Geri Dön

Karbapenem dirençli gram negatif bakterilerde kolistin duyarlılığının saptanmasında sıvı mikrodilüsyon ve ticari yöntemlerin karşılaştırılması

Comparison of broth microdilution and commercial methods for the detection of colistin susceptibility in carbapenem resistant Gram negative bacteria

PDF İndir

  1. Tez No: 581712
  2. Yazar: CEREN HEKİMOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter, Gram negatif bakteriler, Karbapenemler, Kolistin, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Acinetobacter, Gram negative bacteria, Carbapenems, Colistin, Microbial sensitivity tests
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Karbapenamaz dirençli nozokomiyal ve toplum kökenli Gram negatif bakteri enfeksiyonları dünya çapında giderek artmaktadır. Karbapenem dirençli suşların hastanede yatan hastalar arasında artan yayılımı endişe kaynağı haline gelmiştir. Karbapenemler (imipenem, meropenem, ertapenem), çoklu ilaca dirençli non-fermantatif ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) pozitif Enterobacteriaceae'nin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde son terapötik seçenek olarak sıklıkla kullanılmaktadır. Ancak son yıllarda karbapenem dirençli Enterobacteriaceae enfeksiyonlarında artış sebebiyle kolistin kullanımı da artmaktadır. Kolistin duyarlılığını saptayabilmek için farklı test yöntemleri bulunmaktadır. EUCAST ve CLSI ortak önerisi referans yöntem sıvı mikrodilüsyon yöntemidir. Bu çalışmada, karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin duyarlılığının saptanmasında sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile ticari sıvı mikrodilüsyon testi, VITEK 2 [BioMerieux, Fransa] ve MicroScan [Beckman Coulter, CA, USA] sistemlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya karbapenemlere dirençli 25 adet A. baumannii, 25 adet K. pneumoniae ve 25 adet P. aeruginosa izolatı dahil edilmiştir. Tüm izolatların CLSI ve EUCAST'ın ortak önerisi olan ISO-20776 standart sıvı mikrodilüsyon metodu ve VITEK 2 [BioMerieux, Fransa] ve MicroScan [Beckman Coulter, CA, USA] sistemleri ile kolistin duyarlılıkları tespit edilmiştir. Referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon ile karbapenem dirençli 75 izolatın 47'si (%63) kolistine duyarlı, 28'i (%37) dirençli bulunmuştur. VITEK 2 ile 61'i (%81) kolistine duyarlı, 14'ü (%19) dirençli, MicroScan ile 55'i (%73) kolistine duyarlı, 20'si (%27) dirençli olarak bulunmuştur. Kolistin duyarlılığını belirlemede MicroScan %86.38 duyarlı, %53.57 özgül, VITEK 2 %97.87 duyarlılık, %50 özgüllükte bulunmuştur. İki ticari sistem için kolistin duyarlılık ve özgüllükleri referans yöntemle karşılaştırıldığında birbirine yakın değerler verdiği gözlenmiştir. Her iki sistemde duyarlılıkları çok iyi ancak özgüllüklerinin düşük olduğu görülmektedir. MicroScan çok büyük hata oranı %16, VITEK 2 ile %18 olarak bulunmuştur. MicroScan için büyük hata oranı %6 iken, VITEK 2 için büyük hata oranı %1.3 olduğu belirlenmiştir. Kategorik uyum; MicroScan %83, VITEK 2 %85 bulunmuştur. Hastalara uygun antibiyoterapinin yapılabilmesi için, hata oranlarının en az seviyede olduğu, özgüllük ve duyarlılığı yüksek ve tekrarlanabilir bir duyarlılık test yöntemi tercih edilmelidir. Sıvı mikrodilüsyon yöntemi zahmetli ve pahalı bir yöntem olduğundan rutinde kullanımı zordur. Bunun için sıvı mikrodilüsyonla kategorik uyumu, duyarlılığı ve özgüllüğü yüksek, ticari sistemlerin kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Carbapenamase-resistant nosocomial and community-acquired Gram-negative bacterial infections are increasing worldwide. Increased dissemination of carbapenem resistant strains among hospitalized patients has become a source of concern. Carbapenems (imipenem, meropenem, ertapenem) are frequently used as the last therapeutic option in the treatment of infections caused by multi-drug resistant non-fermentative and extended spectrum beta-lactamase (ESBL) positive Enterobacteriaceae. In recent years, however, the use of colistin is also increasing due to an increase in carbapenem resistant Enterobacteriaceae infections. Different test methods are available to determine the sensitivity of colistin. EUCAST and CLSI joint recommendation reference method is broth microdilution method. In this study, it was aimed to compare colistin susceptibility and commercial broth microdilution test, VITEK 2 [BioMerieux, France] and MicroScan [Beckman Coulter, CA, USA] systems in the determination of colistin sensitivity in carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii isolates. 25 A. baumannii, 25 K. pneumoniae and 25 P. aeruginosa isolates resistant to carbapenems were included in the study. Colistin susceptibility of all isolates was determined by using ISO-20776 standard broth microdilution method and VITEK 2 [BioMerieux, France] and MicroScan [Beckman Coulter, CA, USA] systems which are common recommendations of CLSI and EUCAST. Of the 75 isolates resistant to carbapenem, 47 (63%) were susceptible to colistin and 28 (37%) were resistant to broth microdilution. VITEK 2 61 (%81) were susceptible to colistin and 14 (19%) were resistant, MicroScan 55 (%73) were susceptible to colistin and 20 (%27) were resistant. In determining the sensitivity of colistin, MicroScan was found to be %86.38 sensitive, %53.57 specific, VITEK 2 %97.87 sensitivity and %50 specificity. Colistin sensitivity and specificity were similar for the two commercial systems when compared with the reference method. Sensitivity in both systems is very good but low specificity. MicroScan has a very majör error rate of %16 and VITEK 2 with %18. The major error rate for MicroScan was %6, while the major error rate for VITEK 2 was %1.3. Categorical agreement; MicroScan was found to be %83 and VITEK 2 was %85. In order to provide appropriate antibiotherapy to patients, a reproducible sensitivity test method with a high specificity and sensitivity and minimum error rate should be preferred for appropriate antibiotherapy. Broth microdilution method is difficult use because it is expensive and laborious. It was concluded that commercial systems with high categorical compatibility, sensitivity and specificity can be used with broth microdilution.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    786519

