Geri Dön

Tavuk etinde yüksek seviyede aminoglikozid dirençli Enterococcus spp. yaygınlığı ve aminoglikozid-modifiye edici enzim (AME) genlerinin belirlenmesi

Prevalence of high level aminoglycoside resistant (HLAR) Enterococcus spp. in chicken meat and detection of their aminoglycoside-modifying enzyme (AME) genes

  1. Tez No: 542344
  2. Yazar: MELTEM YALÇIN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YASİN TUNCER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Bu çalışmada, Antalya ve Isparta illerinden temin edilen 112 tavuk eti örneğinde yüksek seviyede aminoglikozid dirençli (YSAD) Enterococcus yaygınlığı ve aminoglikozid-modifiye edici enzim (AME) geni varlığı araştırılmıştır. Ayrıca izolatların antibiyotik direnç profilleri ile gentamisin ve streptomisin minimum inhibisyon konsantrasyonları (MİK) da belirlenmiştir. Bu çalışmada toplam 32 YSAD Enterococcus suşu izole edilmiştir. 32 YSAD izolatının 7'si yüksek seviyede gentamisin dirençli (YSGD) ve 25'i yüksek seviyede streptomisin dirençli (YSSD)'dir. İzolatlar türe özgü polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve 16S rDNA dizi analizi ile E. faecium (18, % 56.25), E. faecalis (5, % 15.63), E. durans (5, % 15.63), E. avium (3, % 9.37) ve E. casseliflavus (1, % 3.12) olarak tanımlanmıştır. Disk difüzyon testi sonucu, YSAD Enterococcus izolatlarının en duyarlı olduğu antibiyotiklerin ampisilin (% 93.75), linezolid (% 93.75), penisilin G (% 90.62), teikoplanin (% 90.62), nitrofurantoin (% 78.12), vankomisin (% 75) ve kloramfenikol (% 68.75) olduğu saptanmıştır. İzolatlarının en dirençli olduğu antibiyotiklerin eritromisin (% 96.87), minosiklin (% 96.87), streptomisin (% 96.87) ve tetrasiklin (% 96.87) olduğu belirlenmiştir. İzolatların tamamı çoklu antibiyotik direncine sahip bulunmuştur. YSAD Enterococcus izolatlarının gentamisin ve streptomisin MİK değerlerinin sırasıyla 16 ile >4096 ve 64 ile >4096 μg/mL arasında değiştiği belirlenmiştir. 32 YSAD Enterococcus izolatının 18'inin (% 56.25) hem YSSD hem de YSGD oldukları tespit edilmiştir. PZR denemeleri sonucu YSAD Enterococcus izolatlarının 1 ile 5 arasında değişen sayıda AME geni içerdiği tespit edilmiştir. YSAD Enterococcus izolatlarında en sık rastlanan AME genlerinin ant(6ʹ)-Ia (% 87.5, 28/32), aph(3ʹ)-IIIa (% 78.13, 25/32),) ant(4ʹ)-Ia (% 68.75, 22/32), aph(2ʹʹ)-Ib (% 62.5, 20/32), aac(6ʹ)-Ie-aph(2ʹʹ)-Ia (% 21.88, 7/32) ve aph(2ʹʹ)-Ic (% 9.38, 3/32) olduğu tespit edilmiştir. İzolatlarının hiçbirinde aph(2ʹʹ)-Id genine rastlanılmamıştır. Sonuç olarak bu çalışma, tavuk eti örneklerinde YSAD Enterococcus varlığını göstermiştir. YSAD Enterococcus izolatları tüketici sağlığı açısından risk teşkil edebilir. Ayrıca, bu suşlar yüksek seviyede aminoglikozid direnci ile ilişkili genlerin yayılmasında rezevuar görevi görebilir.

