Kolorektal kanser etyopatogenezinde TNF süper ailesi 4 ile ilişkili mikroRNAların araştırması
Investigation of TNF superfamily 4 associated microRNAs in colorectal cancer etiopathogenesis
- Tez No: 783629
- Danışmanlar: PROF. DR. İLHAN YAYLIM
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Moleküler Tıp, Biochemistry, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Kolorektal Kanser, OX40/OX40L, Triptofan, Kinürenin, Kinürenik Asit, mikroRNA, Etyopatogenez, Kolorektal neoplazmlar, Mikro RNA, Neoplazmlar, Tümör nekroz faktörleri, Colorectal Cancer, OX40/OX40L, Tryptophan, Kynurenine, Kynurenic Acid, Etiopathogenesis, Colorectal neoplasms, Micro RNA, Neoplasms, Tumor necrosis factors
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Tıp Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanser üzerine yapılan araştırmalarda tümör hücreleri transkripsiyon, translasyon ve sinyal transdüksiyonlarının kontrolü ile immün sistemden kaçış mekanizmaları geliştirdikleri kanıtlanmıştır. Bu nedenle yeni immün teröpatik hedeflerin belirlenmesi için, bağışıklık hücrelerinde, tümör mikro çevresinde ve metabolizmasında gerçekleşen değişiklikleri ve bunların regülasyonu birlikte araştırılmalıdır. Bizde çalışmamızda kolorektal kanserlerde, immün kontrol noktalarından OX40/OX40L ve OX40L'I hedefleyen miR-138-5p ile miR-181a-5p arasındaki ilişki ile IDO-1'I hedefleyen miR-153-3p'nin triptofan, kinurenin ve kinurenik asit üzerine etkisini araştırmayı hedefledik. Bu kapsamda kolon, polip ve kontrol gruplarına ait plazmalarda miR-138-5p, miR-181a-5p ve miR-153-3p ekpresyon seviyelerine kantitatif gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPZR) ile triptofan, kinurenin ve kinürenik asit düzeylerine yüksek performanslı sıvı kromotografisi (HPLC) ve sOX40/sOX40L seviyeline ise Enzim bağlı immünosorbent deneyi (ELİSA) yöntemi ile belirlenmiştir. Elde edilen bulgulara göre Gruplar arasında miR-138-5p, miR-181a-5p ve miR-153-3p ekspresyon düzeyleri incelendiğinde miR-138-5p anlamlı bir fark bulunamamışken miR-181a-5p ve miR-153-3p ekspresyonları istatistiksel olarak anlamlıdır (sırasıyla p=0,089; p=0,047, p=0,0021). Ayrıca HPLC analizi sonucu triptofan seviyesi gruplar kendi içinde incelenmiş olup, istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p=0,006). KRK'li hastalara ait KYN ve KYNU düzeyleri yükseldikçe ile miR-138-5p, miR153-3p ve miR-181a-5p ifadeleri arttıkça tümör yarıçapında anlamlı artış gözlemlenmiştir (KYN; p=0,0002, KYNU; p<0,0001, miR-138-5p; p<0,0001, miR153-3p; p=0,0001, miR-181a-5p; p=0,0136). Ek olarak sOX40L düzeyinin yukarı-regülasyonu sonucu tümör çapı anlamlı bir şekilde azalma tespit edilmiştir (p=0,0003). Ayrıca tümör agresifliğiyle pozitif orantılı olan KYNA seviyesi ileri evre hastalarda erken evre hastalara nazaran anlamlı şekilde yüksektir (p=0,038).
Özet (Çeviri)
In research on colorectal cancer, it has been proven that tumor cells develop escape mechanisms from the immune system by the control of transcription, translation and signal transductions. Therefore, changes in immune cells, tumor microenvironment and metabolism and their regulation should be investigated together to identify new immune therapeutic targets. In our study, we aimed the effect of relationship between miR-138-5p targeting OX40/OX40L and OX40L and miR-181a-5p and miR-153-3p targeting IDO-1 on tryptophan, kynurenine and kynurenic acid in colorectal cancers. In this context, the expression levels of miR-138-5p, miR-181a-5p and miR-153-3p in plasmas of colon, polyp and control groups were determined by quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), tryptophan, kynurenine and kynurenic acid levels were determined by high performance liquid chromatography (HPLC) and sOX40/sOX40L levels were determined by Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) method. According to the findings, when the expression levels of miR-138-5p, miR-181a-5p and miR-153-3p were examined between the groups, no significant difference was found for miR-138-5p, while the expressions of miR-181a-5p and miR-153-3p were statistically significant. (p=0.089, p=0.047, p=0.0021, respectively). In addition, tryptophan level was statistically significant between the groups as a result of HPLC analysis (p=0.006). As KYN and KYNU levels of patients with KRK increased and miR-138-5p, miR153-3p and miR-181a-5p expressions increased, a significant increase was observed in tumor radius ( KYN; p=0.0002, KYNU; p<0.0001, miR-138-5p; p<0.0001, miR153-3p; p=0.0001, miR-181a-5p; p=0.0136). In addition, a significant reduction in tumor diameter was detected as a result of up-regulation of sOX40L level (p=0.0003). In addition, CGNA level, which is positively correlated with tumor aggressiveness, is significantly higher in advanced patients than in early stage patients (p=0.038).
Benzer Tezler
- Kolorektal kanserlerde serum hepatit b x-etkileşimli protein (HBXIP) düzeylerinin tanısal değerinin incelenmesi
Investigation of the diagnostic value of serum hepatitis b x-interactive protein (HBXIP) level in colorectal cancer
FARUK YAZICI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Genel CerrahiSağlık BakanlığıGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERHAT TOKGÖZ
- Mide ve kolorektal kanserli hastalarda p16, MDMd2 gen polimorfizmlerinin incelenmesi
Investigation of p16, MDM2 gene polymorphisms in gastric and colorectal cancer patients
GÜLAY TUNA
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN YAYLIM ERALTAN
- Kolorektal adenokarsinomlarda SOCS 1 gen polimorfizmi analizi ve SOCS 1 ekspresyonu ile ilişkisi
SOÇS 1 gene polymorphism analysis and relationship with SOCS 1 expression in colorectal adenocarcinoma
TALAT AYYILDIZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
GastroenterolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENVER DOLAR
- The role of endoscopic biliary sphincterotomy in the development of colorectal neoplasm
Kolorektal neoplazm gelişiminde endoskopik biliyer sfinkterotomi'nin rolü
NURI MUSAYEV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
İç HastalıklarıOndokuz Mayıs Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEYTULLAH YILDIRIM