Van ilindeki Colpoda (Protista, Ciliophora) türleri üzerinde moleküler filogenetik araştırmalar
Molecular phylegenetic investigatons on Colpoda (Protista Ciliophora) species from van province
- Tez No: 576482
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İSMAİL YILDIZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Hidrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Bu çalışmada Van ilindeki topraklarda yaşayan Colpoda cinsine ait siliyatların izolasyonu, morfolojik ve morfometrik karakterizasyonu ile moleküler filogenetik özellikleri araştırıldı. Hazırlanan toprak kültürlerinden C. lucida, C. maupasi, C. magna ve Colpoda sp. olmak üzere 4 popülasyon tespit edildi. Bu popülasyonların morfolojik özellikleri canlı ve çeşitli gümüş boyama teknikleri kullanılarak ortaya çıkarıldı. Bu çalışma ile izole edilen ve daha önce tanımlanan diğer Colpoda türlerinin hiçbirine dahil edilemeyen bir popülasyon Colpoda sp. olarak verildi. Elde edilen siliyatların 18S rDNA gen bölgeleri çoğaltılarak dizileri ortaya çıkarıldı. Colpoda cinsinin filogenisi Bayesian çıkarsaması ve maksimum olabilirlik yaklaşımı kullanılarak belirledi. Bu çalışmada belirlenen kolpodid siliyatlar genel morfolojik karakterler bakımından literatür verileri ile uyum içerisindedir. Bununla birlikte C. magna'nın hücre büyüklüğü önceki çalışmalar ile kıyaslandığında daha geniş bir değişim aralığına sahip olduğu, C. lucida popülasyonunun daha küçük boyutlu bireylerden oluştuğu görüldü. Bu çalışma ülkemizde Colpoda cinsi üyelerinin 18S rDNA gen dizileri ile yapılan ilk moleküler araştırmadır. Moleküler filogenetik ağaçlar incelendiğinde Colpoda cinsinin monofiletik bir takson olduğu görülmüştür. Bu çalışmada elde edilen popülasyonların filogenetik ağaçlar üzerinde aynı türe ait diğer popülasyonlar ile birlikte kümelenme göstermesine karşın, onlardan genetik olarak uzaklaşma eğiliminde oldukları görüldü. Bu durum farklı ekolojik koşullarda organizmaların farklı mutasyonlar biriktirmiş olması ve henüz tür düzeyinde bir farklılaşmanın olmamasından kaynaklanabilir.
Özet (Çeviri)
In this study, isolation, morphological and morphometric characterization and molecular phylogenetic characteristics of ciliates belonging to genus Colpoda living in Van province were investigated. Four populations belonging to genus Colpoda including C. lucida, C. maupasi,C. magna and Colpoda sp. were isolated from soil cultures. Morphological characteristics of these populations were determined by using live and various silver impregnation techniques. A Colpoda population isolated in this investigation could not be included in any species previouslly described, and were given as Colpoda sp. The 18S rDNA gene regions of the ciliates were amplified and sequenced. The phylogeny of the Colpoda genus was determined using Bayesian inference and maximum likelihood approach. Colpodid ciliates identified in this study are in agreement with the literature data in terms of general morphological characteristics. However, the cell size of the C. magna was found to have a wider range of variations compared to previous studies, and C. lucida population was composed of smaller size individuals. This study is the first molecular investigation with 18S rDNA gene sequences of members of the genus Colpoda in Turkey. When the molecular phylogenetic trees were examined, it was observed that the Colpoda genus was a monophilic taxa. Although the populations obtained in this study showed clustering on phylogenetic trees together with other populations of the same species, it was found that they tend to genetically seperate away from them. It was concluded that this situation may be variations in different ecological conditions. This may be due to the fact that organisms have accumulated different mutations under different ecological conditions and that there is no difference at the species level yet.
Benzer Tezler
- Van ilindeki farklı branşlardaki sporcuların motorik özellikleri ve somatotiplerinin incelenmesi
Investigation of motoric features and somatotypes of athletes in different branches in Van province
ROJDA KOŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
AntropolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiAntropoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CANSEV MEŞE YAVUZ
- Van ilindeki gebe kadınlarda folik asit düzeyi
Başlık çevirisi yok
MİNE ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
İngilizce
2005
İç HastalıklarıYüzüncü Yıl Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İMDAT DİLEK
- Van ilindeki aile sağlığı merkezlerinde çalışan hekimlerin ve Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tıp Fakültesi aile hekimliği asistanlarının otizm spektrum bozuklukları hakkında bilgi ve farkındalık düzeylerinin incelenmesi
Investigation of the levels of knowledge and awareness of physicians working in family health centers in Van province and family medicine assistants of Yüzüncü Yıl University Faculty of Medicine about autism spectrum disorders
BERFİN KORKUT AZAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Aile HekimliğiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ADEM YAĞAN
- Van ilindeki orta öğretim öğrencilerinin açık liseye geçiş nedenleri
The reasons for secondary education students in Van province for transition to open high school
GAMZE NUR YÜKSEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Eğitim ve ÖğretimTrabzon ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET YAZICI
- Van ilindeki un fabrikalarının mevcut durumu ve üretilen unların bazı kalitatif özellikleri
The state of flour mills in Van province and some qualitative properties of the obtained flours
DİDAR MİRAHMETOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Besin Hijyeni ve TeknolojisiYüzüncü Yıl ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. İSMAİL SAİT DOĞAN