Investigating SNX3 binding motif on EGFR
EGFR üzerindeki SNX3 bağlanma motifinin araştırılması
- Tez No: 582335
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Onkoloji, Biology, Molecular Medicine, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
SNX3, retromer komplesi içersinde yer alan bir proteindir ve kargo proteinlerinin tanınması ve trafik edilmesinde rol oynar. SNX3 retromeri, kargo proteinlerinin ya hücre zarına ya da golgi aygıtı ağına geri kazanımını sağlar. Son çalışmalar, SNX3'ün kargo proteinini, kargonun sitoplasmik ucunda bulunan geri kazanım motifi ile spesifik olarak tanıdığını göstermektedir. SNX3'ün reseptör geri kazanımındaki önemini düşünüldüğünde, EGFR'ın da SNX3 retromeri tarafından tanınan ve geri kazanımı sağlanan proteinlerden bir tanesi olacağı hipotezini kurduk. EGFR ile SNX3 arasındaki potansiyel ilişkinin araştırılması amacıyla bölgeye özgü mutagenez ve immunopresipitasyon yöntemleri kullanılmıştır. Bu çalışmadan elde edilen ön bulgular, protein-protein ilişkisinin ortaya konmasına yönelik ileri araştırmalara öncülük edecektir.
Özet (Çeviri)
Sorting Nexin 3 (SNX3) is a protein that is involved in retromer complex and has a role in recognition and trafficking of retromer cargo proteins. SNX3-retromer provides the recycling of their cargo proteins back to the plasma membrane or to Trans Golgi Network. Recent studies reveal the specificity of SNX3 in cargo recognition by acting on a recycling motif on receptor cytoplasmic tails. Considering the importance of SNX3 in receptor recycling, we hypothesized that EGFR can be one of the cargo proteins that is recognized and recycled by the SNX3-retromer. We used site-directed mutagenesis, Co-IP techniques to investigate a potential link between SNX3 and EGFR. Preliminary findings from this work will guide future experiments to further investigate protein-protein interaction.
Benzer Tezler
- Investigation of SNX3 in colon cancer
Kolon kanserinde SNX3 ün araştırılması
HARUN CİNGÖZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Spektral analiz yöntemi ile faiz oranlarındaki düzenli dalgalanmaların incelenmesi
Investigating cyclical movements on interes rates with spectral techniques
AHMET METE ÇİLİNGİRTÜRK
- Konya kapalı havzasındaki bazı akarsuların sulama suyu kalitelerinin araştırılması
Investigating the irrigation water quality of some streams with in the Konya closed basin
ALİ DEDE TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
İnşaat MühendisliğiSelçuk Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ATİLA DORUM
- Operatör katsayılı diferansiyel operatörlerin ağırlıklı izinin ve düzenli izinin incelenmesi
Investigating the weighted and regular traces of operator coefficient differential operators
AKIN TAŞDİZEN
Doktora
Türkçe
1999
MatematikYıldız Teknik ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EHLİMAN ADIGÖZELOV
- Antalya ve çevresinde kültür bitkilerinde zararlı olan beyazsinek türlerinin (homoptera: aleyrodidae) aflp (amplified fragment length polymorphism) tekniği kullanılarak incelenmesi
Investigating whiteflies obtained from at various locations of Antalya using aflp (amplified fragment lenght polymorphism) technique
ZÜBEYİR DEVRAN