in-vitro antineoplastic effect of ankaferd hemostat with 2d gel electrophoresis and maldi-TOF/TOF-MS in HEPG2, CACO-2 and HT-29 cancer cells
- Tez No: 536418
- Danışmanlar: PROF. DR. İNCİLAY SÜSLÜ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Eczacılık ve Farmakoloji, Hematoloji, Chemistry, Pharmacy and Pharmacology, Hematology
- Anahtar Kelimeler: Proteomik, Kolon kanseri, Karaciğer kanseri, İki boyutlu (2D) jel elektroforez, MALDI-TOF/TOF-MS, Protein etkileşimleri, Elektroforez-jel-iki boyutlu, Hücre dizisi, Karaciğer neoplazmları, Kolon neoplazmları, Kütle spektrometri, Neoplazmlar, Proteomics, Colon cancer, Liver cancer, Two dimensional (2D) gel electrophoresis, MALDI-TOF/TOF-MS, Protein interactions, Electrophoresis-gel-two dimensional, Cell line, Liver neoplasms, Colonic neoplasms, Mass spectrometry, Neoplasms
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yaşam bilimlerinde çığır açan keşiflerden biri insan genom projesinin tamamlanmasıyla gerçekleştirilmiştir. Ancak tüm genom haritasının oluşturulması, bilim adamları için zorlu bir görevi de beraberinde getirmiştir. Bu görev insan proteomunun karakterizasyonudur. Proteomik araştırmalar, moleküler seviyede değişim gösteren proteomların analizinin yapıldığı çalışmalardır. Onkoproteomik, kanser hücresindeki protein etkileşimlerini içeren proteomik teknolojilerin kullanıldığı proteomiklerin bir koludur. Kanser patogenezinin daha iyi anlaşılmasını sağlamak, tanı için yeni tümör biyobelirteçleri geliştirmek ve örneklerin proteom profili kullanılarak erken tespit ve teşhisi sağlamak için onkoproteomik çalışmalar yapılmaktadır. Bu tez çalışması kapsamında, Caco-2 ve HT-29 kolon kanseri ve HepG2 karaciğer kanseri hücre hatları, Ankaferd Hemostat (ABS; Ankaferd Blood Stopper®) ile farklı sürelerde muamele edilmiştir. ABS ile muamele edilen hücreler (işlenmiş, T grubu) ve muamele edilmeyen hücreler (kontrol, C grubu) üzerinde karşılaştırmalı proteomik çalışmalar yapılmıştır. Proteomik çalışmalarda, 2 boyutlu jel elektroforezle ayrılan C ve T gruplarına ait proteinler için imaj analizi çalışmaları yapılmıştır. C ve T grupları karşılaştırıldığında, nicel anlamda en az 2 kat farklılaşan proteinler, MALDI-TOF/TOF-MS ile analiz edilmiş ve peptid dizileme çalışmalarıyla tanımlanmıştır. Tanımlanan proteinler Uniprot ve SwissProt gibi veri tabanlarında taranıp yapıları, fonksiyonları, gen adları ve protein-protein etkileşimleri belirlenmiştir. String veri tabanı aracılığıyla da ABS' nin, kanser hücrelerinde etkilediği biyolojik süreçler ve yolaklar tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
One of the breakthroughs in life sciences has been accomplished through the completion of the human genome project. However, the compose of the entire genome map has also brought a tough task for scientists. This task is the characterization of human proteome. Proteomic investigations are studies of the analysis of proteomes that change at the molecular level. Oncoproteomic is a branch of proteomics where proteomic technologies involving protein interactions in cancer cells are used. Oncoproteomic studies are being conducted to provide better understanding of cancer pathogenesis, to develop new tumor biomarkers for diagnosis and to provide early detection and diagnosis of samples using proteomic profiles. Within the scope of this thesis, Caco-2 and HT-29 colon cancer and HepG2 liver cancer cell lines were treated at different times by Ankaferd Hemostat (ABS; Ankaferd Blood Stopper®). Comparative proteomic studies were performed on cells treated with ABS (treated, T group) and untreated cells (control, C group). In proteomic studies, image analysis studies were performed for proteins belonging to groups C and T separated by two dimensional gel electrophoresis. Proteins that differed quantitatively by at least 2-fold when compared to groups C and T were analyzed by MALDI-TOF/TOF-MS and identified by peptide sequencing studies. Identified proteins were scanned in databases such as Uniprot and SwissProt, its functions, gene names, protein-protein interactions. Through the database of String, the biological processes and pathways that the ABS has affected in cancer cells have been identified.
Benzer Tezler
- Farklı makroalg türlerinden elde edilmiş biyoaktif bileşiklerin antikanser ve antioksidan özelliklerinin araştırılması
Investigation of anticancer and antioxidant properties of bioactive compounds from different macroalgae species
CEYLAN FİDAN BABAT
Doktora
Türkçe
2025
BiyokimyaVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CAN YILMAZ
PROF. DR. ŞEVKİ ARSLAN
- Katyonik grup içeren Schiff bazı ligandı ve Co (II) metal kompleksinin kanser hücreleri üzerine antikanser etkilerinin araştırılması
Investigation of anticancer effects of Schiff base ligand and Co (II) metal complex containing cationic group on cancer cells
MELİS KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Tıbbi BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ESİN SAKALLI ÇETİN
- 3-aril/alkil-(2-aril)-benzo[b]tiyofen türevlerin anti-kanser ve anti-inflamatuar özelliklerinin belirlenmesi
Determination of anticancer and antiinflammatory properties of 3-aryl/alkyl-(2-aryl)-benzo[b]thiophene derivatives
YAKUP BİTİKTAŞ
- Ayçiçeği proteini kaynaklı biyoaktif peptitlerin antihipertansif ve antidiyabetik potansiyellerinin incelenmesi ve fonksiyonel ekmek üretiminde değerlendirilmesi
Assessment of antihypertensive and antidiabetic properties from sunflower protein-derived bioactive peptides and their evaluation in functional bread formulation
ZEYNEP SALİHA GÜNEŞ
Doktora
Türkçe
2026
Gıda Mühendisliğiİstanbul Sabahattin Zaim ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM GÜLSEREN
- Biyolojik olarak aktif artemisinin-benzotiyofen türevlerinin antikanser ve antiinflamatuar etkilerinin araştırılması
Investigation of anticancer and antiinflammatory effects of biologically active artemisinin–benzothiophene derivatives
KÜBRA KOCABIYIK