    Karbapenem dirençli escherichia coli ve klebsiella pneumoniae klinik izolatlarında polimiksin B duyarlılığının sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle saptanması ve bu yöntemin disk difüzyon testi ile karşılaştırılması

    Determination of polymyxin B sensitivity in clinical insulations of carbapenem resistant escherichia coli and klebsiella pneumoniae by broth microdilution method and comparison of this method with disk diffusion test

    MUHAMMET ÇELİK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiDicle Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZAHAT AKPOLAT

  2. Tez No

    996672

    Erişkin yoğun bakım ünitesindeki hastaların alt solunum yolu örneklerindeki bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları

    Bacteria and antibiotic susceptibilities in lower respiratory tract samples of adult intensive care unit patients

    HANDE KAYMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    MikrobiyolojiDüzce Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İDRİS ŞAHİN

  3. Tez No

    909818

    Klebsiella, acinetobacter ve pseudomonas suşlarında kolistin duyarlılığının belirlenmesinde otomatize sistem sonuçları ile broth mikrodilüsyon testinin karşılaştırılması

    Comparison of automated system results and broth microdilution test in the determination of colistin susceptibility in klebsiella, acinetobacter and pseudomonas strains

    HATİCE BULUT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiKırıkkale Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERDAR GÜL

  4. Tez No

    711061

    Karbapenem dirençli izolatlarda (Klebsiella SPP., Escherichia coli) hızlı karbapenemaz tespit yöntemi (The rapid carbapenemase detection method, rCDM) ile karbapenemaz üretiminin fenotipik olarak saptanması

    Phenotypical detection of carbapenemase production by the rapid carbapenemase detection method (rCDM) in carbapenem resistant isolates (klebsiella SPP., escherichia coli)

    ŞEYMA ÇALIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEBAHAT AKSARAY

    UZMAN NİLGÜN KANSAK

  5. Tez No

    991711

    Hastane kaynaklı çoğul ilaca dirençli Klebsiella pneumoniae ve Pseudomonas aeruginosa suşlarında seftolozan-tazobaktam ve meropenem-vaborbaktam duyarlılıklarının e-test yöntemi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of ceftolozan-tazobactam and meropenem-vaborbactam susceptibility in hospital-acquired multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa strains by e-test method

    ÖZLEM ÖZTEKİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇİĞDEM ATAMAN HATİPOĞLU

Geri Dön