Hastanemizde izole edilen karbapenemlere dirençli Klebsielia pneumoniae suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin incelenmesi
The genotypic and phenotypic examination of the carbapenem resistant Kiebsiella pneumoniae strains that are isolated from our hospital
- Tez No: 665542
- Danışmanlar: DOÇ. DR. IRMAK BARAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bakanlığı
- Enstitü: Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 115
Özet
Bu çalışmada hastanemizde izole edilen karbapenem dirençli Klebsielia pneumoniae (KDKP) suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması ve karbapenem direncine sebep olan genetik mekanizmaların incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 62 KDKP suşu alınmıştır. Vitek-2 (bioMerieux, Fransa) cihazı ile isimlendirilmiş ve antibiyotik duyarlılıkları belirlenmiştir. Karbapenem MİK değerleri ayrıca E-test ile de çalışılmıştır. KDKPların klonal analizleri rep-PCR (bioMerieux, Fransa) yöntemi kullanılarak yapılmıştır. Bu yöntemle 62 suş arasından, 21 suş içeren 6 klon, 4 suş içeren iki benzer grup belirlenmiş, 37 suşun ise hiçbir suşla benzeşmediği görülmüş ve suşlar arasındaki direnç yayılımının klonal yayılım olmadığı düşünülmüştür. Karbapenemaz direnç genlerinden olan IMP, VIM, KPC, NDM-1 ve OXA-48 Multipleks PCR (hyplex® SuperBug ID) ile çalışılmıştır ve 62 suşun 57'sinde sadece OXA-48 geni pozitif bulunmuş, diğerlerinde ise hiç bir gen tespit edilememiştir. PCR sonuçları referans alınarak, fenotipik testlerle PCR uyumu karşılaştın İm ıştır. Imipenem, meropenem ve ertapenem MİK değerleri İstatistiksel analizlerine göre imipenem E-test ve imipenem Vitek-2 sonuçlarının OXA-48 pozitifliğini ayırıcılığı açısından daha belirleyici olduğu bulunmuştur. Hastanemizde izole edilen KDKP suşlarının karbapenem direncinden OXA-48'in IS1999'a bağlı yüksek düzeyde üretimi ve bunlara eşlik eden aminoglikozid modifiye edici ve pompa atım sistemlerini düzenleyen enzimlerde oluşan mutasyonlar, porin defektleri, GSBL ve kinolon direnci varlığının sorumlu olabileceği düşünülmüştür.
Özet (Çeviri)
İt has been intented to examine the genotypic and phenotypic properties of the carbapenem resistant kiebsiella pneumoniae (CRKP) strains that are isolated from our hospital and the genetic mechanisms that cause the carbapenem resistancy. A total of 62 CRKP strains have been included in this study. Named and checked for their antibiotic sensitvity vvith Vitek-2 device (bioMerieux, France). Carbapenem MIC values were also studied by E-test. CRKP clonal analyzing were done vvith using rep-PCR method (bioMerieux, France). With this method, out of 62 strains, 6 clones including 21 strains, and two groups including 4 strains were idenditified, while the other 37 strains did not match with any other strains and resistancy radiation in these strains were thuoght to be not clonal. IMP, VIM, KPC, NDM-1 ve OXA-48 being the carbapenemase resistancy genes were studied vvith Multipleks PCR (hyplex® SuperBug İD) and out of 62 strains, OXA-48 gene was found positive in only 57 of them, vvhile on the remaining strains none of the genes were found. Refering to the PCR results, phenotypic tests and the PCR was matched. According to Imipenem, meropenem ve ertapenem MIC values statical analyzes, imipenem E-test and imipenem Vitek-2 resulrs were more identifying for OXA-48 pozitivity. OXA-48's IS1999 dependent high amount production, porin defects, ESBL and kinolon resistancy, and the mutations on the enzymes regulating the pumping out and aminoglycoside modifying systems accompanying these are tought to be responsible for the CRKP strains1 carbapenem resistancy (that were isolated from our hospital).
Benzer Tezler
- Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarındaki karbapenemaz varlığının araştırılması
Investigation of carbapenemase presence in klebsiella pneumoniae isolates obtained from various clinical samples in Microbiology Laboratory of Süleyman Demirel University of Faculty of Medicine hospital
ESRA ÇİFTÇİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL SESLİ ÇETİN
- Hastanemizde izole edilen Klebsiella spp. ve Escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların genotipik tiplendirmesi
Genotypic Typing of Extended-Spectrum ß-Lactamase of Klebsiella spp. and Escherichia coli Strains isolated in our Hospital
NURAN AKMİRZA İNCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLHAMİ ÇELİK
- Toplum ve hastane kaynaklı klebsiella pneumoniae suşlarında oxa-48 ve alt türevlerinin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determining OXO-48 and its variants with conventional and molecular methods in klebsiella pneumoniae isolates originated from community and hospital
ARZU UYANIK PARLAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
- İstanbul Tıp Fakültesi hastanesinde izole edilen karbapenemlere dirençli gram-negatif enterik çomaklarda antibiyotik direnç oranları, mekanizmaları ve antibiyotik direnç gelişimine neden olan risk faktörlerinin araştırılması
Evaluation of risk factors leading to development of antibiotic resistance, ratios and mechanisms of antibiotic resistance in carbapenemase-resistant GRAM negative enteric bacilli cultured in İstanbul Medical Faculty
ASİYE YİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARİF ATAHAN ÇAĞATAY
- Enterobacteriaceae üyelerinde karbapenem direnci ve dirençten sorumlu enzimlerin varlığının araştırılması
Investigation of carbapenem resistance in enterobacteriaceae species and the presence of the enzymes responsible from resistance
ASLI BULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GÜLŞAH AŞIK