Özet (Çeviri)

In this study, the prevalence of high level aminoglycoside resistant (HLAR) Enterococcus in chicken meat obtained from Antalya and Isparta provinces and presence of aminoglycoside-modifying enzyme genes (AMEs) were investigated. Antibiotic resistance profiles and minimum inhibition concentration (MIC) values were also determined. A total of 32 HLAR Enterococcus strains were isolated in this study. Seven out of 32 HLAR isolates are high level of gentamicin resistant (HLGR) and 25 out of 32 HALR isolates are high level streptomycin resistant (HLSR). Isolates were identified as E. faecium (18, 56.25%), E. faecalis (5, 15.63%), E. durans (5, 15.63%), E. avium (3, 9.37%) ve E. casseliflavus (1, 3.12%) by species-specific polymerase chain reaction (PCR) and 16S rDNA sequence analysis. As a result of the disc diffusion test, HLAR Enterococcus isolates were found to be most susceptible to ampicillin (93.75%), linezolide (93.75%), penicillin G (90.62%), teikoplanine (90.62%), nitrofurantoin (78.12%), vancomycin (75%) and chloramphenicol (68.75%). All isolates were found to have multiple antibiotic resistance. Gentamicin and streptomycin minimum inhibitory concentration (MIC) values of HLAR isolates were detected chancing in the ranged from 16 to >4096 and 64 to >4096 μg/mL, respectively. Eighteen out of 32 HLAR isolates were identified as both HLGR and HLSR. PCR results showed that HLAR Enterococcus isolates contain AME genes ranging of number from one to five. The most common AME genes in HLAR Enterococcus isolates were ant(6ʹ)-Ia (87.5%, 28/32), aph(3ʹ)-IIIa (78.13%, 25/32),) ant(4ʹ)-Ia (68.75%, 22/32), aph(2ʹʹ)-Ib (62.5%, 20/32), aac(6ʹ)-Ie-aph(2ʹʹ)-Ia (21.88%, 7/32) ve aph(2ʹʹ)-Ic (9.38%, 3/32). The aph(2ʹʹ)-Id gene was not detected in any of the isolates. In conclusion, this study showed the presence of HLAR Enterococcus in chicken meat samples. In addition, these isolates can act as a reservoir in the dissemination of genes associated with high levels of aminoglycoside resistance. HLAR Enterococcus isolates may pose a risk to consumer health. In addition, these strains can act as a reservoir for the dissemination of genes associated with a high level of aminoglycoside resistance.

Benzer Tezler

  1. Tavuk etinde Salmonella enteritidis'in gelişimi üzerine salmonella enteritidis bakteriyofajlarının etkisi

    Effect of Salmonella enteritidis bacteriophages on the growth of salmonella enteritidis in chicken meat

    ÖZGÜL DEMİRASLAN AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Gıda MühendisliğiNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZELİHA YILDIRIM

  2. Farklı tuz (NaCı, KCı) ve karragenan (İOTA, KAPPA) çeşitlerinin tavuk göğüs etinin bazı emülsiyon özellikleri üzerine etkilerinin belirlenmesi

    Determination of effects of different salt (NaCl, KCl) and carrageenan (İOTA, KAPPA) varieties on some emulsion properties of chicken breast meat

    MUTLU ÇAKIR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Gıda MühendisliğiSelçuk Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEMALETTİN SARIÇOBAN

  3. Tavuk etinde antibiyotik kalıntılarının HPLC yöntemiyle belirlenmesi

    Determination of antibiotic residues in chicken meat by HPLC method

    TUĞBA YILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİRSEN DEMİRATA ÖZTÜRK

  4. Tavuk etinde bozulmayi izlemek için tazelik indikatörü geliştirilmesi

    Development of freshness indicator for monitoring of spoilage on chicken meat

    BATUHAN DEMİREL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    KimyaHacettepe Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK ŞOLPAN ÖZBAY

  5. Tavuk etinde tazeliği izlemek için gerçek zamanlı-pH duyarlı kolorimetrik akıllı indikatör geliştirilmesi

    Development of real time-pH-sensitive colorimetric intelligent indicator to monitor chicken meat freshness

    İREM MELDA KARACA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Gıda MühendisliğiSakarya Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA AYHAN