The role of Malt1 gene in the crosstalk of TGF-b and NF-kB signaling pathways
TGF-b ve NF-kB sinyal yolaklarının çapraz konuşmasında Malt1 geninin rolü
- Tez No: 739513
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞERİF ŞENTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoloji, Genetics, Biology
- Anahtar Kelimeler: Büyüme faktörleri, DNA dizileme, Dönüştürücüler, Malt, RNA interferaz, Growth factors, DNA sequencing, Transformers, Malt, RNA interference
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Dönüştürücü büyüme faktörü-b (TGF-b), çeşitli hücre tiplerinde ifadelenen ve hücre tipine ve durumuna bağlı olarak çok sayıda geni düzenleyerek çeşitli hücresel aşamalarda ve hücre kaderinde rol oynayan bir sitokin süper ailesidir. Kanonik (SMAD bağlı) ve kanonik olmayan (SMAD bağımsız) sinyaller etkinliğinde çalışır. MAPK, JNK, JAK/STAT gibi sinyal yolaklarına ek olarak, hemen hemen her hücre tipinde bulunan küçük bir transkripsiyon faktörü ailesi olan NF-kB'nin içerisinde bulunduğu çeşitli sinyal yolaklarıyla etkileşime girerek hayatta kalma ve kanser ilerlemesinde önemli roller oynar. Aktivitesi hem kanonik hem de kanonik olmayan sinyaller tarafından düzenlenir. İlk olarak MALT lenfomada keşfedilen mukoza ile ilişkili lenfoid doku lenfoma translokasyon proteini 1 (Malt1), nükleer faktör kappa-B (NF-kB)'nin aktivasyonunda rol oynadığı bilinen bir parakaspazdır. TGF-b-NF-kB ve Malt1-NF-kB arasındaki etkileşimler farklı konseptlerde çalışılmış olmasına rağmen, bunların çeşitli kanser türlerinde Malt1 yoluyla çapraz konuşması tanımlanmamıştır. Bu çalışma, TGF-b ve NF-kB sinyal yollarının çapraz konuşmasında Malt1 proteininin rolünü farklı bir yöntemle göstermektedir. TGF-b'ya yanıt veren iki hücre hattında, Malt1'ın kanonik TGF-b yolağının hedefi olduğunu gösterdik. Malt1'ın bir Smad3 hedef geni olduğu TGF-b kanonik yolağının shRNA ve CRISPR/Cas9 yöntemleri kullanılarak baskılanması aracılığıyla gösterildi. Ayrıca, TGF-b ile indüklenen arttırılmış Malt1 ekspresyonunun NF-kB aktivasyonuna aracılık ettiği NF-kB raportör deneyleri, immünofloresan boyaması ve NF-kB hedef genleri için qRT-PCR testleri ile gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Transforming growth factor-b (TGF-b) is a cytokine superfamily expressed in a variety of cell types. Through contextual regulation of a large number of genes, TGF-b ligands serve critical functions in key cellular and molecular mechanisms, including cancer cell survival and proliferation. Notably, canonical (Smad-dependent) and non-canonical (Smad-independent) signaling pathways are involved in its activity. Furthermore, TGF-b signaling is known to interact with other intracellular pathways, including MAPK, JNK, JAK/STAT and NF-kB. Importantly, the nuclear factor kappa-B (NF-kB) pathway constitutes a small family of transcription factors found in virtually every cell type and is involved in multiple aspects of biological functions relevant to physiological and pathophysiological processes. The activity of NF-kB pathway is also modulated by both canonical and non-canonical signals. Mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma translocation protein 1 (Malt1), a paracaspase first identified in a subset of MALT lymphoma, is a critical component of NF-kB pathway in several biological contexts. Yet, the role of Malt1 in TGF-b and NF-kB interaction is unknown. Here we report that Malt1 protein potentiates the crosstalk between TGF-b and NF-kB signaling pathways. Mechanistically, through extensive molecular studies in A549 and Huh7 cancer cell lines using RNAi and CRISPR/Cas9 perturbations, we find that Malt1 is a Smad3-dependent target gene of canonical TGF-b signaling. More significantly, TGF-b-mediated Malt1 induction facilitates NF-kB activation. Collectively, our pioneering work provides mechanistic insights into how TGF-b/Smad signaling regulates Malt1 expression and reveals a novel mode of crosstalk between TGF-b and NF-kB signaling pathways.
Benzer Tezler
- The interrogation of the role of malt1 paracaspase (mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma translocation protein 1) in hepatocellular carcinoma cell survival
Malt1 parakaspazın (mucosa-assocıated lymphoıd tıssue lymphoma translocatıon proteın 1) hepatoselüler karsinom hücre sağkalımı üzerındekı rolünün araştırılması
ASLI KURDEN PEKMEZCİ
- Primer glioblastoma tümörlerinde long non coding RNA MALAT1'in prognostik öneminin araştirilmasi
Investigation of the prognostic importance of long non coding RNA MALAT1 in primary glioblastoma tumors
ÖMER GÖKAY ARGADAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
GenetikBursa Uludağ ÜniversitesiBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN KOCAELİ
- Besin alerjisi patogenezinde kısa ve uzun kodlamayan RNA'ların rolü
The role of short and long non-coding RNAS in food allergy pathogenesis
HÜLYA ERBOĞA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Allerji ve İmmünolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA BİRBEN
- Helicobacter pylori izolatlarında klaritromisin direncini ve cagA geni varlığını birlikte belirleyecek bir ?eş-zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu? (real-time PCR) yönteminin geliştirilmesi
Development of a simultaneous detection of the clarithromycin resistance and the cagA gene status by“real-time polymerase chain reaction”in helicobacter pylori isolates
PEREN HATİCE BAĞLAN
- Adıyaman ilinde koroner arter hastalığının erken tanısında kandaki uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA'lar) (MEG3, malat1, MIAT, MCM3AP-AS1): Erken biyobelirteç olabilir mi?
In The Early Diagnosis of Coronary Artery Disease at Adıyaman Province, The Long Non-coding RNAs in the Blood (MEG3, MALAT1, MIAT, MCM3AP-AS1): Could It Be Early Biomarkers?
HAMİDE SAYGILI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
GenetikAdıyaman ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYDAR BAĞIŞ
