Geri Dön

İntraselüler motor proteinini kodlayan kinesin family member 26B geninin oral malin ve premalin lezyonlarda epigenetik biyobelirteç potansiyelinin incelenmesi

investigation of epigenetic biomarker potential of kinesin family member 26B gene, which is a gene encoding intracellular motor protein, in oral malin and premalignant lesions

PDF İndir

  1. Tez No: 735321
  2. Yazar: FULYA KARAYEĞİT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Oncology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Deneysel ve Moleküler Onkoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Oral skuamöz hücreli karsinom (OSCC), dünyada yıllık gözlenen oral kanserlerin %90'dan fazlasını oluşturmaktadır. Beş yıllık genel sağkalım ve hastalıksız sağkalımın sırasıyla %47 ve %74 olduğu tahmin edilmektedir. Oral premalin lezyonların (OPML) erken teşhisi oldukça önemlidir, çünkü geç evrelerde, şiddetli displaziye ve skuamöz hücreli karsinomlara dönüşme riskleri oldukça yüksektir. Epigenetik mekanizmalar doğrudan ya da dolaylı olarak gen ifadesini kontrol eder. Genin promoter bölgesinde lokalize CpG adacıklarındaki sitozin nükleotidinin 5. karbonuna metil grubu eklenmesiyle oluşan DNA metilasyonu, epigenetik gen düzenlenmesi için kapsamlı bir şekilde karakterize edilmiş bir mekanizmadır. Karsinogenezde en fazla görülen epigenetik değişiklik, tümör supresör genlerin promoter bölgelerindeki DNA metilasyonu sonucu gen ifadesinin baskılanmasıdır. Prof. Dr. Semra Demokan ve ark. yaptığı TÜBİTAK-SBAG-114S497 no'lu projede elde edilen array verilerine göre KIF26B geninde metilasyona bağlı olarak ekspresyon seviyelerinde azalma gözlenmiştir. Yaptığımız çalışmada, OSCC tanılı 30 hasta ve OPML tanılı 30 hastaya ait tümör, eşlenik normal doku ve vücut sıvıları (serum ve tükürük) ile 15 sağlıklı bireye ait normal mukoza, vücut sıvılarında KIF26B geninin metilasyon ve ekspresyon seviyeleri incelendi. Çalışmamızda sağlıklı gruplarından elde edilen veriler ile OSCC ve OPML hasta grupları arasındaki moleküler farklılıklar ve klinik bilgiler karşılaştırılarak, KIF26B'nin kanserin erken tanısında kullanılabilecek bir biyobelirteç olabilme potansiyeli araştırıldı. KIF26B genindeki ekspresyon seviyesinin belirlenmesinde QRT-PCR yöntemi, metilasyon seviyesinin belirlenmesinde ise QMSP yöntemi kullanıldı. Metilasyon ve ekspresyon oranları belirlenip, metilasyona bağlı ekspresyon kaybı incelendi. Yaptığımız deneyler sonucunda; OSCC hastalarının tümör dokusunda eşlenik normal dokuya oranla %40'ında (12/30) ekspresyon seviyesinde azalma, %33,3'ünde (10/30) ekspresyon seviyesinde artma gözlemlendi, %26,7'sinde (8/10) ise değişikliğe rastlanmadı. OPML hastalarında LP, OL, OLD alt gruplarında sırasıyla; %38,5 (5/13), %42,9 (3/7), %40 (4/10) oranında ekspresyon seviyesinde artma görülürken, ekspresyonda azalma ise sırasıyla; %30,8 (5/13), 28,6 (2/7), %20 (2/10) oranında gözlemlendi. OSCC hastalarından %16,7 (5/30)'sına ait tümör dokusunda genin promoter bölgesinde metilasyon gözlenirken, eşlenik normal doku ve serum örneklerinde metilasyona rastlanmadı. Metilasyon saptanan hastaların hepsinde ekspresyon seviyesinde azalma mevcuttur. OSCC ve OPML hasta gruplarında meydana gelen ekspresyon seviyesindeki değişiklikler ile klinik parametreler karşılaştırıldığı zaman anlamlılık görülmesine rağmen düşük oranlarda gözlemlenen metilasyonun, değişen ekspresyon seviyeleri üzerinde bir etkisi olmadığı gözlenmiştir. OSCC ve OPML hasta gruplarındaki ekspresyon seviyesindeki değişiklerden oral kavite karsinogenezinde meydana gelen mutasyonlar sorumlu olabilir.

