Geri Dön

Cloning of beta hemolysin gene from coagulase-negative staphylococci and testing of biological activity

Koagulaz negatif stafilokoklardan beta hemolizin geninin klonlanması ve biyolojik aktivitesinin gösterilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 667904
  2. Yazar: SAHD ALI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GAMZE BAŞBÜLBÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 69

Özet

Koagülaz negatif stafilokoklar (KNS) serbest plazma koagülaz üretememelerinden dolayı yakından ilişkili oldukları fakat onlardan daha virulent olan S. aureus'dan ayrılmaktadırlar. KNS'lar, damar içi araç enfeksiyonlarından kaynaklanan en yaygın bakteriyemi sebebidir. Günümüzde önemli türler olan S. epidermidis ve S. haemolyticus klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında hastane kaynaklı ana patojenleri temsil etmektedirler. Beta Hemolizin (hlb), S. epidermidis'in patogeneziyle ilişkili önemli bir virülans molekülü olarak hizmet etmektedir. Bu sitotoksin iki ayrı aksiyon mekanizmasına sahiptir. Bunlar: sfingomiyelinaz aktivitesi ve DNA biyofilm ligaz aktivitesi yani β-toksinin eksogenoz DNA varlığında kendisini çapraz bağlama yeteneğidir. Bu çalışmada, Beta Hemolizin (hlb) proteinin aktivitesini ele almak için diyabetik ayak enfeksiyonlarından (DFI) alınan örneklerden S. epidermidis suşları kullanılmıştır. hlb genini çoğaltmak için KpnI ve EcoRI restriksiyon bölgeleri eklenmiş modifiye primerler dizayn edilmiştir. Çoğaltılmış gen vektör olarak pUC19 plazmidi kullanılarak klonlanmış ve sekans analizine gönderilmiştir. Sekans sonuçlarına göre klonlandığımız gen, (Staphylococcus epidermidis strain Q47 sphingomyeline phosphodiesterase) genine 98.95% benzerlik göstermiştir. Kanlı agarda hemoliz testi yapılarak rekombinant protein varlığı doğrulanmıştır.

Özet (Çeviri)

Coagulase-negative staphylococci (CoNS) are differentiated from the closely related but more virulent Staphylococcus aureus by their inability to produce free plasma coagulase. Coagulase-negative staphylococci are common etiologies of bacteremia that are resulted from intravascular device infections. They now represent one of the major nosocomial pathogens in clinical microbiology laboratories with S. epidermidis and S. haemolyticus being the significant species. Beta hemolysin (hlb) serves as an important virulence molecule involved in the pathogenesis of S. epidermidis. This cytotoxin has two distinct mechanisms of action; Sphingomyelinase activity and DNA bio-film ligase activity (i.e. the ability of β-toxin to cross-link itself in the presence of exogenous DNA). In this study, strains of S. epidermidis cultured from foot infections from diabetic patients were used. Primers with attached KpnI and EcoRI restriction sites were designed to amplify the hlb gene. The gene was subjected to cloning using pUC19 plasmid as a vector. After cloning, the amplicon obtained by M13 PCR was sent for confirmation by sequencing. From the sequence result, a percentage similarity rate of 98.95% of (Staphylococcus epidermidis strain Q47 sphingomyeline phosphodiesterase) was confirmed as expected. The recombinant protein was tested on a sheep blood agar which showed hemolysis of erythrocytes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    119126

    Cloning of alpha and beta subunit genes of 20 S proteasome from thermoplasma volcanium

    Thermoplasma volcanium'un 20 S proteazom alfa ve beta altünite genlerinin klonlanması

    GÖNÜL SEYİT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

    DOÇ. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Tez No

    195496

    Klebsiella pneumoniae ve escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz genlerinin klonlanması

    Cloning of the extended spectrum beta-lactamases of klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains

    HİLAL ÖZKUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ZEYNEP GÜLAY

  3. Tez No

    392268

    Cloning and expression of beta subunit (AGB1) of heterotrimeric G-protein complex from a.thaliana

    A.thaliana heterotrimerik G proteini beta alt birimi(AGB1)nin klonlanmasi ve ekspres edilmesi

    ELİF MOLLAMEHMETOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA SAYERS

  4. Tez No

    434176

    Termofilik Anoxybacillus flavithermus bakterisinin ısıl kararlı β-glukozidaz geninin klonlanması, ekspresyonu ve biyokimyasal karakterizasyonu

    Cloning and expression of Afbgl gene from, Anoxybacillus flavithermus and biochemical characterization of thermophilic β-glucosidase

    AYTÜL UZUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FATİH ŞABAN BERİŞ

  5. Tez No

    681687

    Şeker pancarında tepe kıvırcıklığı virüsünün moleküler karakterizasyonu ve vektörel klonlanması

    Molecular characterization and vector cloning of beet curl top virus in sugar beet

    CANSU CAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyoteknolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KUBİLAY YILDIRIM

Geri Dön