Geri Dön

Cloning of beta hemolysin gene from coagulase-negative staphylococci and testing of biological activity

Koagulaz negatif stafilokoklardan beta hemolizin geninin klonlanması ve biyolojik aktivitesinin gösterilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 667904
  2. Yazar: SAHD ALI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GAMZE BAŞBÜLBÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji, Microbiology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Gen klonlama, Moleküler klonlama, Gene cloning, Molecular cloning
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Koagülaz negatif stafilokoklar (KNS) serbest plazma koagülaz üretememelerinden dolayı yakından ilişkili oldukları fakat onlardan daha virulent olan S. aureus'dan ayrılmaktadırlar. KNS'lar, damar içi araç enfeksiyonlarından kaynaklanan en yaygın bakteriyemi sebebidir. Günümüzde önemli türler olan S. epidermidis ve S. haemolyticus klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında hastane kaynaklı ana patojenleri temsil etmektedirler. Beta Hemolizin (hlb), S. epidermidis'in patogeneziyle ilişkili önemli bir virülans molekülü olarak hizmet etmektedir. Bu sitotoksin iki ayrı aksiyon mekanizmasına sahiptir. Bunlar: sfingomiyelinaz aktivitesi ve DNA biyofilm ligaz aktivitesi yani β-toksinin eksogenoz DNA varlığında kendisini çapraz bağlama yeteneğidir. Bu çalışmada, Beta Hemolizin (hlb) proteinin aktivitesini ele almak için diyabetik ayak enfeksiyonlarından (DFI) alınan örneklerden S. epidermidis suşları kullanılmıştır. hlb genini çoğaltmak için KpnI ve EcoRI restriksiyon bölgeleri eklenmiş modifiye primerler dizayn edilmiştir. Çoğaltılmış gen vektör olarak pUC19 plazmidi kullanılarak klonlanmış ve sekans analizine gönderilmiştir. Sekans sonuçlarına göre klonlandığımız gen, (Staphylococcus epidermidis strain Q47 sphingomyeline phosphodiesterase) genine 98.95% benzerlik göstermiştir. Kanlı agarda hemoliz testi yapılarak rekombinant protein varlığı doğrulanmıştır.

Özet (Çeviri)

Coagulase-negative staphylococci (CoNS) are differentiated from the closely related but more virulent Staphylococcus aureus by their inability to produce free plasma coagulase. Coagulase-negative staphylococci are common etiologies of bacteremia that are resulted from intravascular device infections. They now represent one of the major nosocomial pathogens in clinical microbiology laboratories with S. epidermidis and S. haemolyticus being the significant species. Beta hemolysin (hlb) serves as an important virulence molecule involved in the pathogenesis of S. epidermidis. This cytotoxin has two distinct mechanisms of action; Sphingomyelinase activity and DNA bio-film ligase activity (i.e. the ability of β-toxin to cross-link itself in the presence of exogenous DNA). In this study, strains of S. epidermidis cultured from foot infections from diabetic patients were used. Primers with attached KpnI and EcoRI restriction sites were designed to amplify the hlb gene. The gene was subjected to cloning using pUC19 plasmid as a vector. After cloning, the amplicon obtained by M13 PCR was sent for confirmation by sequencing. From the sequence result, a percentage similarity rate of 98.95% of (Staphylococcus epidermidis strain Q47 sphingomyeline phosphodiesterase) was confirmed as expected. The recombinant protein was tested on a sheep blood agar which showed hemolysis of erythrocytes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    119126

    Cloning of alpha and beta subunit genes of 20 S proteasome from thermoplasma volcanium

    Thermoplasma volcanium'un 20 S proteazom alfa ve beta altünite genlerinin klonlanması

    GÖNÜL SEYİT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

    DOÇ. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Tez No

    392268

    Cloning and expression of beta subunit (AGB1) of heterotrimeric G-protein complex from a.thaliana

    A.thaliana heterotrimerik G proteini beta alt birimi(AGB1)nin klonlanmasi ve ekspres edilmesi

    ELİF MOLLAMEHMETOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA SAYERS

  3. Tez No

    781071

    Cloning of 32-mer MaSP1 Gene into pBbB6c plasmid vector and transformation to Escherichia coli neb 10-beta

    32-mer MaSP1 geninin pBbB6c plazmid vektörüne klonlanmasi ve Escherichia coli neb 10-beta'ya transformasyonu

    RUVEYDA BENK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyomühendislikAbdullah Gül Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FATİH ORTAKCI

    DR. YAHYA ÖZ

  4. Tez No

    609809

    Molecular studies on the cloning and expression of human beta interferon gene in E. coli

    İnsan beta interferon geninin klonlanması ve E.coli'de ekspresyonu üzerine moleküler çalışmalar

    ZALİHE OMAY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    GenetikBolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  5. Tez No

    204085

    Acinetobacter baumannii kökenli beta-laktamaz OXA-23 geninin klonlanması ve enzim karakterizasyonu

    Cloning of Acinetobacter baumannii originated beta-lactamase OXA-23 gene and enzyme characterization

    SİNEM TOROL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyofizikKocaeli Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MURAT KASAP

Geri Dön