Geri Dön

MikroRNA-133a'ya duyarlı elektrokimyasal biyosensörlerin geliştirilmesi

Development of electrochemical biosensors sensitive to MikroRNA-133a

PDF İndir

  1. Tez No: 716075
  2. Yazar: AHMET KARAÇELİK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAİM TOPÇU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Biyosensörler, DNA probları, Mikro RNA, Neoplazmlar, Biosensors, DNA probes, Micro RNA, Neoplasms
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Giresun Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Tez çalışmasında bir kanser biyobelirteci olan mikroRNA-133a'nın (Target-miR-133a) kantitatif tayini için elektrokimyasal biyosensör geliştirilmiştir. Nükleik asit hibridizasyon prensibine göre tasarlanmış, sensör seçiciliği yüksek, duyarlı, hızlı, ucuz ve pratik bir biyosensör geliştirilmesi hedeflenmiştir. Bu amaçla tek kullanımlık, düşük maliyetli ve pratik bir kalem grafit elektrot (PGE) kullanılmıştır. PGE elektrodunun yüzeyi elektrokimyasal yöntemle aktive edilmiştir. Hedef molekül miRNA-133a'nın tamamlayıcı konjugatı olan anti-miR-DNA ipliği, bir yakalama probu (Cp) olarak PGE'nin yüzeyine adsorbe edilmiştir. Anti-miR-DNA/Target-miR-133a hibridizasyonu, hazırlanan elektrodun hedef molekül çözeltisinde bekletilmesiyle gerçekleştirilmiştir. Elektrot yüzeyinde gerçekleşen bütün işlemler her aşamada elektrokimyasal empedans spektroskopisi (EIS) ile karakterize edilmiştir. Elektrot yüzeyine immobilize edilen yakalama ucu (cp-DNA-miR-133a) konsantrasyonu, adsorpsiyon süresi, hedef molekül konsantrasyonu ve hibridizasyon süresi optimizasyonları ayrı ayrı çalışılmıştır. Yakalama ucu ile hedef molekül arasındaki güçlü hidrojen bağları nedeniyle, moleküller birbirine kenetlendikten sonra elektrot yüzeyinin yük transfer direncinde bir artış gözlemlenmiştir. Başlangıçta iyi iletken olan PGE elektrot yüzeyi yalıtkan biyomoleküllerle kaplandığından, PGE elektrodunun yük transfer direnci sırasıyla yakalama probunun adsorpsiyonu ve hibridizasyon sebebi ile artmıştır. Ayrıca biyosensörün farklı tampon ortamlarında uygulanabilirliliğini değerlendirmek üzere fosfat tamponu (PBS) ve asetat tamponu (ABS) ortamında çalışılmıştır. Biyosensörün seçimlilik çalışmalarında değişik baz dizilerine sahip yalancı hedef moleküllerin varlığında biyosensörün performansı asetat tamponunda test edilmiştir.

Özet (Çeviri)

In the thesis study, an electrochemical biosensor was developed for the quantitative determination of microRNA-133a (Target-miR-133a), a cancer biomarker. It is aimed to develop a sensitive, fast, cheap and practical biosensor with high sensor selectivity, designed according to the nucleic acid hybridization principle. For this purpose, a disposable, low-cost and practical pencil graphite electrode (PGE) was used. The surface of the PGE electrode was activated by electrochemical method. The anti-miR-DNA strand, the complementary conjugate of the target molecule miRNA-133a, was adsorbed to the surface of the PGE as a capture probe (cp). Anti-miR-DNA/Target-miR-133a hybridization was carried out by keeping the prepared electrode in the target molecule solution. All processes that occurring on the electrode surface were characterized by electrochemical impedance spectroscopy (EIS) at each stage. Optimization of capture tip (cp-DNA-miR-133a) concentration immobilized on the electrode surface, adsorption time, target molecule concentration and hybridization time were studied separately. Due to the strong hydrogen bonds between the capture probe and the target molecule, an increase in the charge transfer resistance of the electrode surface was observed after the molecules were hybridized. Since the initially well-conducting PGE electrode surface was covered with insulating biomolecules, the charge transfer resistance of the PGE electrode increased with adsorption of the capture probe and hybridization, respectively. In addition, the biosensor was studied in phosphate buffer (PBS) and acetate buffer (ABS) media to evaluate its applicability in different buffer environments. In the selectivity studies of the biosensor, the performance of the biosensor was tested in acetate buffer in the presence of pseudotarget molecules with different base sequences.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    174793

    Darbeli elektromanyetik alanlar ile osteojenik indüksiyon (teorik, deneysel ve klinik çalışma)

    Başlık çevirisi yok

    ARSLAN BORA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1982

    Ortopedi ve TravmatolojiEge Üniversitesi

    Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERİH EROĞLU

  2. Tez No

    484706

    Osteogenezis ımperfektalı hastalarda plazma mirna (MİR26a, MİR29A, MİR133A) ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of serum mirna MİR-26A, MİR-29A, MİR-133A) expression levels in patients with osteogenesis imperfecta

    LATİFE ÖZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BANU NUR

  3. Tez No

    448827

    ST yükselmesi olan ve olmayan akut miyokard infarktüslü hasta gruplarında mikrorna profilinin araştırılması

    Investigation of the microrna profile in acute myocardial infarction with ST elevation and non-st-elevation group

    ONUR BOBUŞOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyokimyaMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. LÜLÜFER TAMER

  4. Tez No

    791434

    Linagliptin ve empagliflozin tedavilerinin STZ-diabetik sıçan kalbinde olası etkilerinin miRNA'lar üzerinden karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi

    Comparative evaluation of the possible effects of linagliptin and empagliflozin treatments on STZ-diabetic rat HEART in terms of mirnas

    ZEYNEP ELİF YEŞİLYURT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EBRU ARIOĞLU İNAN

  5. Tez No

    1013976

    Polikistik over sendromu tanılı hastalarda in vitro fertilizasyon sürecinde folikül sıvısı mikroRNA (miR-133a, miR-663b, miR-21, miR-155) düzeylerinin ve oosit maturasyonu ile ilişkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of follicular fluid microRNA (miR-133a, miR-663b, miR-21, miR-155) levels and their association with oocyte maturation in patients with polycystic ovary syndrome undergoing in vitro fertilization

    MAİDE ŞEYMA PÜRYAN ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. ERHAN DEMİRDAĞ

Geri Dön