Geri Dön

5 yaş altı hastaların solunum yolu örneklerinde kı polyomavirus ve wu polyomavirus sıklığının araştırılması

Investigation of the frequency of ki polyomavirus and wu polyomavirus in respiratory tract samples of patients under 5 years of age

  1. Tez No: 700741
  2. Yazar: HANİFE TUTAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KENAN MİDİLLİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Washington University polyomavirus (WUPyV), Karolinska Institute polyomavirus (KIPyV), solunum yolu enfeksiyonu
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Amaç: Solunum yolu örneklerinde KI ve WU polyomavirus sıklığını, bu viruslardan etkilenen grupları ve klinik özelliklerini araştırmayı amaçladık. Viruslar 2007'de keşfedilmiş olmasına rağmen, patojeniteleri ve virülansları henüz tam olarak aydınlatılamamıştır. Yöntem: 2016-2019 yılları arasında 5 yaşından küçük çocuk hastalardan alınan ve laboratuvarımıza gönderilen 182 nazofarengeal aspirat/sürüntü örneğini inceledik. Viruslar, kısmi VP1 gen bölgelerini hedefleyen primerler kullanılarak nested-PCR ile araştırıldı. Pozitif örnekler, doğrulama için Sanger yöntemi kullanılarak dizildi ve kısmen büyütülmüş gen bölgeleri arasındaki genetik mesafeleri karşılaştırdı. Bulgular: 182 örneğin 7'sinde (%3,8) KIPyV ve 2'sinde (%1,1) WUPyV saptandı. Bir KIPyV pozitif hasta dışında, tüm pozitif örnekler 2 yaşından küçük hastalara aitti. Tüm pozitif hastalar başta rinovirus ve parainfluenzavirus 3 ile olmak üzere koenfekteydi. KIPyV için pozitif olan hastaların dördünde hematolojik/onkolojik hastalıklar veya diğer immün yetmezlik durumları vardı. KIPyV izolatlarının tüm sekansları %100 benzer iken, WUPyV izolatlarının sekansları 4 nükleotid pozisyonunda farklılık gösterdi. Sonuç: Çalışmamızın sonuçlarına göre, KIPyV ve WUPyV enfeksiyonlarının sıklığı düşüktür, diğer viral veya bakteriyel patojenlerin neden olduğu eşzamanlı solunum yolu enfeksiyonları, immün yetmezlik, KIPyV ve WUPyV enfeksiyonları için predispozan birer faktör gibi görünmektedir. Kısmen büyütülmüş gen bölgeleri, her iki virusta da yüksek oranda korunmuştur.

Özet (Çeviri)

Objective: We aimed to investigate the frequency of KI and WU polyomavirus in respiratory tract samples, the affected groups by these viruses and their clinical characteristics. Although the viruses had been discovered in 2007, their pathogenicity and virulence have not been fully elucidated yet. Methods: We examined 182 nasopharyngeal aspirate/swab samples obtained pediatric patients younger then 5 years and sent to our laboratory between 2016- 2019. The viruses were investigated by nested-PCR using primers targeting partial VP1 gene regions. The positive samples were sequenced using Sanger method for verification and compare the genetic distances between partially amplified gene regions. Results: KIPyV was detected in 7 (3.8%) of 182 samples and WUPyV in 2 (1.1%). Except one KIPyV positive patient, all positive samples belonged to patients

Benzer Tezler

  1. 1 ay - 18 yaş arası çocuklarda multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile saptanan solunum yolu virüslerinin retrospektif olarak değerlendirilmesi

    Retrospective evaluation of respiratory tract viruses detected by multiplex polymerase chain reaction (PCR) in children between 1 month - 18 years of age

    KÜBRA ÖZKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NACİYE GÖNÜL TANIR

  2. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi çocuk kliniğinde kasım 2013-nisan 2016 tarihleri arasında influenza benzeri hastalık tablosu ile yatan hastalarda etken viral ajanların belirlenmesi

    Viral etiological agents from the nasopharyngeal samples of patients that followed-up in pediatric departments of our hospital between november 2013 and april 2016 with a diagnosis of influenza-like disease

    HALİL İBRAHİM İNCE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMA GÜLNAR ŞENSOY

  3. Alt solunum yolu infeksiyonu olan çocuklarda İnsan Metapnömovirüs prevalansının saptanması

    Detection of Human Metapneumovirus prevalance in acute respiratory tract infection children.

    AYŞEGÜL AKSOY GÖKMEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CANDAN ÇİÇEK

  4. Çocuklarda akut astım atakta ve atak sonrasında nazofarengeal sürüntüde polimeraz zincir reaksiyonu ile viral panel taraması

    Viral panel scanning via polymerase chain reaction in children for acute asthma exacerbation and post exacerbation nasopharyngeal load

    ORHAN GÜRCAN ADIGÜZEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAdnan Menderes Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU ERGE

  5. Bahar ve yaz mevsimlerinde görülen çocukluk çağı akut solunum yolları infeksiyonlarında bocavirus dna'sının saptanması

    Detection of bocavirus dna of childhood acute respiratory tract infections that seen at spring and summer seasons

    EMEL ÇELEBİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA SAMASTI