Bazı kı̇nolı̇n türevı̇ bı̇leşı̇klerı̇n krı̇stal yapılarının, COVID-19a karşı etkı̇lerı̇nı̇n deneysel ve hesaplamalı yöntemlerle ı̇ncelenmesı̇
Investigation of the crystal structures and the effects against the COVID-19 of some quinoli̇ne derivative compounds by experimental and computational methods
- Tez No: 637707
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NECMİ DEGE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında, iki tane kinolin bileşikleri olan 5-((1H-imidazol-1-yl)metil) kinolin-8-ol) (C13H11N3O) ve 5-((1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)metil)kinolin-8-ol (C16H12N4O) sentezlenmiştir. X-ışını kırınımı yöntemi ile sentezlenen organik bileşiklerin bağ uzunlukları, bağ açıları, torsiyon açıları, moleküller arası hidrojen bağları belirlenmiştir. Monoklinik sistemde uzay grubu P21/c olan C13H11N3O bileşiğin birim hücre parametreleri sırasıyla; a (Å); b (Å); c (Å); 10,2882 (5); 9,7521 (6); 11,0496 (5)'dir. Monoklinik sistemde uzay grubu P21/c olan C15H14N2O5 bileşiğin birim hücre parametreleri sırasıyla; a (Å); b (Å); c (Å); 4,7531 (4); 11,7276 (10); 27,359 (2)'dir. Bileşiklerin yapısı spektroskopik yöntemlerden ise ESI-MS, 1H- NMR, 13C-NMR ve FT-IR spektroskopisi ile aydınlatılmaya çalışılmıştır. Moleküller arası etkileşim hakkında ilave bir bilgi almamızı sağlayan üç boyutlu Hirshfeld yüzeyi ve 2 boyutlu gösterimi (parmak izi çizimi) CrystalExplorer3.1 programı kullanılarak oluşturulmuştur. Son olarak, C13H11N3O ve C16H12N4O ligandları ile COVID-19/6WCF ve COVID-19/6Y84 reseptörleri arasındaki moleküler yerleştirme/kenetlenme mekanizması, bu bileşiklerin aktif bölgelerdeki bağlanma modlarını araştırmak için çalışılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, two quinoline compounds 5-(1H-imidazol-1-yl)methyl)quinolin-8-ol, (C13H11N3O) and 5-((1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)methyl)quinolin-8-ol, (C16H12N4O) were synthesized. Bond lengths, bond angles, torsion angles and intermolecular hydrogen bonds of synthesized organic compounds were investigated by X-ray diffraction method. In the monoclinic system, the unit cell parameters of the compound C13H11N3O with the space group P21/c are; a (Å); b (Å); c (Å); 10,2882 (5); 9,7521 (6); 11,0496 (5), respectively. In the monoclinic system, the unit cell parameters of the compound C16H12N4O with the space group P21/c are; a (Å); b (Å); c (Å); 64,7531 (4); 11,7276 (10); 27,359 (2), respectively. The molecular structures of these compounds were investigated by spectroscopic methods as ESI- MS, 1H-NMR, 13C-NMR and FT-IR spectroscopy. The three-dimensional Hirshfeld surfaces and their 2D representations (fingerprint drawing), which allow us to obtain additional information on intermolecular interactions, were created using the CrystalExplorer3.1 program. Finally, the molecular docking mechanism between C13H11N3O and C16H12N4O ligands and COVID-19/6WCF and COVID-19/6Y84 receptors were studied to explore the binding modes of these compounds at the active sites.
Benzer Tezler
- Bazı esterlerin kinetik incelenmesi ve termodinamik parametrelerin belirlenmesi
Kinetic study and detesmination of thermodnamic parameters of some esters
İBRAHİM TAŞ
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
- Bazı sert çekirdekli meyve türlerinde döllenme biyolojisi üzerinde yöntem çalışmaları
Başlık çevirisi yok
ATBİMOĞLU ADALET
- Bazı yer ve sırık fasulye çeşitlerinde optimal melezleme şartlarının tespiti üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
TÜRKAN KOÇLU
