The effects of different dietary interventions and ageing on DNA methylation levels of SIRT1 in the brain of mammary tumour mouse model
Farklı şekillerdeki diyet uygulamalarının meme tümörü fare modelinin beynindeki SIRT1 DNA metilasyonu üzerindeki etkisi
- Tez No: 772491
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BİLGE GÜVENÇ TUNA, PROF. DR. SONER DOĞAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Sirtuin 1 (SIRT1), gen anlatımı, yaşam süresinin belirlenmesi, stres yanıtı ve apoptoz gibi belirli hücresel süreçlerde hücresel homeostazı koruyan bir NAD+ bağımlı deasetilazdır. Kalori kısıtlaması (KK) gibi diyet müdahaleleri SIRT1 aktivitesini modüle eder ve memelilerde yaş ve metabolizma hızında artışa neden olur. SIRT1, yaşlanma sırasında kötüleşen nörolojik süreçlerin korunmasında olumlu etkiye sahiptir. Bu çalışmanın amacı farklı şekillerde uygulanan kalori kısıtlamasının ve yaşlanmanın fare beynindeki Sirt1 DNA metilasyonu üzerindeki etkisini araştırmaktır. Yaşlanma ve diyet müdahalelerine bağlı Sirt1 gen metilasyonunu araştırmak için 10 haftalık dişi C57BL/6 fareler, ad libitum, sürekli kalori kısıtlaması(SKK) (AL grubuna kıyasla yüzde 15 kalori kısıtlaması) veya aralıklı kalori kısıtlaması (AKK) (döngüsel bir şekilde üç haftalık AL ve AL grubuna kıyasla bir hafta yüzde 60 kalori kısıtlaması) ile beslendi. Pyrosequencing tekniği farelerin beyinlerinden izole edilen DNA'lardaki Sirt1 metilasyon seviyelerini ölçmek için kullanıldı. Sirt1 mRNA ekspresyonu, RT-PCR ile ölçülürken, protein seviyeleri western-blot ile karşılaştırıldı. Sirt1 gen ve protein ekspresyonunda ve DNA metilasyon seviyesinde yaşlanmaya bağlı olarak istatiksel olarak anlamlı bir fark gözlemlenmedi. Farklı kalori kısıtlaması uygulanan gruplar arasındaki Sirt1 ekspresyonu ve DNA metilasyon seviyelerinde değişiklik tespit edilmedi. DNA metilasyon seviyesi ile Sirt1 mRNA ekspresyonu arasında istatiksel olarak anlamlı negatif bir korelasyon bulundu. Bu sonuçlar, yaşlanma ile hücrelerde SIRT1 miktarındaki azalmanın proteomik seviyedeki düzenlemelere veya diğer epigenetik mekanizmalara bağlı olabileceğini düşündürmektedir. DNA metilasyonu, diyet ve yaştan bağımsız olarak Sirt1 ekspresyonu üzerinde düzenleyici bir etkiye sahiptir.
Özet (Çeviri)
Sirtuin 1 (SIRT1) is a NAD+-dependent deacetylase that maintains cell homeostasis by playing an important role in cellular processes, such as gene transcription, stress reaction and apoptosis. Dietary interventions such as calorie restriction (CR) modulates SIRT1 activity and that leads to increment in healthspan and lifespan in many organisms. The preservation of brain functions that decline with ageing is positively impacted by SIRT1. The aim of this study was understanding the biological link between DNA methylation of Sirt1 and effects of different types of dietary interventions and a causal role of ageing in mice brain. To investigate Sirt1 gene methylation due to ageing and CR, 10 weeks old female C57BL/6 mice were fed ad libitum (AL), with chronic calorie restriction (CCR) (15% CR ) or intermittent calorie restriction (ICR) (three weeks of AL followed by one week 60% CR in a cyclic manner). Pyrosequencing was performed to examine the methylation levels of Sirt1 from brain homogenates and understand the underlying mechanisms of CCR and ICR in relation to ageing at the genomic level. Western-blot was used to determine protein expression levels whereas RT-PCR was used to determine Sirt1 mRNA levels. We could not find any significant difference in expression and DNA methylation levels of Sirt1 with ageing. Also, the diet-associated mRNA and protein expression levels and DNA methylation changes of Sirt1 were not obtained. A significant negative correlation was observed between DNA methylation levels and mRNA/protein expression of Sirt1. In addition, a statistically significant positive correlation was found between protein expression and mRNA expression. These findings indicate that decrease of SIRT1 by ageing might be regulated at the proteomic levels or with other epigenetic mechanisms. DNA methylation has a regulative effect on Sirt1 expression regardless of diet and age.
Benzer Tezler
- Impact of the inflammatory process in the aging brain: Evidence from in vitro and ex vivo models
Yaşlanan beyinde inflamasyon sürecinin etkisi: In vıtro ve ex vıvo modellerinden elde edilen kanıtlar
SERENA SEVDİYE AKTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MICHELLE MARIE ADAMS
- Effects of aging, diet and potential genetic interventions on the levels of SMURF2 and its interacting partners in zebrafish (danio rerio) brain
Zebrabalığı (danio rerio) beyninde yaşlanma, diyet ve olası genetik müdahalelerin SMURF2 ve etkileşim ortaklarının ifadesine etkileri
MELEK UMAY TÜZ ŞAŞİK
Doktora
İngilizce
2020
Nörolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MICHELLE MARIE ADAMS
- Huzurevi yaşlılarında fiziksel aktivite ve aralıklı beslenme uygulamalarının sağlıklı yaşlanma süreçlerine etkisi
The effect of physical activity and intermittent fasting on healthy aging in elderly residents of a nursing home
HÜSNİYE BİLGE SERTDEMİR
Doktora
Türkçe
2023
FizyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SALİH KAYA
- Bakım verenlere yönelik beslenme eğitiminin evde sağlık hizmeti alan yaşlılarda beslenme durumu üzerine etkisi
The effect of nutrition education for caregivers on nutritional status of elderly receiving home care
ÇAĞDAŞ SALİH MERİÇ
Doktora
Türkçe
2022
Beslenme ve DiyetetikAnkara ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURCAN YABANCI AYHAN
- Investigation of the effects of different online nutrition counseling interventions on weight control
Farklı online beslenme danışmanlığı müdahelelerinin kilo kontrolü üzerindeki etkisinin araştırılması
EZGİ MISIRLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Beslenme ve DiyetetikYeditepe ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İREM KAYA CEBİOĞLU