Farklı kaynaklardan izole edilen Arcobacter türlerinde virülans genlerin tespiti
Detection of virulence genes of Arcobacter strains isolated from various sources
- Tez No: 677687
- Danışmanlar: PROF. DR. TUBA İÇA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Antibiyotik duyarlılığı, Arcobacter türleri, Biyofilm oluşumu, Virülans genler, Antibiotic susceptibility, Arcobacter spp, Biofilm formation, Virulence genes
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kütahya Dumlupınar Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 120
Özet
Bu çalışmada, Kütahya ilinde çeşitli kasap ve marketlerden toplanan 22 adet kıyma örneğinde Arcobacter spp. varlığı araştırılmıştır. Ayrıca KDPÜ Kültür Koleksiyonunda yer alan tavuk karkas ve su örneklerinden izole edilen Arcobacter türleri de tez çalışmasına dahil edilmiş ve tüm suşlarda olası virülans genlerin varlığı, antibiyotik duyarlılıkları değerlendirilmiştir. Kıyma örneklerinden elde edilen izolatların ayrıca farklı atmosferik koşullarda, biyofilm oluşturma özellikleri araştırılmıştır. Moleküler yöntemler ile kıyma örneklerinde %31,8 oranında pozitiflik tespit edilmiştir. Bu suşlar tür bazında değerlendirildiğinde %85,7'sinin Arcobacter butzleri, %14,3'ünün ise Arcobacter cryaerophilus olduğu saptanmıştır. Toplamda 30 Arkobakter suşu mPCR yöntemi ile olası virülans genler yönünden (ciaB, tlyA, cadF, pldA,cj1349, irgA, mviN, hecA ve hecB) taranmıştır. Suşların tamamında ciaB genine rastlanmıştır.Suşların %96,6'sı mviN, %90'ı tlyA, %86,6'sı cadF, pldA ve cj1349 ve %76,6'sı irgA olası virülans genleri bakımından pozitif bulunmuştur. Suşların hiçbirinde hecA, hecB olası virülans genlerine rastlanmamıştır. Kıyma örneklerinden izole edilen Arcobacter türlerinde zayıf biyofilm oluşumu gözlenmiştir. İzolasyonu yapılan tüm Arcobacter suşlarının dokuz adet antibiyotiğe karşı duyarlılıkları araştırılmıştır. İncelenen suşların tümünün gentamisine ve tetrasikline duyarlı olduğu gözlemlenmiştir. %30'u Sulfamethoxozole'e, %56,6'sı Ciproflaxacin'e, %96,6'sı Cephalothin'e, %100'u Ampicillin'e, %30'u Erythromycin'e, %96,6'sı Cefoxitin'e ve %3,3'ü Streptomycin'e dirençli olduğu sonuçları elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, Arcobacter spp. existence was investigated in 22 cattle and lamb mince samples collected from various butchers and markets, in Kütahya. In addition, Arcobacter species isolated from chicken carcass and water samples in the DPU Culture Collection were included in the thesis study and the presence of putative virulence genes and antibiotic susceptibility in all strains were evaluated. Biofilm formation properties of isolates obtained from minced meat samples were also investigated under different atmospheric conditions. With molecular methods, 31,8% positivity was detected in of minced meat samples. When these strains were evaluated on the basis of species, it was determined that 85,7% of them were Arcobacter butzleri and 14,3% of them were Arcobacter cryaerophilus. A total of 30 Arcobacter samples were screened for putative virulence genes (ciaB, tlyA, cadF, pldA, cj1349, irgA, mviN, hecA and hecB) by mPCR method. The ciaB gene was found in all strains. 96,6% of the strains were positive for mviN, 90% for tlyA, 86,6% for cadF, pldA and cj1349 and 76,6% for irgA putative virulence genes. HecA, hecB putative virulence genes were not found in any of the strains. Weak biofilm formation was observed in Arcobacter species isolated from minced meat samples. The susceptibility of all isolated Arcobacter strains against to nine antibiotics was investigated. It was observed that all examined strains were sensitive to gentamicin and tetracycline. 30% are resistant to Sulfamethoxozole, 56,6% to Ciproflaxacin, 96,6% to Cephalothin, 100% to Ampicillin, 30% to Erythromycin, 96,6% to Cefoxitin and 3,3% to Streptomycin.
Benzer Tezler
- Kütahya ilinden toplanan su örneklerinde arcobacter türlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu
Isolation and characterization of arcobacter species from water samples collected from kutahya province
MEHTAP TUNÇEL
- Isolation of Arcobacter species from different water sources and characterization of isolated species by molecular techniques
Çeşitli su kaynaklarından Arcobacter türlerinin izolasyonu ve izole edilen türlerin moleküler yöntemlerle tanımlanması
FUNDA AKINCIOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YUSUF BARAN
PROF. DR. HALİL İBRAHİM ATABAY
- Farklı kaynaklardan izole edilen salmonella suşlarının bazı virülans faktörlerinin incelenmesi
Investigation of some virulence factors of salmonella strains isolated from different sources
ZAVEN AĞAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYTEN ERDEM
- Farklı kaynaklardan izole edilen laktik asit bakterilerinin bazı probiyotik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some probiotic properties of lactic acid bacteria isolated from different sources
MELDA ONUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Gıda MühendisliğiMuş Alparslan ÜniversitesiGıda Güvenliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HARUN ÖNLÜ
- Farklı kaynaklardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarda ramnolipid üretimi üzerine çalışmalar
A study on production of rhamnolipid by Pseudomonas aeruginosa isolated from different resources
BANU KAŞKATEPE
Doktora
Türkçe
2013
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SULHİYE YILDIZ