Geri Dön

Hepg2, CACO-2 ve HT-29 kanser hücrelerinde 2D jel elektroforez ve MALDI-TOF/TOF-MS ile ankaferd hemostat' ın in-vitro antineoplastik etkisinin proteomik açıdan araştırılması

Nenni, m. proteomic investigation of in-vitro antineoplastic effect of ankaferd hemostat with 2d gel electrophoresis and maldi-TOF/TOF-MS in HEPG2, CACO-2 and HT-29 cancer cells

  1. Tez No: 536418
  2. Yazar: MERVE NENNİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İNCİLAY SÜSLÜ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Hematoloji, Kimya, Pharmacy and Pharmacology, Hematology, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Proteomik, Kolon kanseri, Karaciğer kanseri, İki boyutlu (2D) jel elektroforez, MALDI-TOF/TOF-MS, Protein etkileşimleri, Proteomics, Colon cancer, Liver cancer, Two dimensional (2D) gel electrophoresis, MALDI-TOF/TOF-MS, Protein interactions
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 224

Özet

Yaşam bilimlerinde çığır açan keşiflerden biri insan genom projesinin tamamlanmasıyla gerçekleştirilmiştir. Ancak tüm genom haritasının oluşturulması, bilim adamları için zorlu bir görevi de beraberinde getirmiştir. Bu görev insan proteomunun karakterizasyonudur. Proteomik araştırmalar, moleküler seviyede değişim gösteren proteomların analizinin yapıldığı çalışmalardır. Onkoproteomik, kanser hücresindeki protein etkileşimlerini içeren proteomik teknolojilerin kullanıldığı proteomiklerin bir koludur. Kanser patogenezinin daha iyi anlaşılmasını sağlamak, tanı için yeni tümör biyobelirteçleri geliştirmek ve örneklerin proteom profili kullanılarak erken tespit ve teşhisi sağlamak için onkoproteomik çalışmalar yapılmaktadır. Bu tez çalışması kapsamında, Caco-2 ve HT-29 kolon kanseri ve HepG2 karaciğer kanseri hücre hatları, Ankaferd Hemostat (ABS; Ankaferd Blood Stopper®) ile farklı sürelerde muamele edilmiştir. ABS ile muamele edilen hücreler (işlenmiş, T grubu) ve muamele edilmeyen hücreler (kontrol, C grubu) üzerinde karşılaştırmalı proteomik çalışmalar yapılmıştır. Proteomik çalışmalarda, 2 boyutlu jel elektroforezle ayrılan C ve T gruplarına ait proteinler için imaj analizi çalışmaları yapılmıştır. C ve T grupları karşılaştırıldığında, nicel anlamda en az 2 kat farklılaşan proteinler, MALDI-TOF/TOF-MS ile analiz edilmiş ve peptid dizileme çalışmalarıyla tanımlanmıştır. Tanımlanan proteinler Uniprot ve SwissProt gibi veri tabanlarında taranıp yapıları, fonksiyonları, gen adları ve protein-protein etkileşimleri belirlenmiştir. String veri tabanı aracılığıyla da ABS' nin, kanser hücrelerinde etkilediği biyolojik süreçler ve yolaklar tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

One of the breakthroughs in life sciences has been accomplished through the completion of the human genome project. However, the compose of the entire genome map has also brought a tough task for scientists. This task is the characterization of human proteome. Proteomic investigations are studies of the analysis of proteomes that change at the molecular level. Oncoproteomic is a branch of proteomics where proteomic technologies involving protein interactions in cancer cells are used. Oncoproteomic studies are being conducted to provide better understanding of cancer pathogenesis, to develop new tumor biomarkers for diagnosis and to provide early detection and diagnosis of samples using proteomic profiles. Within the scope of this thesis, Caco-2 and HT-29 colon cancer and HepG2 liver cancer cell lines were treated at different times by Ankaferd Hemostat (ABS; Ankaferd Blood Stopper®). Comparative proteomic studies were performed on cells treated with ABS (treated, T group) and untreated cells (control, C group). In proteomic studies, image analysis studies were performed for proteins belonging to groups C and T separated by two dimensional gel electrophoresis. Proteins that differed quantitatively by at least 2-fold when compared to groups C and T were analyzed by MALDI-TOF/TOF-MS and identified by peptide sequencing studies. Identified proteins were scanned in databases such as Uniprot and SwissProt, its functions, gene names, protein-protein interactions. Through the database of String, the biological processes and pathways that the ABS has affected in cancer cells have been identified.

Benzer Tezler

  1. Katyonik grup içeren Schiff bazı ligandı ve Co (II) metal kompleksinin kanser hücreleri üzerine antikanser etkilerinin araştırılması

    Investigation of anticancer effects of Schiff base ligand and Co (II) metal complex containing cationic group on cancer cells

    MELİS KILIÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ESİN SAKALLI ÇETİN

  2. The investigation of In Vitro anticancer effect of the combination of sulforaphane and doxorubicin

    Sülforafan ve doksorubisin kombinasyonunun In Vitro antikanser etkilerinin araştırılması

    SONDOS HASAN HLALI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİRİŞ DİKMEN

  3. Syntheses of bleomycin ligand models containing carbohydrates with antitumor activities and investigation of reactivity properties of non-heme high-valent iron(IV)-oxo complexes

    Antitümör aktiviteleri olan karbohidrat içeren bleomisin ligand modellerinin sentezleri ve hem olmayan yüksek değerlikli demir(IV)-okso komplekslerinin reaktivite özelliklerinin incelenmesi

    JALE ÖCAL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    KimyaEge Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AZİZE YEŞİM SALMAN

  4. Sülfür metabolizmasinda yer alan metabolitlerin miktar tayini için LC-MS/MS yönteminin geliştirilmesi ve valide edilmesi

    An LC-MS/MS method development and validation for quantification of metabolites in sulfur metabolism

    ELİF DAMLA GÖK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİRHAN NEMUTLU

  5. Bazı metal bazlı nanomateryallerin toksik etki potansiyellerinin araştırılması

    Investigation of the potential toxic effects of some metal-based nanomaterials

    MAHMOUD ABUDAYYAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜL ÖZHAN