Aspergillus brasiliensis'in sekonder metabolitlerinin saflaştırılması ve karakterizasyonlarının yapılması
Purification and characterization of secondary metabolites from Aspergillus brasiliensis
- Tez No: 690676
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL HAKKI AKGÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Aspergillus brasiliensis, sekonder metabolitler, sıvı kültür fermentasyonu, YPSK-DAD profilleme, kromatografik teknikler, Aspergillus brasiliensis, secondary metabolites, liquid culture fermentation, YPSK-DAD profilling, chromatographic techniques
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez kapsamında Aspergillus brasiliensis'in sıvı kültür fermentasyonundan elde edilen süpernatant ve misel kaynaklı ham ekstrelerde ayrı ayrı olmak üzere üretilen sekonder metabolitler incelenmiş, saflaştırılmış ve saf haldeki sekonder metabolitlerin karakterizasyonları gerçekleştirilmiştir. Preparatif sıvı kültür fermentasyonları proje kapsamındaki önceki tez çalışması ile belirlenen optimum ortam koşullarında, YES (Yeast Extract Sucrose) sıvı kültür ortamında gerçekleştirilmiştir (Üretim için optimum koşullar: C/N oranı (32), sıcaklık (25 °C), pH (6) ve çalkalama hızı (210 rpm)'dir). Sıvı kültür fermentasyonundan elde edilen süpernatant ve misel yapıları filtre edilerek, her ikisi için de ham ekstrelerde bulunan sekonder metabolitlerin saflaştırma ve takiben karakterizasyon prosesleri için Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi (YPSK-DAD) profilleri, Flash Kromatografisi, İnce Tabaka Kromatografisi (İTK), Yarı-preparatif YPSK (Prep-YPSK) ve Nükleer Manyetik Rezonans (NMR) teknikleri kullanılmıştır. Yapılan çalışmalar sonucunda hidrofilik yapıda olan sekonder metabolitlerin ham ekstrelerin süpernatant fazında, hidrofobik yapıdaki sekonder metabolitlerin ise misel fazında yoğunlaştığı tespit edilmiştir. Bu durum sıvı kültür fermentasyonu sonucunda elde edilen süpernatant ve misel yapılarının sekonder metabolit profilleri açısından fark yarattığını ortaya koymuştur. Sonuç olarak Aspergillus brasiliensis türünden; misel ekstrelerinden 1 adet ve süpernatant ekstrelerinden 6 adet olmak üzere toplamda 7 adet saf madde elde edilmiştir. Elde edilen saf maddelerin yapıları sekonder NMR analizleri ile aydınlatılmıştır. NMR analizleri ile Aspergillus brasiliensis türünden saflaştırılan bu sekonder metabolitlerin Malformin A1, Malformin A3, Malformin B3, Malformin B4, Brasenol A1 ve İtakonik asit (9- HHIA ve 10- HHIA) yapıları olduğu tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, firstly crude extracts originating from supernatant and mycelium were deduced from the liquid culture fermentation of Aspergillus brasiliensis. Then, secondary metabolites separately obtained from these crude extracts were investigated, were made pure and the pure ones among the secondary metabolites are characterized. Preparative liquid culture fermentations were carried out in YES (Yeast Extract Sucrose) broth medium under optimum culture condition (optimal culture condition for production is: C/N ratio (32), temperature (25 °C), pH (6) and agitation Speed (210 rpm)) determined by the previous thesis work within the scope of the project. Filtration was performed for the supernatant and mycelium which were obtained from liquid culture fermentation. High Performance Liquid Chromatography (HPLC-DAD) profiles, Flash Chromatography, Thin Layer Chromatography (TLC), Semi-Preparative HPLC and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) techniques were used for purification and characterization processes of secondary metabolites in crude extracts which were extracted from both types of extracts. As a result of the studies it has been observed that in supernatant crude extracts the hydrophilic metabolites were abounded whereas in mycelium crude extracts the hydrophobic metabolites were abounded. This situation reveal that the supernatant and mycelium obtained as a result of liquid culture fermentation processes differ from each other in the sense of secondary metabolite profiles. In conclusion totally 7 pure secondary metabolites, 6 from supernatant crude extracts and 1 from mycelium crude extracts, were obtained by Aspergillus brasiliensis species. The structures of the obtained pure secondary metabolites were elucidated with the analysis of NMR. NMR analysis show that these pure secondary metabolites obtained by Aspergillus brasiliensis species were in the types of Malformin A1, Malformin A3, Malformin B3, Malformin B4, Brasenol A1 and Itaconic acids (9- HHIA and 10- HHIA).
Benzer Tezler
- Aspergillus brasiliensis'ten sıvı kültür koşullarında üretilen sekonder metabolitlerin taranması
Screening of secondary metabolites produced in liquid culture conditions from aspergillus brasiliensis
HATİCE CEMRE ÜNVER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL HAKKI AKGÜN
- Farmasötik endüstride sınıflı alanlarda kullanılan bazı dezenfektanların standart mikroorganizma suşları üzerindeki etkinliği
The effects on standard microorganisms strains by activities of some of the disinfectant used in the pharmaceutical industry in classified areas
TUĞBA AKBAL
- Bazı baharatlardaki uçucu yağların kimyasal kompozisyonları ve antimikrobiyal etkileri
Chemical composition and antimicrobial effects of essential oils in some spices
ÇİĞDEM ÖZDEMİR ÖZBEK
- Pectinase production from wild strains of Aspergillus Spp. Isolated from natural resources
Doğal kaynaklardan izole edilen yabani Aspergillus türleri ile pektinaz üretimi
SERTAN CENGİZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DENİZ ÇEKMECELİOĞLU
- Doğu Akdeniz Bölgesi bağ alanlarında Botryosphaeria geriye doğru ölüm hastalığına neden olan türler, yaygınlıkları ve hastalığa karşı endofitik funguslarla mücadele olanaklarının araştırılması
Research on the species causing Botryosphaeria dieback disease in the Eastern Mediterranean Region vineyards, their prevalence and management of the disease using endophytic fungi
İZZET BÜLBÜL