Özet (Çeviri)

Oral squamous cell carcinoma (OSCC) covers more than 90% of oral cancers cases per annum. It has been guessed that the survival rate of with illness and without illness is respectively; 47% and 74%. Early diagnosis of oral premalignant lesions (OPML) is crucial because, at the late stages, the risk of turning into severe dysplasia and squamous cell carcinomas are high. The mechanism of epigenetics is controlling the gene expression directly or indirectly. DNA methylation, attaching methyl groups to the 5th carbon of the cytosine nucleotides in the CpG islands localized in gene's promoter side, is an extensively characterized mechanisms in order to epigenetic gene regulations. The most seen epigenetics changes have seen in carcinogenesis is the suppression of the gene expressions resulting DNA methylations in the promoter sides of the tumour suppressor cell genes. The expression and methylation levels in the KIF26B gene, which showed a decrease in the expression level due to methylation, according to the array data of the TÜBİTAK-SBAG-114S497 numbered project conducted by Semra Demokan et al., ,were examined in tumor, equivalent normal tissue and body fluids (serum and saliva) of 30 patients diagnosed with OSCC and 30 patients diagnosed with OPML, and normal mucosa, body fluids of 15 healthy individuals. In our study, the potential of KIF26B to be a biomarker that can be used in the early diagnosis of cancer was examined by comparing the data of clinical parameters and molecular differences obtained from healthy groups and OPML and OSCC patient groups. The QRT-PCR method was used to determine the expression level in the KIF26B gene, while the QMSP method was used to determine the methylation level. Methylation and expression rates were determined and expression loss due to methylation was examined. To conclude: In OSCC patients, 40% (12/30) of the tumor tissue samples showed a decrease in expression level compared to the normal tissue, 33.3% (10/30) showed an increase in expression level, and 26.7% (8/10) did not show any change. Among the LP, OL, and OLD subgroups of OPML patients, an increase in expression level was observed at the rate of respectively; 38.5% (5/13), 42.9% (3/7), and 40% (4/10), whereas a decrease in expression level was observed at the rate of respectively; 30,8% (5/13), 28.6 (2/7), and 20% (2/10). While methylation was observed in the promoter region of the gene in the tumor tissue of 16.7% (5/30) of OSCC patients, other hand no methylation was found in the equivalent normal tissue and serum samples. However, in all patients observed methylation, there is a decrease in their expression level. No methylation was found in the tissue and body fluids of OPML patients. Although, the changes in the expression levels and the clinical parameters occurred in the OSCC and OPML patient groups, there are significant factors, it is observed that low-rate methylation has no effect on changing expression-levels. Mutations in oral cavity carcinogenesis might be responsible for the changes in expression levels in OSCC and OPML patient groups.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    88892

    İskemik penumbrada kalıcı sinaptik transmisyon bozukluğunun altında yatan presinaptik mekanizmaların incelenmesi

    Investigation of presynaptic machanisms underlying failure of synaptic transmission in ischemic penumbra

    HAYRUNNİSA BOLAY BELEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    NörolojiHacettepe Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGAY DALKARA

  2. Tez No

    686778

    Renal kanser hücre hattında (CAKI-2) karbonik Anhidraz-IX enzim inhibisyonunun mTOR proteini üzerine etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of carbonic anhydrase-IX inhibition on mTOR protein in Renal Cancer Cell Line (CAKI-2)

    EMİNE TERZİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyokimyaAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Kanser Biyolojisi Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZEN ÖZENSOY GÜLER

  3. Tez No

    111368

    IV magnezyum sülfat kullanarak çocuklardaki laringo-bronkospazmı önlemek mümkün olabilir mi?

    Başlık çevirisi yok

    SABİHA CENGİZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Anestezi ve Reanimasyonİstanbul Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

  4. Tez No

    438720

    Role of P2X7 receptors in neuronal injury after optic nerve transection and focal cerebral ischemia in mice

    Farede P2X7 reseptörlerinin optik sinir kesisi ve fokal serebral iskemi sonrası sinir hasarındaki rolü

    BERRAK ÇAĞLAYAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

    PROF. DR. ERTUĞRUL KILIÇ

  5. Tez No

    351161

    Deneysel omurilik yaralanması modelinde agmatin'in nöroprotektif etkisinin araştırılması

    Research of the agmatine's neuroprotective effects in experimental spinal cord injury model

    SERKAN DİRİL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    NöroşirürjiÇukurova Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FARUK İLDAN

Geri Dön