5 yaş altı hastaların solunum yolu örneklerinde kı polyomavirus ve wu polyomavirus sıklığının araştırılması
Investigation of the frequency of ki polyomavirus and wu polyomavirus in respiratory tract samples of patients under 5 years of age
- Tez No: 700741
- Danışmanlar: PROF. DR. KENAN MİDİLLİ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Washington University polyomavirus (WUPyV), Karolinska Institute polyomavirus (KIPyV), solunum yolu enfeksiyonu, Polyomavirüs, Solunum yolları enfeksiyonları, Solunum yolları hastalıkları, Washington University polyomavirus (WUPyV), Karolinska Institute polyomavirus (KIPyV), respiratory tract infection, Polyomavirus, Respiratory tract infections, Respiratory tract diseases
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Solunum yolu örneklerinde KI ve WU polyomavirus sıklığını, bu viruslardan etkilenen grupları ve klinik özelliklerini araştırmayı amaçladık. Viruslar 2007'de keşfedilmiş olmasına rağmen, patojeniteleri ve virülansları henüz tam olarak aydınlatılamamıştır. Yöntem: 2016-2019 yılları arasında 5 yaşından küçük çocuk hastalardan alınan ve laboratuvarımıza gönderilen 182 nazofarengeal aspirat/sürüntü örneğini inceledik. Viruslar, kısmi VP1 gen bölgelerini hedefleyen primerler kullanılarak nested-PCR ile araştırıldı. Pozitif örnekler, doğrulama için Sanger yöntemi kullanılarak dizildi ve kısmen büyütülmüş gen bölgeleri arasındaki genetik mesafeleri karşılaştırdı. Bulgular: 182 örneğin 7'sinde (%3,8) KIPyV ve 2'sinde (%1,1) WUPyV saptandı. Bir KIPyV pozitif hasta dışında, tüm pozitif örnekler 2 yaşından küçük hastalara aitti. Tüm pozitif hastalar başta rinovirus ve parainfluenzavirus 3 ile olmak üzere koenfekteydi. KIPyV için pozitif olan hastaların dördünde hematolojik/onkolojik hastalıklar veya diğer immün yetmezlik durumları vardı. KIPyV izolatlarının tüm sekansları %100 benzer iken, WUPyV izolatlarının sekansları 4 nükleotid pozisyonunda farklılık gösterdi. Sonuç: Çalışmamızın sonuçlarına göre, KIPyV ve WUPyV enfeksiyonlarının sıklığı düşüktür, diğer viral veya bakteriyel patojenlerin neden olduğu eşzamanlı solunum yolu enfeksiyonları, immün yetmezlik, KIPyV ve WUPyV enfeksiyonları için predispozan birer faktör gibi görünmektedir. Kısmen büyütülmüş gen bölgeleri, her iki virusta da yüksek oranda korunmuştur.
Özet (Çeviri)
Objective: We aimed to investigate the frequency of KI and WU polyomavirus in respiratory tract samples, the affected groups by these viruses and their clinical characteristics. Although the viruses had been discovered in 2007, their pathogenicity and virulence have not been fully elucidated yet. Methods: We examined 182 nasopharyngeal aspirate/swab samples obtained pediatric patients younger then 5 years and sent to our laboratory between 2016- 2019. The viruses were investigated by nested-PCR using primers targeting partial VP1 gene regions. The positive samples were sequenced using Sanger method for verification and compare the genetic distances between partially amplified gene regions. Results: KIPyV was detected in 7 (3.8%) of 182 samples and WUPyV in 2 (1.1%). Except one KIPyV positive patient, all positive samples belonged to patients <2 years of age. All positive patients were coinfected mainly by rhinovirus and parainfluenzavirus 3. Four of the patients positive for KIPyV had haematologic/oncologic diseases or other immunodeficiency conditions. While all of the sequences of KIPyV isolates were 100% similar, seuences of WUPyV isolates differed at 4 nucleotide positions. Conclusion: According to the results of our study, the frequency of KIPyV and WUPyV infections is low, simultaneous respiratory tract infections caused by other viral or bacterial pathogens, immunocomprimisation appear to be a predisposing factors for the KIPyV and WUPyV infections. The partially amplified gene regions were highly conserved in both viruses.
Benzer Tezler
- COVID-19 pandemisinin solunum yolu viral etkenlerinin epidemiyolojisine etkisi
The effect of COVID-19 pandemic on the epidemiology of respiratory tract viral agents
İPEK OLAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜNEŞ ÖZÇOLPAN
- Kardiyovasküler cerrahi girişim yapılan çocuklarda solunum yoluyla ilgili nozokomiyal etkenlerin saptanması
Determination of causes of nosocomial infections related to respiratory tract, in the children undergoing cardiovaskular surgery
EMİNE GÜDEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
HemşirelikMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HATİCE PEK
- Esbl pozitif ve karbapenemaz üreten klebsiella pneumoniae suşlarındakarbapenem direncinin fenotipik ve moleküler yöntemlerle saptanması
Detection of carbapenem resistance in ESBL-positive and carbapenemase-producingklebsiella pneumonia strains using phenotypic and molecular methods
BÜŞRA KAYIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YAVUZ UYAR
- Pediatrik hematoloji/onkoloji hastalarında mikrobiyolojik olarak kanıtlanmış bakteriyel enfeksiyonların değerlendirilmesi
Evaluation of microbiologically proven bacterial infections in pediatric hematology/oncology patients
ZEHRA ASLI İŞERİ KÜSKÜ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP KARAKAŞ
- Epidemiological and biochemical study of hepatitis B infections in Al Shatrah
Al Shatrah'ta hepatit B enfeksiyonlarının epidemiyolojik ve biyokimyasal çalışması
IMAD BADR JASIM JASIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IRMAK POLAT