Molecular diagnoses of the resistance of genes in Staphylococcus aureus to antibiotics in the diabetic foot infections
Diyabetik ayak enfeksiyonlarında Staphylococcus aureus'taki genlerin antibiyotiklere direncinin moleküler tanıları
- Tez No: 774421
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK, PROF. DR. NAWFAL HUSSAİN ALDUJAILI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 99
Özet
Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) Irak'ta önemli bir hastane içi patojendir ve toplumda ve hastanede ortaya çıkmaktadır. Dört aylık bir süre boyunca toplam 132 örnek işlendi (1 Ocak 2022-30 Nisan 2022). S. aureus, geleneksel biyokimyasal testler kullanılarak tanımlandı ve tespit edilen koagülaz geni ile doğrulandı. MRSA izolatları, referans standart olarak metisilin direnç geni (mecA) saptama testi kullanılarak yedi geleneksel fenotipik yöntemle karakterize edildi. B-laktamaz üretimini tanımlamak için altı fenotipik yöntem kullanıldı. İzole MRSA yedi yöntemle antibiyotik duyarlılık testlerine tabi tutuldu. MRSA izolatları, multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile stafilokok kromozom kaset metisilin direncine (SKKmec) tabi tutuldu. Panton-Valentine lökosidin (pvl) ve toksik şok sendromu toksin (tşst) genlerinin varlığı monoplex PCR ile test edildi. S. aureus'un toplam izolasyon oranı çeşitli örnekler arasında 17 (%12,87) izolatlar. mecA, 4 (% 23,52) izolatlar (MRSA) tanındı. Sefoksitin disk difüzyon, kromojenik tahlilleri dahil olmak üzere, beslenme yöntemleri MRSA tespit için son derece etkili oldu. Her iki MRSA suşu tarafından oluşturulan biyofilm, bu suşların hastane ortamlarında devam etme kabiliyetinin yüksek olduğunu gösterir ve bu da hastanede yatan hastalarda hastalık gelişme riskini artırır. Ek olarak, biyofilm oluşturan izolatlardaki antimikrobiyallere karşı direnç, kronik enfeksiyonlara ve tedavi sorunlarına yol açabilecek bakteri kalıcılığına katkıda bulunur.
Özet (Çeviri)
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a major nosocomial pathogen in Iraq and is emerging in the community and hospital. A total of 132 specimens were processed over a period of four months (1 January 2022-30 April 2022). S. aureus was identified using traditional biochemical tests and confirmed by the detected coagulase gene. MRSA isolates were characterized by seven conventional phenotypic methods using the methicillin resistance gene (mecA) detection test as a reference standard. Six phenotypic methods were used to identify β-lactamase production. The isolated MRSA were subjected to antibiotic susceptibility tests by seven methods. The MRSA isolates were subjected to staphylococcal chromosome cassette methicillin-resistance (SCCmec), by multiplex polymerase chain reaction (PCR). The presence of Panton-Valentine leucocidin (pvl) and toxic shock syndrome toxin (tst) genes was tested by monoplex PCR. The overall isolation rate of S. aureus was 17 (12.87%) isolates among various specimens. The mecA was recognized in 4 (23.52%) isolates (MRSA). Phenotypic methods including cefoxitin disc diffusion, chromogenic assay was highly effective for detecting MRSA. Biofilm forming by both MRSA strains indicates the high ability of these strains to persist in hospital environments which increases the risk of disease development in hospitalized patients. Additionally, resistance to antimicrobials in biofilm-forming isolates contribute to bacterial persistence which may lead to chronic infections and treatment problems.
Benzer Tezler
- Molecular study of the biofilm formation associated with methicillin-resistance of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples
Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus'un metisiline direnci ile ilişkili biyofilm oluşumunun moleküler çalışması
MUSTAFA SAHIB ABS ABS
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IRMAK POLAT
PROF. DR. HASANAİN KHALEEL IBRAHİM SHAREEF
- Molecular study of virulence factors and bioformatic of Staphylococcus aureus isolated from pregnant women suffering from urinary tract infection in Iraqi population
Irak popülasyonunda idrar yolu enfeksiyonu çeken hamile kadınlardan izole edilen Staphylococcus aureus'un virülans faktörü ve biyoformatiğinin moleküler çalışması
ZINAH RADHI SAEED HAMDAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER
DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED SALİM MOHAMMED
- Isolation and diagnosis of staphylococcus aureus and detection of some virulence genes using pcr technique depending on the specific primers
Sbesifik primerlerde bağlı olarak pcr tekniği kullanılarak staphylococcus aureus izolasyonu ve teşhisi ve bazı virolans genlerinin tespiti
ASAAD EYADA HUSSAIN AAL-ALI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATİH KARAYÜREK
- Farklı klinik örneklerden izole edilen metikline dirençli staphylococcus aureus (MRSA) suşlarında pvl toksinin moleküler çalışması ve tespiti
Molecular study and detection of pvl toxin in methicllin resistant staphylococcus aureus (MRSA) strains isolated from different clinical samples
SAFAULDEEN ABDULKAREEM MOUSA MOUSA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA KARAHAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAİNAB MOHAMMAD NSAIF
- Metisilin dirençli Staphylococcus aureus' un etken olduğu diyabetik ayak enfeksiyonlu hastalarda nazal mrsa taşıyıcılığının moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of methicillin resistant S.aureus carriage among the patients with diabetic foot infection by using molecular diagnostic methods background-objective
ÇİĞDEM ÖZAYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiDüzce ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. TEVFİK YAVUZ