Bazı kı̇nolı̇n türevı̇ bı̇leşı̇klerı̇n krı̇stal yapılarının, COVID-19a karşı etkı̇lerı̇nı̇n deneysel ve hesaplamalı yöntemlerle ı̇ncelenmesı̇
Investigation of the crystal structures and the effects against the COVID-19 of some quinoli̇ne derivative compounds by experimental and computational methods
- Tez No: 637707
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NECMİ DEGE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Bu tez çalışmasında, iki tane kinolin bileşikleri olan 5-((1H-imidazol-1-yl)metil) kinolin-8-ol) (C13H11N3O) ve 5-((1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)metil)kinolin-8-ol (C16H12N4O) sentezlenmiştir. X-ışını kırınımı yöntemi ile sentezlenen organik bileşiklerin bağ uzunlukları, bağ açıları, torsiyon açıları, moleküller arası hidrojen bağları belirlenmiştir. Monoklinik sistemde uzay grubu P21/c olan C13H11N3O bileşiğin birim hücre parametreleri sırasıyla; a (Å); b (Å); c (Å); 10,2882 (5); 9,7521 (6); 11,0496 (5)'dir. Monoklinik sistemde uzay grubu P21/c olan C15H14N2O5 bileşiğin birim hücre parametreleri sırasıyla; a (Å); b (Å); c (Å); 4,7531 (4); 11,7276 (10); 27,359 (2)'dir. Bileşiklerin yapısı spektroskopik yöntemlerden ise ESI-MS, 1H- NMR, 13C-NMR ve FT-IR spektroskopisi ile aydınlatılmaya çalışılmıştır. Moleküller arası etkileşim hakkında ilave bir bilgi almamızı sağlayan üç boyutlu Hirshfeld yüzeyi ve 2 boyutlu gösterimi (parmak izi çizimi) CrystalExplorer3.1 programı kullanılarak oluşturulmuştur. Son olarak, C13H11N3O ve C16H12N4O ligandları ile COVID-19/6WCF ve COVID-19/6Y84 reseptörleri arasındaki moleküler yerleştirme/kenetlenme mekanizması, bu bileşiklerin aktif bölgelerdeki bağlanma modlarını araştırmak için çalışılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, two quinoline compounds 5-(1H-imidazol-1-yl)methyl)quinolin-8-ol, (C13H11N3O) and 5-((1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)methyl)quinolin-8-ol, (C16H12N4O) were synthesized. Bond lengths, bond angles, torsion angles and intermolecular hydrogen bonds of synthesized organic compounds were investigated by X-ray diffraction method. In the monoclinic system, the unit cell parameters of the compound C13H11N3O with the space group P21/c are; a (Å); b (Å); c (Å); 10,2882 (5); 9,7521 (6); 11,0496 (5), respectively. In the monoclinic system, the unit cell parameters of the compound C16H12N4O with the space group P21/c are; a (Å); b (Å); c (Å); 64,7531 (4); 11,7276 (10); 27,359 (2), respectively. The molecular structures of these compounds were investigated by spectroscopic methods as ESI- MS, 1H-NMR, 13C-NMR and FT-IR spectroscopy. The three-dimensional Hirshfeld surfaces and their 2D representations (fingerprint drawing), which allow us to obtain additional information on intermolecular interactions, were created using the CrystalExplorer3.1 program. Finally, the molecular docking mechanism between C13H11N3O and C16H12N4O ligands and COVID-19/6WCF and COVID-19/6Y84 receptors were studied to explore the binding modes of these compounds at the active sites.
Benzer Tezler
- 8-kinolinoksi sübstitüentli ftalosiyaninlerin sentezi
The synthesis of 8-quinolinoxy-substituted phthalocyanines
MELEK NAKŞİ
- Yeni sentezlenmiş bazı kinolin bileşiklerinin antiproliferatif ve sitotoksik aktivitelerinin in vitro olarak belirlenmesi
Determination of in vitro antiproliferative and cytotoxic activities of some newly synthesized quinolines derivatives
ÖNEM YÜCE ŞAHİN
- 2,4-dihidroksi kinolin türevi yeni diazo boyarmaddelerin sentezi ve antimikrobiyal özelliklerin incelenmesi
Synthesis of 2,4-dihydroxyquinoline derived azo dyes and investigation of antimicobial activity properties
HASSAN JABALLAH ABDULLAH MOHAMMED
- Bazı yeni pirol, piridazin, kinolin ve kinoksalin türevlerinin sentezi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of the some new pyrrole pyridazine, quinoline and quinoxaline derivatives
DERVİŞ GÖK
Doktora
Türkçe
2010
KimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CENGİZ
YRD. DOÇ. DR. RAHMİ KASIMOĞULLARI
- 4-aminoantipirin türevi heterohalkalı schıff bazlarının sentezi, karekterizasyonu ve antioksidan aktiviteleri
Synthesis, characterization and antioxidant activities of heterocycle schiff bases derived from 4-aminoantipyrine
HAKAN KIZILKAYA