Thi-Qar ilinde idrar yolu hastalarından izole edilen Staphylococcus aureus'un bakteriyolojik ve moleküler çalışması
Bacteriological and molecular study of Staphylococcus aureus isolated from patients with urinary infection in Thi-Qar province
- Tez No: 724935
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ESİN KIRAY, DR. AMRAN MEZHER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 95
Özet
İdrar yolu enfeksiyonu (İYE), insanlarda görülen en yaygın bulaşıcı hastalıklardan biridir. Gram pozitif bir bakteri olan Staphylococcus aureus İYE' nın en sık görülen etkenlerindendir. Çalışmamızda İYE hastalarından izole edilen S. aureus'un izolasyonu ve identifikasonu sonrasında, kültürel ve biyokimyasal incelemeler ile moleküler genotiplendirmesi ve genetik varyasyonunu araştırılmıştır. Türlerin idendifikasyonunda API-20 ve Vitek2 kompakt sistemleri kullanılmıştır. Çalışmamızda, Şubat-Haziran 2021 ayları arasında Güney Irak, AL-Nasiriyah Şehrindeki AL-Hussein Eğitim Hastanesinde İYE şikayeti ile başvuru yapan 200 hastadan alınan idrar örnekleri değerlendirilmiştir. Alınan 200 hasta örneğinin 133'ünde (%66.5) Staphylococcus aureus pozitif olarak bulunmuştur. Suşların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesinde klinikte sık olarak kullanılan on dört antibiyotik kullanılmıştır. Suşların en yüksek direnç oranları Ampisilin (%100), Sefoksitin (%97.7), Tetrasiklin (%76.6), Klindamisin (7%1.4) ve Trimetoprim-Sülfametoksazole (%54.1) olarak belirlenirken Eritromisin (%43.6) ve Doksisiklin (%42.8) olarak tespit edilmiştir. Diğer yandan, test edilen suşlar, Vankomisin ve Novobiyosine karşı yüksek derecede duyarlılık göstermiştir. İYE hastalarından izole edilen S. aureus'un virülans geni olarak (spa) geninin varlığını belirlemek için PCR tekniği kullanılmıştır. Tüm S. aureus izolatları (n=55), spa genine karşı (260-1400 bp) %100 oran ile pozitif reaksiyonla amplifiye edilmiştir. Ayrıca, bu genin genotiplenmesinde moleküler boyutu (538 bp) olan tst-1 geni tüm S. aureus suşlarının %20' sinde tespit edilmiştir. Bir DNA dizileme analizi yönteminde, S. aureus izolatları (IQ-İYE.1-IQ-İYE.2) ve NCBI-Blast ile ilgili v immünoglobulin G bağlayıcı protein A (spa) genindeki genetik varyasyon (ikame Mutasyonları) analizi S. aureus izolatı, (IQ-İYE.3) ve NCBI-Blast ile ilgili S. aureus izolatı, toplam genetik varyasyon yüzdesi (%0.23) aralığında bir ikame mutasyonu buldu.
Özet (Çeviri)
Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infectious diseases in humans both in the clinical and community settings. involvement of Gram-positive bacteria cannot be ruled out in relation to UTI. Staphylococcus aureus is one of such agents involved in the infection that is capable of invading the urinary tract. Although S. aureus accounts to 0.5–6% of UTI. This study aims to detect the molecular genotyping and genetic variation of S. aureus isolated from UTIs patients after its isolation and diagnosis, depending on the cultural and biochemical examinations and confirmation by API-20 and Vitek2 compact systems. Two hundred clinical (urine) specimens were collected during the period (February to June 2021); from patients who were complained from İYEs at AL-Hussein Teaching Hospital in AL-Nasiriyah City, South Iraq. diagnostic results show that 133 out of the 200 specimens gave positive bacterial cultures as Staphylococcus aureus. According to gender, females recorded the high İYE rates with 136 cases (68%) (p≤0.01). the antibiotic susceptibility profile for these isolates was examined against Fourteen types of antibiotics. Highest resistance was recorded against Ampicillin, Cefoxitin, Tetracycline, Clindamycin and Trimethoprim-Sulfamethoxazole with a percentages of (100%), (97.7%), (76.6%), (71.4%), and (54.1%), respectively while Erythromycin (43.6%) followed by Doxycycline (42.8%). On the other hand the tested isolates showed a high degree of susceptibility towards vancomycin and novobiocin. PCR technique was used to detect the presence of (spa) gene as a virulence gene in S. aureus isolated from İYE patients. All S. aureus isolates (n=55) were amplificated to (spa) gene at (1400-260 bp) with a positive reaction of 55 (100%), with note the genotyping of this gene. also, (tst-1) gene detected in (20%) of all S. aureus isolates with a molecular size of (538 bp). In a DNA sequencing analysis method , the genetic variation (substit UTI on Mutations) analysis in v immunoglobulin G binding protein A (spa) gene between local S. aureus isolates (IQ-UTI.1-IQ-UTI.2) and NCBI-Blast related S. aureus isolate were find 4 into 5 substitİYEon mutations at total genetic variation percentage ranged (0.84-1.05%).While the genetic variation analysis in toxic shock syndrome toxin- 1 (tsst-1) gene between local S. aureus isolates (IQ- UTI.3) and NCBI-Blast related S. aureus isolate were find one substit UTI on mutation at total genetic variation percentage ranged (0.23%).
Benzer Tezler
- Thi-Qar ilinde bazı HBS mutasyonlarının belirlenmesi ve Hepatit B'de bazı kan göstergelerinin tespiti
Determination some mutation of hbs and detection some blood indicators in Hepatitis B in Thi-Qar province
WAFIYAH RAISAN MOHAN ALKASSAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyomühendislikKırşehir Ahi Evran Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ÇANLI
DR. ÖĞR. ÜYESİ AMRAN MEZHER LAWAS
- Irak Thı-Qar ilinde tonsilitli hastalarda immünopatolojik pro-inflamatuar ve antiinflamatuar sitokin ve interlökinin araştırması
Study of immunopathological pro -inflammatory and anti- inflammatory cytokine and interleukin in patient with tonsillitis in Thi-Qar provence Iraq
FALAH HASAN CHASIB CHASIB
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EBRU ÖZDENİZ
DOÇ. DR. HAZAR SHAKİR SALEH
- Irak, Thi-Qar ilinde Treponema pallidum tanısı
Treponema pallidum diagnosed in Thi-Qar province, Iraq
MOHAMMED ABDLHADI ABDLRIDHA AL-MAYAHI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ AMRAN MEZHER LAWAS
- Hepatit b virüslerinde hematoloji ve immünoloji göstergeleri ve bazı mutasyonların belirlenmesi
Hematology and immunology indicators and determination of some mutations for hepatitis b virus
SAMER KAREEM HANOON
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN
- Diagnostics and characterization of neisseria gonorrhoeae infection in thi-Qar province
Thı-Qar ilindeki neisseria gonorrhoeae enfeksiyonun teşhisi ve karakterizasyonu
MOHAMMED JASIM THAJEEL AAL-EZIREJ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER