Geri Dön

Antibiyotik dirençli Staphylococcus aureus suşlarının enfeksiyonlarına karşı bakteriyojfaj litik aktivitesinin araştırılması

Detection of bacteriophage lytic cycle activity against infections of antibiotic resistant Staphylococcus aureus strains

  1. Tez No: 678947
  2. Yazar: MUSTAFA FOUAD ABBAS AL-KADHIMI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Son yıllarda antibiyotik dirençli bakteri suşlarındaki artış enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde ciddi bir tehdit haline gelmiştir. Staphylococcus aureus suşlarına karşı ilaç direnci, özellikle gelişmiş ülkelerde hastane enfeksiyon etkeni olarak büyük bir sorun oluşturmaktadır. Bu durum antibiyotiklere alternatif tedavi yöntemleri veya stratejileri geliştirmenin önemini göstermektedir. Bu tez kapsamında fırsatçı bir Gram-pozitif patojen olan çoklu antibiyotik dirençli S. aureus bakterisine özgü litik aktivitesi yüksek bakteriyofajlar izole edilerek, faj dinamiklerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Çalışmamız Irak–Thi Qar Al-Husseyin Eğitim Ve Araştırma Hastanesi biyokimya laboratuarından antibiyotik dirençli bakteriler seçilerek kültür koleksiyonu stoklarından alınacaktır. Çalışmamızda Antibiyotik dirençli 120 adet S. aureus bakteri izolatı, bir tane referans S. auresus ATCC 29213 bakteri suşu ve negatif kontrol olarak P. aeruginosa ATCC 27853 bakteri suşu kullanılacaktır antibiyotik dirençli 25 S. aureus izolatları LB broth içerisinde 24 saat süre ile 37 °C'de aerobik şartlarda inkübe edilerek canlandırılmıştır. Araştırmamızda S. aureus–spesifik faj izolasyonu amacıyla 20 adet farklı lokasyonlardan alınan atık su örneği incelenmiş olup; bunlardan 3 adet S. aureus– spesifik faj izole edilmiştir. Daha sonra izole edilen bu fajların litik spektrumu en geniş olan bir adet faj belirlenerek SA/EMEL_001 olarak adlandırılmıştır. Akabinde SA/EMEL_001 fajı saflaştırıldıktan sonra faj dinamikleri (liziz süresi, adsorbsiyon oranı vb.) belirlenmiştir. Toplam 25 adet S. aureus bakteri suşundan 17 (%68) tanesinin SA/EMEL_001'e duyarlı, 7 (%28) tanesinin az duyarlı, 1 (%4) tanesinin ise dirençli olduğu saptanmıştır. Bu çalışmada izole edilip saflaştırılan S. aureus–spesifik SA/EMEL_001 fajının litik etkinliğinin oldukça yüksek olması (%96) bu fajın gerek tek başına gerekse faj kokteylleri içerisinde terapotik amaçla kullanma potansiyelinin olduğu sonucuna varılmıştır. Ancak, bu fajın terapotik amaçla kullanımından önce tam genom analizleri ve toksisite deneylerinin yapılması gerekmedir.

Özet (Çeviri)

The increase in antibiotic resistant bacterial strains in recent years has become a serious threat in the treatment of infectious diseases. Drug resistance against Staphylococcus aureus strains poses a major problem as a nosocomial infection agent, especially in developed countries. This shows the importance of developing alternative treatment methods or strategies to antibiotics. In this thesis, it was aimed to determine phage dynamics by isolating bacteriophages with high lytic activity specific to multiple antibiotic resistant S. aureus bacteria, an opportunistic Gram-positive pathogen. Our study will be taken from the culture collection stocks by selecting antibiotic resistant bacteria from the biochemistry laboratory of the Iraq –Thi Qar Al-Husseyin Training and Research Hospital. Antibiotic resistant 25 S. aureus isolates will be used in LB broth for 24 hours at 37 ° C for 24 hours. It was animated by incubating in aerobic conditions. In our study, 20 wastewater samples taken from different locations for the purpose of S. aureus-specific phage isolation were examined; from these, 3 S. aureus-specific phages were isolated. Later, one phage with the widest lytic spectrum of these phages isolated was determined and named SA / EMEL_001. Subsequently, phage dynamics (lysis time, adsorption rate etc.) were determined after SA / EMEL_001 phage was purified. It was determined that 17 (68%) of a total of 25 S. aureus strains were sensitive to SA / EMEL_001, 7 (28%) were less sensitive and 1 (4%) was resistant. The lytic activity of S. aureus-specific SA / EMEL_001 phage isolated and purified in this study is quite high (96%). It has been concluded that this phage has the potential to be used for therapeutic purposes either alone or in phage cocktails. However, full genome analyzes and toxicity experiments are required prior to the therapeutic use of this phage.

Benzer Tezler

  1. Çocuklarda toplum kökenli ve hastane kökenli enfeksiyon etkeni olan staphylococcus aureus suşlarının antibiyotik duyarlılıkları ve virülans faktörleri açısından karşılaştırılması

    Comparison of antibiotic susceptibility and virülance factors of staphylococcus aureus strains causing community acquired and health-care associated pediatric infections

    ADEM KARBUZ

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERGİN ÇİFTCİ

  2. Metisilin dirençli staphylococcus aureus üremesi tespit edilen çocuk hastaların, klinik, epidemiyolojik özellikleri ve vankomisin heterojen ve vankomisin orta duyarlı izolatların klinik yansımaları

    Clinical and epidemiological characteristics of children with methicillin-resistant staphylococcus aureus and clinical reflections of vancomycin heterogeneous and vancomycin intermediate staphylococcus aureus

    ASLI TURGUTOĞLU YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ATEŞ KARA

  3. Erişkin yoğun bakım ünitelerinden izole edilen metisiline dirençli staphylococcus suşlarında E-test ile farklı antibiyotik mik değerlerinin araştırılması

    Methicillin-resistant staphylococcus strains isolated from adult intensive care units with E-test mic values of different antibiotic research

    NARİN GÜNDOĞUŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiDicle Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KADRİ GÜL

  4. Hastanede yatan hastalardan izole edilen mikroorganizmaların biyofilm formasyon aktiviteleri

    Biofilm formation activities of isolated microorganisms from hospitalized patients

    ABDULHAMİT ÇALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CEM ÇELİK

  5. Gram pozitif kokların in vitro kinopristin/dalfopristin duyarlılıklarının araştırılması ve diğer bazı antibiyotiklerle karşılaştrılması

    Investigation of in vitro susceptibility of gram positive cocci to quinopriston/dalfopristin and comparing the activity of this drug with some of other antibiotics'

    VEYSEL DOĞANAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. AHMET KİZİRGİL