Cloning, expression and characterization of sericin like octamer-repeat protein
Serisin benzeri oktomer tekrarlı bir proteinin klonlanması, ekpresyonu ve karakterizasyonu
- Tez No: 706953
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NUR BAŞAK SÜRMELİ ERALTUĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biyomühendislik, Biotechnology, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: DNA-rekombinant, Moleküler klonlama, Rekombinant protein üretimi, DNA-recombinant, Molecular cloning, Recombinant protein production
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
İpek poteinleri, ipek böcekleri tarafından sentezlenen doğal polimerlerdir. B. mori kozasından elde edilen ipek, fibroin ve serisin adı verilen iki temel proteinden oluşur. Fibroin, kozayı oluşturan ve ticari önemi yük- sek ana bileşen iken serisin, fibroinleri bir arada tutan“tutkal”görevi gören bir proteindir. Serisin, kozmetikten biyomalzeme araştırmalarına kadar geniş bir uygulama alanına sahiptir. Yüksek fiber yapısı nedeniyle yara iyileşmesi ve ilaç taşınımı çalışmaları için kullanılabilir. Serisin eldesi için alkali muamele ve kaynatma gibi kimyasal işlemler veya enzimatik sindirim gibi biyolojik işlemler kozalara uygulanabilir, bu işlemlere gam giderme adı verilir. Ancak bu işlemler sonucu elde edilen serisinin yapısı tutarlı değildir, amino asit dizisi ve elde edilen proteinin yapısı ekstraksiyon metodolojisine ve koşullarına bağlıdır. Öte yandan, rekombinant üretim ile elde edilen proteinler standardize edilebilir ve tekrarlayan zincir uzunluğu istendiği gibi ayarlanabilir. Bu çalışmada, doğal serisinin tekrar eden 38 amino asit dizisinin sekiz tekrarını içeren serisin benzeri bir protein klonlanmış ve E. coli bakterisinde eksprese edilmiştir. Elde edilen proteine Ser-8mer adı verilmiş, bu proteinin fibril yapısı ve ikincil yapı analizleri yapılmıştır. Rastgele sarmallara sahip ticari serisinin aksine, elde edilen proteinin beta yaprağı konformasyonuna sahip olduğu tespit edilmiştir. Bu konformasyonun bir sonucu olarak, proteininin çözünür olmayan ve kendi kendine birleşen fibril yapıları oluşturduğu da gözlenmiştir. Elde edilen proteinin yoğun fibril yapısından dolayı bu proteinin biyomalzeme çalışmalarına yararlı bir katkı sunacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Silk proteins are natural polymers which are synthesized by insects like silkworms and spiders. There are two proteins in the silk obtained from the cocoon of B. mori, these are silk fibroin and silk sericin. While the silk fibroin is the main part of the cocoon with a high commercial importance, sericin is the“glue”protein that holds fibroins together. Sericin has wide variety of applications from cosmetics to biomaterial research. Because of its high fibrillar structure, it can be used in wound healing or drug delivery studies. It can be obtained from the degumming process of cocoons which includes chemical treatment like alkali treatment and boiling, or biological treatment like enzymatic digestion. However, sericin obtained by these processes are not consistent in structure, and the sequence of the protein obtained depends on the extraction methodology and conditions. However, proteins obtained by recombinant production can be standardized, and repeat-chain length can be adjusted as desired. In this thesis study, a sericin like protein which includes eight repeats of the 38 amino acid sequence of the natural sericin was cloned and expressed in E. coli. The resulting protein, Ser-8mer, was analyzed in terms of fibril structure and secondary structure. It was found out that the protein has beta sheet conformation in contrast to commercial sericin with random coils. And as a result of this conformation, it forms insoluble self-assembled fibril structures which shows a promising contribution to the biomaterial research.
Benzer Tezler
- Cloning, expression and characterization of the niger XYNB gene
Başlık çevirisi yok
KÜBRA BAYRAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA İŞSEVER ÖZTÜRK
DOÇ. DR. SEVNUR MANDACI
- Cloning, expression and biochemical characterization of full size and truncated novel CCDC-124 protein in e. coli
E.coli'de tam boyutlu ve kesilmiş yeni CCDC-124 proteinin klonlaması, ekspresyonu ve biyokimyasal özellikleri
ASYAH ABBAS ABBOOD ABBOOD
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜNİR TUNÇER
- Cloning, characterization and heterologons expression of the aspartokinase and aspartate semialdehyde dehydrogenase genes from the cephamycin C producer streptomyces clavuligerus
Sefamisin C üreticisi streptomyces davuligerus'un aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrojenaz genlerinin klonlanması, karakterizasyonu ve heterolog ekspresyonu
SEDEF TUNCA
Doktora
İngilizce
2002
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
PROF. DR. JACQUELİNE PİRET
- Cloning, characterization and expression of Arabidopsis thaliana G protein alpha subunit gene for structural studies
Arabidopsis thaliana'daki G protein alfa altbirim geninin yapısal çalışmada kullanılmak üzere klonlanması, karakterizasyonu ve ekspresyonu
EMİNE SÜPHAN BAKKAL
- Cloning, characterization and expression of a novel metallothionein gene (mt-d) from Triticum durum
Triticum durum'dan yeni bir metalotionin (mt-d) klonlanması, karakterizasyonu ve gen anlatımı
HASAN ÜMİT ÖZTÜRK