Akciğer kanseri hücre hatlarında ALX3 geninin ifade ve promotor bölgesinin metilasyon düzeyinin araştırılması
Investigation of the expression of the ALX3 gene and the metilation level of the promotor region in lung cancer cell lines
- Tez No: 708303
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF UZ YILDIRIM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 90
Özet
Son yıllarda yapılan bazı çalışmalar çeşitli kanserlerde bazı genlerin biyobelirteç olabileceğini göstermiştir. Buna bağlı olarak yapılan genom boyu taramalarda ALX genlerinin de normal dokulara kıyasla metilasyon farklılıkları gösterip bu biyobelirteçlerden olabileceği gösterilmiş olmakla birlikte özellikle ALX3 geninde yapılan çalışmaların sayısı çok azdır. Buna karşılık yapılan bu az çalışmada bile ALX3 geninin metilasyon profilindeki farklılıklar bazı kanserlerde normal dokulara kıyasla farklılık göstermiştir. Ancak literatürde ALX3 geni ve akciğer kanseri arasında bir ilişkiye rastlanmamıştır. Bu bakımdan bu çalışmada ALX3 geni ve akciğer kanseri arasındaki ilişkinin gen ifadesi ve metilasyon profilleri açısından incelenmesi ve bu genin akciğer kanseri patogenezinde bir biyobelirteç olup olamayacağının bulunması amaçlanmıştır. Bu amaçla bu tez çalışmasında in vitro olarak A549 ve H1299 akciğer kanseri hücre hatları ile Beas-2B normal akciğer dokusu hücre hattı kullanılmıştır. Metilasyon analizi için COBRA yöntemi, gen ifadesi analizi için ise Gerçek-Zamanlı PCR yöntemi kullanılmıştır. Sonuç olarak akciğer kanseri hücre hatları normal akciğer dokusu hücre hattına kıyasla belirgin şekilde hipermetilasyon göstermiş olup gen ifadelerinde belirgin bir farka rastlanmamıştır. Sonuçlara göre ALX3 geni akciğer kanserinde belirgin bir hipermetilasyon modeli sergilediği için biyobelirteç olma potansiyeli bulunmaktadır. Yapılan bu in vitro analizlere ek olarak aynı araştırmaların in vivo bir şekilde hasta örneklerinde yapılmasının bu potansiyelin kesinleştirilmesine fayda sağlayabileceği düşünülmektedir. Tüm bu sonuçlar ışığında ALX3 geni akciğer kanseri için potansiyel bir biyobelirteçtir ve bu genin hipermetilasyonunu tersine çevirecek bir biyoteknolojik ilaç geliştirilmesi yönünde yapılabilecek çalışmalar için temel oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
Some studies in recent years have shown that some genes may be biomarkers in various cancers. Accordingly, although it has been shown in genome-wide scans that ALX genes show methylation differences compared to normal tissues and may be one of these biomarkers, the number of studies especially on the ALX3 gene is very few. However, even in these few studies, differences in the methylation profile of the ALX3 gene differed in some cancers compared to normal tissues. However, no relationship was found between the ALX3 gene and lung cancer in the literature. In this regard, in this study, it was aimed to examine the relationship between the ALX3 gene and lung cancer in terms of gene expression and methylation profiles and to find out whether this gene can be a biomarker in the pathogenesis of lung cancer. For this purpose, A549 and H1299 lung cancer cell lines and Beas-2B normal lung tissue cell lines were used in vitro in this thesis study. COBRA method was used for methylation analysis and Real-Time PCR method was used for gene expression analysis. As a result, lung cancer cell lines showed significant hypermethylation compared to normal lung tissue cell lines, and no significant difference was found in gene expressions. According to the results, ALX3 gene has the potential to be a biomarker since it exhibits a prominent hypermethylation pattern in lung cancer. In addition to these in vitro analysis, it is thought that performing the same studies on patient samples in vivo may help to confirm this potential. In the light of all these results, the ALX3 gene is a potential biomarker for lung cancer and forms the basis for studies to develop a biotechnological drug that will reverse the hypermethylation of this gene.
Benzer Tezler
- Akciğer kanseri hücre hatlarında (A549) demir yüklü eksozomlarla ferroptoz oluşturulması; kanser için yeni bir terapötik yaklaşım
Generation of ferroptosis via iron loaded exosomes in lung cancer cell lines (A549); A new therapeuitical approach for cancer
GAMZE NUR ÖTER
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiBiyokimya (Ecz) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERMİN TETİK
- Dosetaksel ve deguelin'in akciğer kanseri hücre hatlarında kemoprevantif etkinliğinin araştırılması
Investigation of docetaxel and deguelin's chemopreventive activity in lung cancer cell line
NINA GHANITABE
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
OnkolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLAL KOÇDOR
- A549 ve BEAS-2B hücre hatlarında borik asitin apoptoz yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of boric acid on the expression levels of genes in the apoptosis pathway in A549 and BEAS-2B cell lines
GAYE NUR VİDİNLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Genetikİstinye ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MURADİYE ACAR
- Küçük hücreli dışı akciğer kanseri hücre hatlarında deguelin'in anti-metastatik potansiyeli ve mitokondriyal fonksiyon üzerindeki etkisi
Anti-metastatic potential of deguelin and its effect on mitochondrial function in non-small cellular lung cancer cell lines
EZEL BİLDİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
OnkolojiDokuz Eylül ÜniversitesiOnkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLAL KOÇDOR
- Akciğer ve mezotelyoma kanseri hücre hatlarında Echinophora tenuifolia esansiyal yağının sitotoksik ve apoptotik aktiviteleri
Cytotoxic and apoptotic activities of Echinophora tenuifolia essential oil in lung and mesothelioma cancer cell lines
ESRA SARI
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiEskişehir Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL ERGENE